77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1581 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1581  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  376  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.345604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7774  hypothetical protein  68.98 
 
 
189 aa  248  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4616  hypothetical protein  64.17 
 
 
192 aa  247  7e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0252967  hitchhiker  0.00238598 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0323  protein of unknown function DUF1470  46.52 
 
 
187 aa  155  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2411  hypothetical protein  40.1 
 
 
187 aa  124  6e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8299  hypothetical protein  40.29 
 
 
181 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7704  protein of unknown function DUF1470  38.71 
 
 
216 aa  102  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0577  hypothetical protein  35.75 
 
 
191 aa  99  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3946  hypothetical protein  40.67 
 
 
175 aa  99  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.839426  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3685  protein of unknown function DUF1470  35.8 
 
 
183 aa  97.8  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2901  hypothetical protein  42.98 
 
 
175 aa  97.1  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0544322  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0451  protein of unknown function DUF1470  34.41 
 
 
177 aa  94.7  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4103  hypothetical protein  36.17 
 
 
180 aa  92.8  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3432  protein of unknown function DUF1470  37.63 
 
 
174 aa  92.4  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1791  hypothetical protein  42.52 
 
 
180 aa  92  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0917  protein of unknown function DUF1470  43.64 
 
 
182 aa  90.9  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.782251  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5293  protein of unknown function DUF1470  41.98 
 
 
183 aa  89  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11890  Protein of unknown function (DUF1470)  41.43 
 
 
200 aa  89  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2620  protein of unknown function DUF1470  39.04 
 
 
186 aa  89  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000174145  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1406  protein of unknown function DUF1470  41.6 
 
 
183 aa  88.6  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0606124  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1178  hypothetical protein  34.83 
 
 
182 aa  87  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4402  protein of unknown function DUF1470  39.2 
 
 
183 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5129  hypothetical protein  40.34 
 
 
183 aa  84.7  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116478  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3877  protein of unknown function DUF1470  34.46 
 
 
181 aa  84.7  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000164809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6164  hypothetical protein  41.48 
 
 
195 aa  83.2  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16944  hitchhiker  0.00195303 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24720  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  37.58 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2288  protein of unknown function DUF1470  38.18 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.741376 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3999  protein of unknown function DUF1470  37.01 
 
 
187 aa  81.3  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2309  protein of unknown function DUF1470  42.34 
 
 
189 aa  79  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0408  hypothetical protein  32.77 
 
 
195 aa  79  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.630736  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2347  protein of unknown function DUF1470  46.6 
 
 
171 aa  79  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0341  hypothetical protein  38.41 
 
 
204 aa  77.8  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1148  hypothetical protein  35.57 
 
 
184 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1119  hypothetical protein  35.05 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1136  hypothetical protein  35.05 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5759  hypothetical protein  35.78 
 
 
178 aa  74.3  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4083  protein of unknown function DUF1470  37.29 
 
 
169 aa  73.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4227  hypothetical protein  37.3 
 
 
186 aa  72.4  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1443  hypothetical protein  43.36 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197682  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4814  protein of unknown function DUF1470  38.66 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4790  protein of unknown function DUF1470  32.37 
 
 
172 aa  71.2  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0437563  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2338  hypothetical protein  34.24 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4664  hypothetical protein  39.09 
 
 
181 aa  71.2  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4963  hypothetical protein  40.71 
 
 
183 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241292  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1905  protein of unknown function DUF1470  32.77 
 
 
172 aa  67.8  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4029  hypothetical protein  52.94 
 
 
192 aa  57.8  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462167  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4338  hypothetical protein  37.86 
 
 
182 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.938729  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4291  protein of unknown function DUF1470  56.82 
 
 
166 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0954  hypothetical protein  32.48 
 
 
184 aa  49.3  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2145  protein of unknown function DUF1470  46.38 
 
 
184 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5067  hypothetical protein  49.06 
 
 
200 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1923  protein of unknown function DUF1470  47.17 
 
 
200 aa  48.1  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8439  protein of unknown function DUF1470  40.28 
 
 
190 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.275326 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3285  hypothetical protein  35.71 
 
 
212 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0319342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5018  hypothetical protein  36.36 
 
 
194 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.212987 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4029  hypothetical protein  31.16 
 
 
205 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2691  protein of unknown function DUF1470  51.11 
 
 
194 aa  45.1  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3480  protein of unknown function DUF1470  39.66 
 
 
193 aa  45.1  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3324  hypothetical protein  39.66 
 
 
193 aa  43.9  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5828  hypothetical protein  40.38 
 
 
190 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1030  hypothetical protein  51.16 
 
 
176 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.962986  normal  0.138179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1908  protein of unknown function DUF1470  46.51 
 
 
208 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.975753  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4753  hypothetical protein  34.83 
 
 
211 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268906  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6461  hypothetical protein  42.11 
 
 
210 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0507888  normal  0.43229 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7176  protein of unknown function DUF1470  42.11 
 
 
210 aa  43.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5519  hypothetical protein  34.83 
 
 
219 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3191  hypothetical protein  30.06 
 
 
204 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0489705  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5342  hypothetical protein  34.83 
 
 
219 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74312  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0177  hypothetical protein  40.68 
 
 
190 aa  42.4  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0559  protein of unknown function DUF1470  37.97 
 
 
197 aa  42.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1894  hypothetical protein  39.66 
 
 
191 aa  42  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4842  protein of unknown function DUF1470  45.45 
 
 
216 aa  41.6  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2488  protein of unknown function DUF1470  46.51 
 
 
196 aa  41.6  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3074  hypothetical protein  28.83 
 
 
204 aa  41.6  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.368693 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0139  hypothetical protein  40.91 
 
 
206 aa  41.2  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.772126  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3746  protein of unknown function DUF1470  29.91 
 
 
192 aa  40.8  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10286  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4823  protein of unknown function DUF1470  29.91 
 
 
192 aa  40.8  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>