118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3746 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4823  protein of unknown function DUF1470  100 
 
 		 192 aa  394  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3746  protein of unknown function DUF1470  100 
 
 		 192 aa  394  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10286  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05465  hypothetical protein  74.05 
 
 		 199 aa  271  6e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889335  normal  0.0895575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47200  hypothetical protein  57.38 
 
 		 195 aa  205  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1894  hypothetical protein  37.84 
 
 		 191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0177  hypothetical protein  38.42 
 
 		 190 aa  122  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3480  protein of unknown function DUF1470  35.33 
 
 		 193 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3324  hypothetical protein  35.87 
 
 		 193 aa  115  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6461  hypothetical protein  40.8 
 
 		 210 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0507888  normal  0.43229 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1455  protein of unknown function DUF1470  39.39 
 
 		 206 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7176  protein of unknown function DUF1470  38.1 
 
 		 210 aa  98.2  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4029  hypothetical protein  38.74 
 
 		 205 aa  98.2  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0998  hypothetical protein  34.04 
 
 		 194 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2691  protein of unknown function DUF1470  32.81 
 
 		 206 aa  85.9  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4308  hypothetical protein  31.38 
 
 		 194 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2560  protein of unknown function DUF1470  39.9 
 
 		 202 aa  84.7  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.306373 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1123  hypothetical protein  31.61 
 
 		 194 aa  84.3  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0894  hypothetical protein  31.44 
 
 		 194 aa  84.3  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0870  hypothetical protein  31.61 
 
 		 194 aa  84.3  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0926819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0853  hypothetical protein  31.44 
 
 		 194 aa  84.3  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0952  hypothetical protein  31.44 
 
 		 194 aa  84.3  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1036  hypothetical protein  31.44 
 
 		 194 aa  84.3  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.26369e-21 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4029  hypothetical protein  37.99 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462167  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1215  hypothetical protein  37 
 
 		 207 aa  81.3  0.000000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.759773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9196  protein of unknown function DUF1470  34.24 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4335  hypothetical protein  33.14 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6614  protein of unknown function DUF1470  32.54 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2523  hypothetical protein  29.29 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0715162  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3136  hypothetical protein  29.29 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.833927  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0954  hypothetical protein  30.6 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5828  hypothetical protein  30.23 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6487  hypothetical protein  29.8 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3191  hypothetical protein  31.25 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0489705  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2691  protein of unknown function DUF1470  32.56 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3074  hypothetical protein  30 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.368693 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1541  hypothetical protein  26.97 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0656289  normal  0.28934 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0883  hypothetical protein  31.41 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.275571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1908  protein of unknown function DUF1470  31.85 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.975753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3071  hypothetical protein  29.14 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1454  protein of unknown function DUF1470  32.62 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4291  protein of unknown function DUF1470  45.28 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3152  hypothetical protein  28.43 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.111962 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1406  protein of unknown function DUF1470  26.14 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0606124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5144  protein of unknown function DUF1470  31.22 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.478399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0559  protein of unknown function DUF1470  33.33 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2338  hypothetical protein  29.31 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1923  protein of unknown function DUF1470  28.32 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1030  hypothetical protein  52.08 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.962986  normal  0.138179 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4849  hypothetical protein  26.67 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2309  protein of unknown function DUF1470  30.39 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8439  protein of unknown function DUF1470  40 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275326 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1464  hypothetical protein  26.84 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0861  protein of unknown function DUF1470  47.73 
 
 		 179 aa  51.6  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0214303  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1921  protein of unknown function DUF1470  34.67 
 
 		 186 aa  52  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000367455  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2145  protein of unknown function DUF1470  40 
 
 		 184 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2488  protein of unknown function DUF1470  36 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4664  hypothetical protein  32.61 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0220  hypothetical protein  30.39 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646093 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0139  hypothetical protein  30.89 
 
 		 206 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.772126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0212  hypothetical protein  30.85 
 
 		 226 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4844  hypothetical protein  25.77 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6780  protein of unknown function DUF1470  39.58 
 
 		 155 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1731  protein of unknown function DUF1470  43.64 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4616  hypothetical protein  31.73 
 
 		 192 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0252967  hitchhiker  0.00238598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9282  hypothetical protein  37.93 
 
 		 183 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3165  hypothetical protein  23.91 
 
 		 182 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.294475  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3415  hypothetical protein  23.91 
 
 		 182 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2428  hypothetical protein  37.88 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5018  hypothetical protein  28.49 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.212987 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4227  hypothetical protein  32.71 
 
 		 186 aa  48.9  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3385  hypothetical protein  23.91 
 
 		 180 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2620  protein of unknown function DUF1470  27.38 
 
 		 186 aa  48.5  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000174145  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26800  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  28.57 
 
 		 175 aa  48.1  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3285  hypothetical protein  30.83 
 
 		 212 aa  48.1  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0319342 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4753  hypothetical protein  36.51 
 
 		 211 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4842  protein of unknown function DUF1470  31.3 
 
 		 216 aa  48.1  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0464  protein of unknown function DUF1470  28.9 
 
 		 177 aa  47.8  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1119  hypothetical protein  31 
 
 		 184 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1136  hypothetical protein  31 
 
 		 184 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1148  hypothetical protein  31 
 
 		 184 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3459  protein of unknown function DUF1470  39.19 
 
 		 211 aa  48.1  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3523  protein of unknown function DUF1470  39.19 
 
 		 211 aa  47.8  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.550991  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3650  hypothetical protein  33.02 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.242781  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1443  hypothetical protein  29.41 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4963  hypothetical protein  29.41 
 
 		 183 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0777  hypothetical protein  38.46 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.25881 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1178  hypothetical protein  27.17 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5618  protein of unknown function DUF1470  25.98 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.201097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8299  hypothetical protein  28.17 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5293  protein of unknown function DUF1470  32.67 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3149  hypothetical protein  23.91 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000197101  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2411  hypothetical protein  28.18 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5342  hypothetical protein  30.58 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74312  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4103  hypothetical protein  27.62 
 
 		 180 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5519  hypothetical protein  30.58 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1862  hypothetical protein  23.37 
 
 		 180 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1076  protein of unknown function DUF1470  43.18 
 
 		 177 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0563895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5067  hypothetical protein  38.1 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0917  protein of unknown function DUF1470  28.02 
 
 		 182 aa  45.4  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.782251  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5391  hypothetical protein  38.89 
 
 		 220 aa  45.1  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421091  normal  0.322257 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>