70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3999 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3999  protein of unknown function DUF1470  100 
 
 		 187 aa  376  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1791  hypothetical protein  57.63 
 
 		 180 aa  192  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4103  hypothetical protein  51.69 
 
 		 180 aa  171  7.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1406  protein of unknown function DUF1470  52.22 
 
 		 183 aa  170  9e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0606124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24720  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  49.17 
 
 		 181 aa  163  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4664  hypothetical protein  47.65 
 
 		 181 aa  151  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3877  protein of unknown function DUF1470  49.1 
 
 		 181 aa  147  8e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000164809 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5293  protein of unknown function DUF1470  47.8 
 
 		 183 aa  145  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4227  hypothetical protein  48.02 
 
 		 186 aa  142  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0917  protein of unknown function DUF1470  43.41 
 
 		 182 aa  135  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.782251  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2309  protein of unknown function DUF1470  42.22 
 
 		 189 aa  128  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1443  hypothetical protein  42.31 
 
 		 183 aa  121  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1119  hypothetical protein  41.99 
 
 		 184 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1136  hypothetical protein  41.99 
 
 		 184 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1148  hypothetical protein  41.76 
 
 		 184 aa  118  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4963  hypothetical protein  40.66 
 
 		 183 aa  117  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2620  protein of unknown function DUF1470  36.99 
 
 		 186 aa  99  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000174145  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1178  hypothetical protein  35.67 
 
 		 182 aa  85.5  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4616  hypothetical protein  35.56 
 
 		 192 aa  85.5  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0252967  hitchhiker  0.00238598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7774  hypothetical protein  33.87 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2901  hypothetical protein  37.38 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0544322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8299  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3946  hypothetical protein  35.38 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.839426  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0451  protein of unknown function DUF1470  38.32 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7704  protein of unknown function DUF1470  33.33 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1581  hypothetical protein  40 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.345604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6164  hypothetical protein  35 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16944  hitchhiker  0.00195303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0577  hypothetical protein  38 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5759  hypothetical protein  28.57 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2338  hypothetical protein  29.48 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2411  hypothetical protein  35.58 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2347  protein of unknown function DUF1470  31.67 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4790  protein of unknown function DUF1470  36.17 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0437563  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4402  protein of unknown function DUF1470  36.27 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4814  protein of unknown function DUF1470  40 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3685  protein of unknown function DUF1470  31.48 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4083  protein of unknown function DUF1470  31.79 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11890  Protein of unknown function (DUF1470)  29.79 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3432  protein of unknown function DUF1470  35.35 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5129  hypothetical protein  34.58 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0323  protein of unknown function DUF1470  33.02 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2288  protein of unknown function DUF1470  29.03 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.741376 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0408  hypothetical protein  27.27 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.630736  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0341  hypothetical protein  28.42 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1905  protein of unknown function DUF1470  32.46 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4029  hypothetical protein  28.57 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462167  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5067  hypothetical protein  30.25 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8439  protein of unknown function DUF1470  35.29 
 
 		 190 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2145  protein of unknown function DUF1470  50 
 
 		 184 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4338  hypothetical protein  35.09 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.938729  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2691  protein of unknown function DUF1470  26.62 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2428  hypothetical protein  31.97 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4842  protein of unknown function DUF1470  52.27 
 
 		 216 aa  45.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1894  hypothetical protein  32.67 
 
 		 191 aa  45.8  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2325  hypothetical protein  28.99 
 
 		 198 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6461  hypothetical protein  35.38 
 
 		 210 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0507888  normal  0.43229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5018  hypothetical protein  27.98 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.212987 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0559  protein of unknown function DUF1470  30.93 
 
 		 197 aa  45.1  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0954  hypothetical protein  30.41 
 
 		 184 aa  45.1  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21490  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  48.84 
 
 		 262 aa  44.3  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1455  protein of unknown function DUF1470  28.71 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5828  hypothetical protein  32.56 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3480  protein of unknown function DUF1470  31.75 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3324  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05465  hypothetical protein  31.47 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889335  normal  0.0895575 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1073  hypothetical protein  45.83 
 
 		 233 aa  42.4  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00265826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1030  hypothetical protein  34.92 
 
 		 176 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.962986  normal  0.138179 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4335  hypothetical protein  25.3 
 
 		 178 aa  42  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1076  protein of unknown function DUF1470  33.33 
 
 		 177 aa  42  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0563895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1923  protein of unknown function DUF1470  26.54 
 
 		 200 aa  41.2  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>