79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5129 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5129  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4616  hypothetical protein  39.2 
 
 		 192 aa  105  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0252967  hitchhiker  0.00238598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7774  hypothetical protein  39.31 
 
 		 189 aa  97.4  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2411  hypothetical protein  49.49 
 
 		 187 aa  94.4  8e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1581  hypothetical protein  39.08 
 
 		 187 aa  91.3  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.345604 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0323  protein of unknown function DUF1470  36.87 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5293  protein of unknown function DUF1470  36.44 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0577  hypothetical protein  35.2 
 
 		 191 aa  74.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3946  hypothetical protein  36.97 
 
 		 175 aa  73.6  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.839426  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0917  protein of unknown function DUF1470  30.41 
 
 		 182 aa  70.9  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.782251  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24720  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  39.42 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0451  protein of unknown function DUF1470  36.15 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8299  hypothetical protein  34.86 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4402  protein of unknown function DUF1470  35.42 
 
 		 183 aa  67  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1136  hypothetical protein  32.61 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1119  hypothetical protein  32.61 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3685  protein of unknown function DUF1470  39.45 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3999  protein of unknown function DUF1470  34.58 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1148  hypothetical protein  33.97 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4227  hypothetical protein  36.15 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4664  hypothetical protein  36.46 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2901  hypothetical protein  36.28 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0544322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4963  hypothetical protein  32.6 
 
 		 183 aa  62  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4103  hypothetical protein  37.25 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2309  protein of unknown function DUF1470  34.95 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1443  hypothetical protein  30.43 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197682  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1406  protein of unknown function DUF1470  38.14 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0606124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3877  protein of unknown function DUF1470  38.71 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000164809 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1178  hypothetical protein  36.79 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1791  hypothetical protein  32.56 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3432  protein of unknown function DUF1470  35 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2620  protein of unknown function DUF1470  33.33 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000174145  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4291  protein of unknown function DUF1470  47.06 
 
 		 166 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6164  hypothetical protein  34.43 
 
 		 195 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16944  hitchhiker  0.00195303 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0954  hypothetical protein  34.78 
 
 		 184 aa  51.6  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2338  hypothetical protein  31.33 
 
 		 182 aa  51.2  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1030  hypothetical protein  36.99 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.962986  normal  0.138179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7704  protein of unknown function DUF1470  30.65 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6780  protein of unknown function DUF1470  48 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1905  protein of unknown function DUF1470  34.83 
 
 		 172 aa  49.3  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05465  hypothetical protein  36.63 
 
 		 199 aa  48.9  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889335  normal  0.0895575 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2347  protein of unknown function DUF1470  33.65 
 
 		 171 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0559  protein of unknown function DUF1470  40 
 
 		 197 aa  48.5  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8439  protein of unknown function DUF1470  43.14 
 
 		 190 aa  48.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275326 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3480  protein of unknown function DUF1470  38.98 
 
 		 193 aa  47.8  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5759  hypothetical protein  27.52 
 
 		 178 aa  47.8  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2145  protein of unknown function DUF1470  42.31 
 
 		 184 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2691  protein of unknown function DUF1470  44 
 
 		 194 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4083  protein of unknown function DUF1470  25.96 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1455  protein of unknown function DUF1470  30.46 
 
 		 206 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3324  hypothetical protein  37.29 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9282  hypothetical protein  28.68 
 
 		 183 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2691  protein of unknown function DUF1470  29.45 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21490  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  45.45 
 
 		 262 aa  45.4  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0408  hypothetical protein  28.44 
 
 		 195 aa  45.1  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.630736  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11890  Protein of unknown function (DUF1470)  25.35 
 
 		 200 aa  45.1  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0341  hypothetical protein  28.44 
 
 		 204 aa  45.1  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1908  protein of unknown function DUF1470  45.45 
 
 		 208 aa  44.7  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.975753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4029  hypothetical protein  32.64 
 
 		 205 aa  44.7  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4029  hypothetical protein  39.22 
 
 		 192 aa  44.7  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462167  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5828  hypothetical protein  35.38 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2288  protein of unknown function DUF1470  33.33 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.741376 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1894  hypothetical protein  36.67 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4842  protein of unknown function DUF1470  37.5 
 
 		 216 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4823  protein of unknown function DUF1470  39.58 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3746  protein of unknown function DUF1470  39.58 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0177  hypothetical protein  42.22 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7176  protein of unknown function DUF1470  30.14 
 
 		 210 aa  42.4  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2428  hypothetical protein  37.74 
 
 		 185 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1541  hypothetical protein  32.31 
 
 		 186 aa  42  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0656289  normal  0.28934 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5519  hypothetical protein  34.43 
 
 		 219 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5342  hypothetical protein  34.43 
 
 		 219 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74312  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4814  protein of unknown function DUF1470  27.72 
 
 		 179 aa  42.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6461  hypothetical protein  38.6 
 
 		 210 aa  42  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0507888  normal  0.43229 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4753  hypothetical protein  33.61 
 
 		 211 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1923  protein of unknown function DUF1470  40 
 
 		 200 aa  41.6  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5391  hypothetical protein  40 
 
 		 220 aa  41.2  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421091  normal  0.322257 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2131  hypothetical protein  30.67 
 
 		 181 aa  41.2  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4844  hypothetical protein  40 
 
 		 215 aa  41.2  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10336  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>