60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3432 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3432  protein of unknown function DUF1470  100 
 
 		 174 aa  352  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11890  Protein of unknown function (DUF1470)  44.62 
 
 		 200 aa  100  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1905  protein of unknown function DUF1470  38.73 
 
 		 172 aa  97.1  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0451  protein of unknown function DUF1470  35.39 
 
 		 177 aa  94.4  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4814  protein of unknown function DUF1470  37.7 
 
 		 179 aa  92.8  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1581  hypothetical protein  41.67 
 
 		 187 aa  89.4  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.345604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7774  hypothetical protein  40.32 
 
 		 189 aa  89  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3946  hypothetical protein  42.06 
 
 		 175 aa  87.4  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.839426  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4616  hypothetical protein  35.26 
 
 		 192 aa  86.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0252967  hitchhiker  0.00238598 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0917  protein of unknown function DUF1470  44.12 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.782251  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8299  hypothetical protein  37.57 
 
 		 181 aa  82  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2288  protein of unknown function DUF1470  42.28 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.741376 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4083  protein of unknown function DUF1470  35.43 
 
 		 169 aa  80.9  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2309  protein of unknown function DUF1470  41.07 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1178  hypothetical protein  34.71 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4790  protein of unknown function DUF1470  35.54 
 
 		 172 aa  77.4  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0437563  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1148  hypothetical protein  41.32 
 
 		 184 aa  77.4  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1119  hypothetical protein  41.32 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1136  hypothetical protein  41.32 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4227  hypothetical protein  42.24 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4103  hypothetical protein  38.53 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1443  hypothetical protein  41.18 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2620  protein of unknown function DUF1470  42.34 
 
 		 186 aa  72  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000174145  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4402  protein of unknown function DUF1470  35.59 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1791  hypothetical protein  40 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4963  hypothetical protein  33.73 
 
 		 183 aa  70.9  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2338  hypothetical protein  31.43 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7704  protein of unknown function DUF1470  39.5 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5759  hypothetical protein  32.95 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5293  protein of unknown function DUF1470  36.21 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4664  hypothetical protein  38.26 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0577  hypothetical protein  30.08 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6164  hypothetical protein  42.5 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16944  hitchhiker  0.00195303 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1406  protein of unknown function DUF1470  36.97 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0606124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24720  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  34.27 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2901  hypothetical protein  36.73 
 
 		 175 aa  63.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0544322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3877  protein of unknown function DUF1470  38.14 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000164809 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0341  hypothetical protein  33.33 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2347  protein of unknown function DUF1470  40.82 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3999  protein of unknown function DUF1470  35.35 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0408  hypothetical protein  36.84 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.630736  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3685  protein of unknown function DUF1470  38.54 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0323  protein of unknown function DUF1470  46.84 
 
 		 187 aa  57  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1030  hypothetical protein  39 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.962986  normal  0.138179 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2411  hypothetical protein  32.03 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1923  protein of unknown function DUF1470  53.06 
 
 		 200 aa  52  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5129  hypothetical protein  32.48 
 
 		 183 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0954  hypothetical protein  33.05 
 
 		 184 aa  47.8  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4338  hypothetical protein  30.9 
 
 		 182 aa  47.8  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.938729  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4029  hypothetical protein  44.44 
 
 		 192 aa  47.4  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462167  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1908  protein of unknown function DUF1470  30.06 
 
 		 208 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.975753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5018  hypothetical protein  53.49 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.212987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2488  protein of unknown function DUF1470  48.84 
 
 		 196 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5067  hypothetical protein  53.06 
 
 		 200 aa  44.3  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4842  protein of unknown function DUF1470  46.67 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8439  protein of unknown function DUF1470  45.83 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275326 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7176  protein of unknown function DUF1470  29.37 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0559  protein of unknown function DUF1470  53.49 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0177  hypothetical protein  37.78 
 
 		 190 aa  42  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4291  protein of unknown function DUF1470  47.73 
 
 		 166 aa  41.2  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>