85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4227 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4227  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  376  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4664  hypothetical protein  89.94 
 
 		 181 aa  312  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5293  protein of unknown function DUF1470  57.69 
 
 		 183 aa  194  8.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24720  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  55.37 
 
 		 181 aa  179  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4103  hypothetical protein  50 
 
 		 180 aa  171  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0917  protein of unknown function DUF1470  49.72 
 
 		 182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.782251  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1406  protein of unknown function DUF1470  47.25 
 
 		 183 aa  160  9e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0606124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1148  hypothetical protein  50 
 
 		 184 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1119  hypothetical protein  50 
 
 		 184 aa  158  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1136  hypothetical protein  50 
 
 		 184 aa  158  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1443  hypothetical protein  48.62 
 
 		 183 aa  157  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3999  protein of unknown function DUF1470  48.02 
 
 		 187 aa  155  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4963  hypothetical protein  48.07 
 
 		 183 aa  155  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1791  hypothetical protein  47.22 
 
 		 180 aa  155  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3877  protein of unknown function DUF1470  46.47 
 
 		 181 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000164809 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2309  protein of unknown function DUF1470  42.54 
 
 		 189 aa  142  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2620  protein of unknown function DUF1470  44.51 
 
 		 186 aa  132  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000174145  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1178  hypothetical protein  37.87 
 
 		 182 aa  101  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2338  hypothetical protein  34.88 
 
 		 182 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4616  hypothetical protein  38.85 
 
 		 192 aa  90.5  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0252967  hitchhiker  0.00238598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7774  hypothetical protein  37.68 
 
 		 189 aa  87  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8299  hypothetical protein  36.64 
 
 		 181 aa  82  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3432  protein of unknown function DUF1470  42.24 
 
 		 174 aa  80.5  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3946  hypothetical protein  35.07 
 
 		 175 aa  79.7  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.839426  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2901  hypothetical protein  37.5 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0544322  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1581  hypothetical protein  42.86 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.345604 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3685  protein of unknown function DUF1470  35.22 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7704  protein of unknown function DUF1470  32.35 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5759  hypothetical protein  28.75 
 
 		 178 aa  71.2  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0577  hypothetical protein  32.33 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11890  Protein of unknown function (DUF1470)  30.41 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0451  protein of unknown function DUF1470  37.86 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4402  protein of unknown function DUF1470  31.58 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6164  hypothetical protein  34.15 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16944  hitchhiker  0.00195303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5129  hypothetical protein  38.53 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0341  hypothetical protein  27.61 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4814  protein of unknown function DUF1470  34.58 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21490  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  42.15 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2411  hypothetical protein  27.13 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4083  protein of unknown function DUF1470  32.38 
 
 		 169 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1030  hypothetical protein  46.88 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.962986  normal  0.138179 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1905  protein of unknown function DUF1470  34.23 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0323  protein of unknown function DUF1470  32.02 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0408  hypothetical protein  26.61 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.630736  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2347  protein of unknown function DUF1470  34.69 
 
 		 171 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5018  hypothetical protein  29.19 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.212987 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6487  hypothetical protein  43.48 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7176  protein of unknown function DUF1470  34.26 
 
 		 210 aa  51.2  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1894  hypothetical protein  30.13 
 
 		 191 aa  51.2  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3136  hypothetical protein  42.03 
 
 		 204 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.833927  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2288  protein of unknown function DUF1470  33.33 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.741376 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0954  hypothetical protein  31.65 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4029  hypothetical protein  31.16 
 
 		 192 aa  49.7  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462167  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6461  hypothetical protein  35.85 
 
 		 210 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0507888  normal  0.43229 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2523  hypothetical protein  42.03 
 
 		 204 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0715162  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9282  hypothetical protein  42.67 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3074  hypothetical protein  40.58 
 
 		 204 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.368693 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3152  hypothetical protein  42.03 
 
 		 204 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.111962 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3191  hypothetical protein  42.03 
 
 		 204 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0489705  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0177  hypothetical protein  37.7 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3480  protein of unknown function DUF1470  39.66 
 
 		 193 aa  48.9  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3324  hypothetical protein  41.38 
 
 		 193 aa  48.5  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05465  hypothetical protein  34.65 
 
 		 199 aa  47.8  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889335  normal  0.0895575 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1076  protein of unknown function DUF1470  29.53 
 
 		 177 aa  47.8  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0563895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4823  protein of unknown function DUF1470  31.68 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3746  protein of unknown function DUF1470  31.68 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1923  protein of unknown function DUF1470  35.07 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8439  protein of unknown function DUF1470  37.21 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275326 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1455  protein of unknown function DUF1470  31.07 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2428  hypothetical protein  43.06 
 
 		 185 aa  45.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2691  protein of unknown function DUF1470  31.25 
 
 		 206 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4029  hypothetical protein  30.3 
 
 		 205 aa  45.1  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4790  protein of unknown function DUF1470  29.41 
 
 		 172 aa  45.1  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0437563  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47200  hypothetical protein  37.68 
 
 		 195 aa  45.1  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1908  protein of unknown function DUF1470  38.81 
 
 		 208 aa  44.7  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.975753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0777  hypothetical protein  39.74 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.25881 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4338  hypothetical protein  35.87 
 
 		 182 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.938729  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2145  protein of unknown function DUF1470  48 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26800  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  30.92 
 
 		 175 aa  42.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4291  protein of unknown function DUF1470  37.5 
 
 		 166 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4753  hypothetical protein  30.33 
 
 		 211 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0861  protein of unknown function DUF1470  42.86 
 
 		 179 aa  42  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0214303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5067  hypothetical protein  37.14 
 
 		 200 aa  41.6  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2325  hypothetical protein  29.88 
 
 		 198 aa  41.6  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2131  hypothetical protein  41.38 
 
 		 181 aa  41.2  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>