120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1073 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1073  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00265826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2145  protein of unknown function DUF1470  48.47 
 
 
184 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1921  protein of unknown function DUF1470  36.64 
 
 
186 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000367455  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1541  hypothetical protein  32.6 
 
 
186 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0656289  normal  0.28934 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2428  hypothetical protein  33.48 
 
 
185 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9282  hypothetical protein  31.25 
 
 
183 aa  88.6  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3071  hypothetical protein  32.46 
 
 
210 aa  87  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2691  protein of unknown function DUF1470  33.05 
 
 
194 aa  84  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4291  protein of unknown function DUF1470  48.61 
 
 
166 aa  75.9  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8439  protein of unknown function DUF1470  46.15 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.275326 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2131  hypothetical protein  32.8 
 
 
181 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6780  protein of unknown function DUF1470  40.21 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3165  hypothetical protein  29.84 
 
 
182 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.294475  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3415  hypothetical protein  29.84 
 
 
182 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3385  hypothetical protein  29.84 
 
 
180 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3386  hypothetical protein  29.03 
 
 
182 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0643797  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1862  hypothetical protein  28.23 
 
 
180 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3390  hypothetical protein  29.03 
 
 
180 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388743  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3149  hypothetical protein  29.03 
 
 
182 aa  62.4  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000197101  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0777  hypothetical protein  53.85 
 
 
186 aa  62  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.25881 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1226  protein of unknown function DUF1470  57.69 
 
 
181 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142417 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1081  protein of unknown function DUF1470  58.82 
 
 
181 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8882  hitchhiker  0.000010734 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3363  hypothetical protein  28.7 
 
 
180 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5342  hypothetical protein  57.45 
 
 
219 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74312  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5519  hypothetical protein  57.45 
 
 
219 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4753  hypothetical protein  56.25 
 
 
211 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268906  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3059  hypothetical protein  31.07 
 
 
182 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000109347  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0139  hypothetical protein  57.45 
 
 
206 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.772126  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4844  hypothetical protein  57.45 
 
 
215 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10336  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27110  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  36.45 
 
 
174 aa  58.5  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.902416  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5391  hypothetical protein  56.52 
 
 
220 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421091  normal  0.322257 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47200  hypothetical protein  38.46 
 
 
195 aa  57  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3285  hypothetical protein  54.35 
 
 
212 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0319342 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1455  protein of unknown function DUF1470  38.75 
 
 
206 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3480  protein of unknown function DUF1470  34.94 
 
 
193 aa  56.6  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2338  hypothetical protein  46.51 
 
 
182 aa  55.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3324  hypothetical protein  34.07 
 
 
193 aa  55.1  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7704  protein of unknown function DUF1470  35.25 
 
 
216 aa  55.1  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1923  protein of unknown function DUF1470  46.81 
 
 
200 aa  55.1  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5067  hypothetical protein  44.9 
 
 
200 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0451  protein of unknown function DUF1470  35.06 
 
 
177 aa  55.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4335  hypothetical protein  40.54 
 
 
178 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5828  hypothetical protein  48 
 
 
190 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1731  protein of unknown function DUF1470  29.37 
 
 
185 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4842  protein of unknown function DUF1470  38.78 
 
 
216 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0954  hypothetical protein  47.73 
 
 
184 aa  53.5  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2309  protein of unknown function DUF1470  28.34 
 
 
189 aa  53.1  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0559  protein of unknown function DUF1470  47.73 
 
 
197 aa  52.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1076  protein of unknown function DUF1470  53.49 
 
 
177 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0563895  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1406  protein of unknown function DUF1470  47.83 
 
 
183 aa  52  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0606124  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4849  hypothetical protein  48.89 
 
 
167 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0883  hypothetical protein  45.65 
 
 
214 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.275571 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4029  hypothetical protein  33.96 
 
 
192 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462167  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0220  hypothetical protein  47.06 
 
 
219 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646093 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6461  hypothetical protein  30.91 
 
 
210 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0507888  normal  0.43229 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1178  hypothetical protein  34.25 
 
 
182 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3273  hypothetical protein  52.17 
 
 
223 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0212  hypothetical protein  50 
 
 
226 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1791  hypothetical protein  34.88 
 
 
180 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1464  hypothetical protein  47.73 
 
 
205 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2397  protein of unknown function DUF1470  39.6 
 
 
191 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.776458  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2488  protein of unknown function DUF1470  40.35 
 
 
196 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3999  protein of unknown function DUF1470  48.21 
 
 
187 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05465  hypothetical protein  45.1 
 
 
199 aa  50.1  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889335  normal  0.0895575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1119  hypothetical protein  43.48 
 
 
184 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1136  hypothetical protein  43.48 
 
 
184 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1148  hypothetical protein  43.48 
 
 
184 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4823  protein of unknown function DUF1470  45.28 
 
 
192 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21490  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  42.22 
 
 
262 aa  50.4  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3746  protein of unknown function DUF1470  45.28 
 
 
192 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10286  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3946  hypothetical protein  48.98 
 
 
175 aa  49.3  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.839426  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3459  protein of unknown function DUF1470  31.03 
 
 
211 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8299  hypothetical protein  47.92 
 
 
181 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0870  hypothetical protein  36.84 
 
 
194 aa  48.9  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0926819  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3376  hypothetical protein  40 
 
 
211 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4963  hypothetical protein  43.48 
 
 
183 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241292  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6487  hypothetical protein  43.18 
 
 
204 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3191  hypothetical protein  42.22 
 
 
204 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0489705  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1443  hypothetical protein  42.03 
 
 
183 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197682  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3074  hypothetical protein  44.44 
 
 
204 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.368693 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7176  protein of unknown function DUF1470  33.85 
 
 
210 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5144  protein of unknown function DUF1470  45.83 
 
 
203 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.478399  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4029  hypothetical protein  33.33 
 
 
205 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0177  hypothetical protein  46.67 
 
 
190 aa  47  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5129  hypothetical protein  44 
 
 
183 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116478  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3650  hypothetical protein  51.06 
 
 
210 aa  47  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.242781  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1894  hypothetical protein  44.44 
 
 
191 aa  47  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2325  hypothetical protein  43.18 
 
 
198 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3152  hypothetical protein  42.22 
 
 
204 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.111962 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3523  protein of unknown function DUF1470  40 
 
 
211 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.550991  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2691  protein of unknown function DUF1470  33.77 
 
 
206 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1581  hypothetical protein  42.03 
 
 
187 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.345604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1030  hypothetical protein  45.65 
 
 
176 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.962986  normal  0.138179 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0998  hypothetical protein  42 
 
 
194 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4308  hypothetical protein  40 
 
 
194 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5591  protein of unknown function DUF1470  38.78 
 
 
210 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.166159  normal  0.646492 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0894  hypothetical protein  42 
 
 
194 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0853  hypothetical protein  42 
 
 
194 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1123  hypothetical protein  42 
 
 
194 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1036  hypothetical protein  42 
 
 
194 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.26369e-21 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>