100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2309 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2309  protein of unknown function DUF1470  100 
 
 		 189 aa  387  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4103  hypothetical protein  46.96 
 
 		 180 aa  170  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1148  hypothetical protein  49.46 
 
 		 184 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1136  hypothetical protein  49.46 
 
 		 184 aa  161  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1119  hypothetical protein  49.46 
 
 		 184 aa  161  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1443  hypothetical protein  48.63 
 
 		 183 aa  156  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4963  hypothetical protein  46.74 
 
 		 183 aa  152  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1406  protein of unknown function DUF1470  44.26 
 
 		 183 aa  145  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0606124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3877  protein of unknown function DUF1470  42.11 
 
 		 181 aa  142  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000164809 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5293  protein of unknown function DUF1470  46.74 
 
 		 183 aa  140  9e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1791  hypothetical protein  43.89 
 
 		 180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4664  hypothetical protein  45.61 
 
 		 181 aa  138  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4227  hypothetical protein  42.54 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0917  protein of unknown function DUF1470  41.53 
 
 		 182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.782251  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3999  protein of unknown function DUF1470  42.22 
 
 		 187 aa  128  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2620  protein of unknown function DUF1470  41.04 
 
 		 186 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000174145  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24720  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  41.9 
 
 		 181 aa  128  6e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2338  hypothetical protein  35.84 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1178  hypothetical protein  33.92 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8299  hypothetical protein  39.55 
 
 		 181 aa  87.8  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0451  protein of unknown function DUF1470  37.79 
 
 		 177 aa  87  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3946  hypothetical protein  33.16 
 
 		 175 aa  84.3  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.839426  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3432  protein of unknown function DUF1470  41.07 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7704  protein of unknown function DUF1470  34.66 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1581  hypothetical protein  43 
 
 		 187 aa  77.8  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.345604 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2901  hypothetical protein  36.45 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0544322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0577  hypothetical protein  34.29 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3685  protein of unknown function DUF1470  32.92 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4616  hypothetical protein  38.17 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0252967  hitchhiker  0.00238598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7774  hypothetical protein  41.84 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4814  protein of unknown function DUF1470  32.58 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6164  hypothetical protein  34.91 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16944  hitchhiker  0.00195303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5759  hypothetical protein  37 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2411  hypothetical protein  38.32 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1905  protein of unknown function DUF1470  31.25 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21490  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  61.36 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2288  protein of unknown function DUF1470  31.21 
 
 		 164 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.741376 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0408  hypothetical protein  39.62 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.630736  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4402  protein of unknown function DUF1470  32.14 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2347  protein of unknown function DUF1470  31.95 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4790  protein of unknown function DUF1470  37.8 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0437563  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11890  Protein of unknown function (DUF1470)  30.85 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0341  hypothetical protein  40.86 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1923  protein of unknown function DUF1470  37.38 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4083  protein of unknown function DUF1470  29.37 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5067  hypothetical protein  34.85 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0323  protein of unknown function DUF1470  35.71 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5018  hypothetical protein  28.09 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.212987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2145  protein of unknown function DUF1470  44.12 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8439  protein of unknown function DUF1470  39.53 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5129  hypothetical protein  31.68 
 
 		 183 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0559  protein of unknown function DUF1470  37.86 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3480  protein of unknown function DUF1470  26.56 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4291  protein of unknown function DUF1470  46.67 
 
 		 166 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1908  protein of unknown function DUF1470  31.71 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.975753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5828  hypothetical protein  31.86 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6780  protein of unknown function DUF1470  48.98 
 
 		 155 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1541  hypothetical protein  28.57 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0656289  normal  0.28934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2488  protein of unknown function DUF1470  38.37 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2325  hypothetical protein  35.11 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3324  hypothetical protein  41.38 
 
 		 193 aa  51.6  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1894  hypothetical protein  42.37 
 
 		 191 aa  51.2  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0954  hypothetical protein  30.77 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0177  hypothetical protein  37.7 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4842  protein of unknown function DUF1470  47.73 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1921  protein of unknown function DUF1470  25.6 
 
 		 186 aa  49.3  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000367455  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4753  hypothetical protein  28.46 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7176  protein of unknown function DUF1470  35.21 
 
 		 210 aa  47.8  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6461  hypothetical protein  30 
 
 		 210 aa  47.8  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0507888  normal  0.43229 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3746  protein of unknown function DUF1470  41.67 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4029  hypothetical protein  36.92 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462167  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4823  protein of unknown function DUF1470  41.67 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1455  protein of unknown function DUF1470  36.36 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0139  hypothetical protein  43.14 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.772126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5519  hypothetical protein  28.46 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2691  protein of unknown function DUF1470  35.29 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2428  hypothetical protein  31.46 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5342  hypothetical protein  28.46 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74312  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4844  hypothetical protein  45.1 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5391  hypothetical protein  45.1 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421091  normal  0.322257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1030  hypothetical protein  38.98 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.962986  normal  0.138179 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47200  hypothetical protein  28.33 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1076  protein of unknown function DUF1470  37.18 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0563895  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1073  hypothetical protein  51.22 
 
 		 233 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00265826 
 
 
-
 
NC_003296  RS05465  hypothetical protein  33.94 
 
 		 199 aa  45.4  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889335  normal  0.0895575 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4335  hypothetical protein  30.49 
 
 		 178 aa  45.1  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4029  hypothetical protein  27.45 
 
 		 205 aa  45.1  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3285  hypothetical protein  45.1 
 
 		 212 aa  44.7  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0319342 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2560  protein of unknown function DUF1470  27.59 
 
 		 202 aa  44.7  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.306373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9282  hypothetical protein  29.05 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0861  protein of unknown function DUF1470  44.44 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0214303  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6487  hypothetical protein  38.6 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1215  hypothetical protein  32.08 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.759773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3136  hypothetical protein  38.6 
 
 		 204 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.833927  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2523  hypothetical protein  38.6 
 
 		 204 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0715162  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4308  hypothetical protein  23.08 
 
 		 194 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3152  hypothetical protein  38.6 
 
 		 204 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.111962 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1731  protein of unknown function DUF1470  26.45 
 
 		 185 aa  42  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2691  protein of unknown function DUF1470  33.8 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3191  hypothetical protein  36.84 
 
 		 204 aa  41.2  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0489705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>