59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7774 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7774  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  381  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4616  hypothetical protein  58.73 
 
 
192 aa  219  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0252967  hitchhiker  0.00238598 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1581  hypothetical protein  68.98 
 
 
187 aa  217  7e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.345604 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0323  protein of unknown function DUF1470  46.6 
 
 
187 aa  145  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2411  hypothetical protein  38.17 
 
 
187 aa  115  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7704  protein of unknown function DUF1470  36.56 
 
 
216 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8299  hypothetical protein  39.55 
 
 
181 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24720  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  39.36 
 
 
181 aa  93.6  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0577  hypothetical protein  36.05 
 
 
191 aa  93.6  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4103  hypothetical protein  37.04 
 
 
180 aa  92.4  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5293  protein of unknown function DUF1470  37.68 
 
 
183 aa  91.3  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1178  hypothetical protein  44.92 
 
 
182 aa  89.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3685  protein of unknown function DUF1470  34.09 
 
 
183 aa  90.1  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2901  hypothetical protein  40.87 
 
 
175 aa  89.4  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0544322  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3432  protein of unknown function DUF1470  40.32 
 
 
174 aa  89  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0451  protein of unknown function DUF1470  33.86 
 
 
177 aa  88.2  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1406  protein of unknown function DUF1470  36.88 
 
 
183 aa  88.2  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0606124  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0917  protein of unknown function DUF1470  36.43 
 
 
182 aa  86.3  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.782251  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1791  hypothetical protein  40 
 
 
180 aa  85.5  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2620  protein of unknown function DUF1470  37.93 
 
 
186 aa  84  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000174145  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3999  protein of unknown function DUF1470  33.87 
 
 
187 aa  84  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5129  hypothetical protein  39.31 
 
 
183 aa  83.2  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116478  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3946  hypothetical protein  37.12 
 
 
175 aa  82  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.839426  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4402  protein of unknown function DUF1470  37.3 
 
 
183 aa  82  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3877  protein of unknown function DUF1470  41.38 
 
 
181 aa  79.3  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000164809 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4227  hypothetical protein  37.68 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1148  hypothetical protein  32.98 
 
 
184 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1119  hypothetical protein  32.98 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1136  hypothetical protein  32.98 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4790  protein of unknown function DUF1470  34.83 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0437563  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0341  hypothetical protein  31.65 
 
 
204 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4664  hypothetical protein  37.21 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4083  protein of unknown function DUF1470  38.66 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0408  hypothetical protein  30.18 
 
 
195 aa  74.3  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.630736  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11890  Protein of unknown function (DUF1470)  39.02 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2338  hypothetical protein  34.07 
 
 
182 aa  73.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2309  protein of unknown function DUF1470  41.84 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2288  protein of unknown function DUF1470  38.76 
 
 
164 aa  72  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.741376 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5759  hypothetical protein  34.43 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4963  hypothetical protein  31.38 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241292  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1443  hypothetical protein  35 
 
 
183 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197682  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6164  hypothetical protein  39.67 
 
 
195 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16944  hitchhiker  0.00195303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2347  protein of unknown function DUF1470  35.37 
 
 
171 aa  65.1  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4814  protein of unknown function DUF1470  36.22 
 
 
179 aa  64.3  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1905  protein of unknown function DUF1470  32.57 
 
 
172 aa  57.8  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4338  hypothetical protein  37.93 
 
 
182 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.938729  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5018  hypothetical protein  36.26 
 
 
194 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.212987 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4029  hypothetical protein  45.28 
 
 
192 aa  51.6  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462167  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2488  protein of unknown function DUF1470  40 
 
 
196 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0954  hypothetical protein  32.21 
 
 
184 aa  45.4  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8439  protein of unknown function DUF1470  35.53 
 
 
190 aa  44.7  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.275326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5067  hypothetical protein  43.33 
 
 
200 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4291  protein of unknown function DUF1470  48.84 
 
 
166 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2145  protein of unknown function DUF1470  48.84 
 
 
184 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1923  protein of unknown function DUF1470  43.14 
 
 
200 aa  41.6  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5828  hypothetical protein  28.57 
 
 
190 aa  41.2  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3285  hypothetical protein  31.96 
 
 
212 aa  41.2  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0319342 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4844  hypothetical protein  32.29 
 
 
215 aa  41.2  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10336  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4753  hypothetical protein  28.57 
 
 
211 aa  41.2  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268906  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>