96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6780 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6780  protein of unknown function DUF1470  100 
 
 		 155 aa  306  5e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1921  protein of unknown function DUF1470  36.78 
 
 		 186 aa  92  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000367455  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1541  hypothetical protein  34.5 
 
 		 186 aa  87.8  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0656289  normal  0.28934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2145  protein of unknown function DUF1470  35.43 
 
 		 184 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2691  protein of unknown function DUF1470  32.62 
 
 		 194 aa  70.5  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9282  hypothetical protein  49.3 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1073  hypothetical protein  30.19 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00265826 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2428  hypothetical protein  33.13 
 
 		 185 aa  64.3  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2338  hypothetical protein  31.21 
 
 		 182 aa  63.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4291  protein of unknown function DUF1470  35.54 
 
 		 166 aa  60.5  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8439  protein of unknown function DUF1470  30 
 
 		 190 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275326 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0777  hypothetical protein  42.53 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.25881 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3071  hypothetical protein  31.76 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4335  hypothetical protein  29.88 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27110  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  31.06 
 
 		 174 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.902416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0559  protein of unknown function DUF1470  46.97 
 
 		 197 aa  53.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1731  protein of unknown function DUF1470  44.9 
 
 		 185 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2309  protein of unknown function DUF1470  48.98 
 
 		 189 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1908  protein of unknown function DUF1470  38.46 
 
 		 208 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.975753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1081  protein of unknown function DUF1470  46.97 
 
 		 181 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8882  hitchhiker  0.000010734 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1178  hypothetical protein  39.71 
 
 		 182 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47200  hypothetical protein  35.82 
 
 		 195 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1455  protein of unknown function DUF1470  41.94 
 
 		 206 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1406  protein of unknown function DUF1470  32.61 
 
 		 183 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0606124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1226  protein of unknown function DUF1470  45.16 
 
 		 181 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142417 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5828  hypothetical protein  37.5 
 
 		 190 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2411  hypothetical protein  55.56 
 
 		 187 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24720  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  44.59 
 
 		 181 aa  51.2  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0954  hypothetical protein  29.48 
 
 		 184 aa  51.2  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8299  hypothetical protein  38.89 
 
 		 181 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4823  protein of unknown function DUF1470  39.58 
 
 		 192 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3746  protein of unknown function DUF1470  39.58 
 
 		 192 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1923  protein of unknown function DUF1470  45.83 
 
 		 200 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5067  hypothetical protein  43.75 
 
 		 200 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0177  hypothetical protein  28.33 
 
 		 190 aa  48.9  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2488  protein of unknown function DUF1470  48.84 
 
 		 196 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5129  hypothetical protein  48 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1119  hypothetical protein  43.75 
 
 		 184 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2620  protein of unknown function DUF1470  28.83 
 
 		 186 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000174145  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4842  protein of unknown function DUF1470  38.46 
 
 		 216 aa  48.9  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1136  hypothetical protein  43.75 
 
 		 184 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1148  hypothetical protein  43.75 
 
 		 184 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4849  hypothetical protein  31.65 
 
 		 167 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1443  hypothetical protein  42.19 
 
 		 183 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1894  hypothetical protein  35.48 
 
 		 191 aa  47.4  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1464  hypothetical protein  32.46 
 
 		 205 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4963  hypothetical protein  40.62 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241292  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05465  hypothetical protein  37.14 
 
 		 199 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889335  normal  0.0895575 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7704  protein of unknown function DUF1470  34.57 
 
 		 216 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4308  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1036  hypothetical protein  27.82 
 
 		 194 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.26369e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0894  hypothetical protein  27.82 
 
 		 194 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0853  hypothetical protein  27.82 
 
 		 194 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0952  hypothetical protein  27.82 
 
 		 194 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3650  hypothetical protein  43.33 
 
 		 210 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.242781  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4844  hypothetical protein  48.44 
 
 		 215 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1123  hypothetical protein  27.82 
 
 		 194 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0883  hypothetical protein  38.71 
 
 		 214 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.275571 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0451  protein of unknown function DUF1470  37.04 
 
 		 177 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5391  hypothetical protein  48.44 
 
 		 220 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421091  normal  0.322257 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6461  hypothetical protein  33.87 
 
 		 210 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0507888  normal  0.43229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1030  hypothetical protein  52.63 
 
 		 176 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.962986  normal  0.138179 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0139  hypothetical protein  48.44 
 
 		 206 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.772126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5018  hypothetical protein  38.16 
 
 		 194 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.212987 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21490  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  38.3 
 
 		 262 aa  44.3  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4753  hypothetical protein  48.44 
 
 		 211 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3480  protein of unknown function DUF1470  36.92 
 
 		 193 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3324  hypothetical protein  36.92 
 
 		 193 aa  44.3  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2325  hypothetical protein  44.44 
 
 		 198 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0998  hypothetical protein  34.12 
 
 		 194 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0870  hypothetical protein  27.34 
 
 		 194 aa  43.9  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0926819  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4029  hypothetical protein  36.07 
 
 		 205 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5144  protein of unknown function DUF1470  41.38 
 
 		 203 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.478399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2691  protein of unknown function DUF1470  36.36 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3376  hypothetical protein  30.23 
 
 		 211 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5342  hypothetical protein  51.35 
 
 		 219 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74312  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0440  protein of unknown function DUF1470  31.25 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.635634  normal  0.841182 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0861  protein of unknown function DUF1470  41.86 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0214303  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5519  hypothetical protein  51.35 
 
 		 219 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3285  hypothetical protein  46.88 
 
 		 212 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0319342 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4029  hypothetical protein  41.86 
 
 		 192 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462167  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1076  protein of unknown function DUF1470  44.19 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0563895  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2901  hypothetical protein  33.82 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0544322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7176  protein of unknown function DUF1470  36.07 
 
 		 210 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2131  hypothetical protein  24.4 
 
 		 181 aa  42.4  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3523  protein of unknown function DUF1470  39.34 
 
 		 211 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.550991  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3459  protein of unknown function DUF1470  39.34 
 
 		 211 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4103  hypothetical protein  39.13 
 
 		 180 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0577  hypothetical protein  37.88 
 
 		 191 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5591  protein of unknown function DUF1470  31.48 
 
 		 210 aa  41.2  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.166159  normal  0.646492 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3059  hypothetical protein  38.89 
 
 		 182 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000109347  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3877  protein of unknown function DUF1470  45.71 
 
 		 181 aa  40.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000164809 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26800  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  40.91 
 
 		 175 aa  40.4  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3363  hypothetical protein  38.89 
 
 		 180 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3390  hypothetical protein  39.62 
 
 		 180 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388743  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3386  hypothetical protein  38.89 
 
 		 182 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0643797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>