63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2901 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2901  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  350  8e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0544322  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8299  hypothetical protein  70.52 
 
 
181 aa  250  8.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3685  protein of unknown function DUF1470  54.17 
 
 
183 aa  184  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7704  protein of unknown function DUF1470  47.22 
 
 
216 aa  156  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3946  hypothetical protein  47.43 
 
 
175 aa  154  8e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.839426  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4402  protein of unknown function DUF1470  45.3 
 
 
183 aa  136  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5759  hypothetical protein  43.37 
 
 
178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0341  hypothetical protein  40.36 
 
 
204 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0408  hypothetical protein  39.16 
 
 
195 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.630736  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4616  hypothetical protein  38.21 
 
 
192 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0252967  hitchhiker  0.00238598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7774  hypothetical protein  35.29 
 
 
189 aa  94.7  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1581  hypothetical protein  41.13 
 
 
187 aa  92.8  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.345604 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4103  hypothetical protein  37.5 
 
 
180 aa  92.4  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0451  protein of unknown function DUF1470  36.87 
 
 
177 aa  92  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5293  protein of unknown function DUF1470  33.12 
 
 
183 aa  84.7  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2309  protein of unknown function DUF1470  33.14 
 
 
189 aa  84.7  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0917  protein of unknown function DUF1470  33.54 
 
 
182 aa  84  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.782251  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1791  hypothetical protein  32 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3999  protein of unknown function DUF1470  37.38 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4083  protein of unknown function DUF1470  37.42 
 
 
169 aa  82.4  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3877  protein of unknown function DUF1470  36.65 
 
 
181 aa  80.9  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000164809 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1178  hypothetical protein  36 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2620  protein of unknown function DUF1470  36.49 
 
 
186 aa  77.4  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000174145  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1406  protein of unknown function DUF1470  35.78 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0606124  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4790  protein of unknown function DUF1470  35.85 
 
 
172 aa  73.9  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0437563  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4338  hypothetical protein  38.41 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.938729  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4664  hypothetical protein  31.06 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1148  hypothetical protein  32.24 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24720  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  36.36 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0577  hypothetical protein  34.65 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6164  hypothetical protein  33.58 
 
 
195 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16944  hitchhiker  0.00195303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4227  hypothetical protein  32.74 
 
 
186 aa  72  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1136  hypothetical protein  32.24 
 
 
184 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1119  hypothetical protein  32.24 
 
 
184 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4814  protein of unknown function DUF1470  31.52 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0323  protein of unknown function DUF1470  32.26 
 
 
187 aa  70.9  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2411  hypothetical protein  30.85 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1443  hypothetical protein  31.43 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197682  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2347  protein of unknown function DUF1470  38.61 
 
 
171 aa  68.2  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3432  protein of unknown function DUF1470  36.22 
 
 
174 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4963  hypothetical protein  30.86 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241292  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2338  hypothetical protein  32.67 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2288  protein of unknown function DUF1470  33.96 
 
 
164 aa  62.4  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.741376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5129  hypothetical protein  33.9 
 
 
183 aa  54.3  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116478  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5018  hypothetical protein  32.41 
 
 
194 aa  51.6  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.212987 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11890  Protein of unknown function (DUF1470)  32.43 
 
 
200 aa  51.6  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0559  protein of unknown function DUF1470  33.71 
 
 
197 aa  50.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2691  protein of unknown function DUF1470  28.41 
 
 
194 aa  50.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0883  hypothetical protein  34.35 
 
 
214 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.275571 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3480  protein of unknown function DUF1470  30.66 
 
 
193 aa  48.1  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1905  protein of unknown function DUF1470  34 
 
 
172 aa  48.1  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2145  protein of unknown function DUF1470  37.04 
 
 
184 aa  47.4  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1923  protein of unknown function DUF1470  31.71 
 
 
200 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3324  hypothetical protein  30.23 
 
 
193 aa  47  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1455  protein of unknown function DUF1470  28.11 
 
 
206 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4029  hypothetical protein  35.29 
 
 
192 aa  45.1  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462167  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1908  protein of unknown function DUF1470  28.76 
 
 
208 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.975753  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5519  hypothetical protein  30 
 
 
219 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5342  hypothetical protein  30 
 
 
219 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74312  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0139  hypothetical protein  33.33 
 
 
206 aa  41.6  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.772126  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0177  hypothetical protein  28.91 
 
 
190 aa  41.6  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1215  hypothetical protein  27.44 
 
 
207 aa  41.2  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.759773  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5828  hypothetical protein  30.23 
 
 
190 aa  41.2  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>