56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2288 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2288  protein of unknown function DUF1470  100 
 
 
164 aa  325  1.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.741376 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4083  protein of unknown function DUF1470  54.14 
 
 
169 aa  163  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4790  protein of unknown function DUF1470  53.38 
 
 
172 aa  153  9e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0437563  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4814  protein of unknown function DUF1470  49.7 
 
 
179 aa  130  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11890  Protein of unknown function (DUF1470)  45.45 
 
 
200 aa  91.7  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3432  protein of unknown function DUF1470  42.86 
 
 
174 aa  87  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1905  protein of unknown function DUF1470  45.22 
 
 
172 aa  85.5  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4616  hypothetical protein  33.33 
 
 
192 aa  84.3  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0252967  hitchhiker  0.00238598 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0451  protein of unknown function DUF1470  40.44 
 
 
177 aa  79.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1581  hypothetical protein  40.25 
 
 
187 aa  77  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.345604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7774  hypothetical protein  38.85 
 
 
189 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2309  protein of unknown function DUF1470  31.58 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0577  hypothetical protein  30.06 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3685  protein of unknown function DUF1470  34.36 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8299  hypothetical protein  34.5 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1791  hypothetical protein  38.83 
 
 
180 aa  68.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1178  hypothetical protein  35.62 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3999  protein of unknown function DUF1470  31.14 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2347  protein of unknown function DUF1470  37.07 
 
 
171 aa  67.8  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2620  protein of unknown function DUF1470  36.89 
 
 
186 aa  67.8  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000174145  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5293  protein of unknown function DUF1470  36 
 
 
183 aa  67.8  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0323  protein of unknown function DUF1470  41 
 
 
187 aa  67  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4103  hypothetical protein  32.24 
 
 
180 aa  67  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2411  hypothetical protein  36 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7704  protein of unknown function DUF1470  34.35 
 
 
216 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4402  protein of unknown function DUF1470  37.37 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24720  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  37.11 
 
 
181 aa  65.9  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2338  hypothetical protein  34.55 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2901  hypothetical protein  37.86 
 
 
175 aa  63.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0544322  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3946  hypothetical protein  34.16 
 
 
175 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.839426  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3877  protein of unknown function DUF1470  31.65 
 
 
181 aa  62  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000164809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6164  hypothetical protein  39.37 
 
 
195 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16944  hitchhiker  0.00195303 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0917  protein of unknown function DUF1470  33.55 
 
 
182 aa  60.8  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.782251  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5759  hypothetical protein  29.22 
 
 
178 aa  57.4  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5018  hypothetical protein  36.09 
 
 
194 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.212987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4338  hypothetical protein  41.76 
 
 
182 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.938729  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1119  hypothetical protein  29.03 
 
 
184 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1136  hypothetical protein  29.03 
 
 
184 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1148  hypothetical protein  29.03 
 
 
184 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1923  protein of unknown function DUF1470  38.52 
 
 
200 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1406  protein of unknown function DUF1470  33.33 
 
 
183 aa  53.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0606124  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0341  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4227  hypothetical protein  35.64 
 
 
186 aa  52.4  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0408  hypothetical protein  33.33 
 
 
195 aa  52  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.630736  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1443  hypothetical protein  29.61 
 
 
183 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197682  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4664  hypothetical protein  31.67 
 
 
181 aa  51.2  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8439  protein of unknown function DUF1470  40.26 
 
 
190 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.275326 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4963  hypothetical protein  28.29 
 
 
183 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241292  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5067  hypothetical protein  44.78 
 
 
200 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0954  hypothetical protein  50 
 
 
184 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1464  hypothetical protein  50 
 
 
205 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5129  hypothetical protein  33.33 
 
 
183 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116478  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0559  protein of unknown function DUF1470  38.46 
 
 
197 aa  42.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2397  protein of unknown function DUF1470  45 
 
 
191 aa  41.6  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.776458  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26800  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  36 
 
 
175 aa  41.2  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1076  protein of unknown function DUF1470  35.29 
 
 
177 aa  41.2  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0563895  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>