61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4402 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4402  protein of unknown function DUF1470  100 
 
 
183 aa  367  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7704  protein of unknown function DUF1470  52.22 
 
 
216 aa  168  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8299  hypothetical protein  45.05 
 
 
181 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2901  hypothetical protein  45.3 
 
 
175 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0544322  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3946  hypothetical protein  41.34 
 
 
175 aa  121  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.839426  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3685  protein of unknown function DUF1470  42.01 
 
 
183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0408  hypothetical protein  39.18 
 
 
195 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.630736  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5759  hypothetical protein  38.37 
 
 
178 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0341  hypothetical protein  37.5 
 
 
204 aa  106  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0451  protein of unknown function DUF1470  44.55 
 
 
177 aa  82.8  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7774  hypothetical protein  37.3 
 
 
189 aa  82  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4616  hypothetical protein  35.43 
 
 
192 aa  82.4  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0252967  hitchhiker  0.00238598 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0917  protein of unknown function DUF1470  36.26 
 
 
182 aa  81.3  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.782251  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4103  hypothetical protein  37.36 
 
 
180 aa  80.5  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1581  hypothetical protein  40.17 
 
 
187 aa  79  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.345604 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1406  protein of unknown function DUF1470  32.4 
 
 
183 aa  74.3  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0606124  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5293  protein of unknown function DUF1470  34.53 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3432  protein of unknown function DUF1470  35.59 
 
 
174 aa  71.6  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2347  protein of unknown function DUF1470  33.52 
 
 
171 aa  71.2  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6164  hypothetical protein  39.53 
 
 
195 aa  71.2  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16944  hitchhiker  0.00195303 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3877  protein of unknown function DUF1470  36.36 
 
 
181 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000164809 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2411  hypothetical protein  30.77 
 
 
187 aa  70.5  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4814  protein of unknown function DUF1470  36.43 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3999  protein of unknown function DUF1470  36.27 
 
 
187 aa  67.4  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0323  protein of unknown function DUF1470  33.62 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2309  protein of unknown function DUF1470  32.14 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1791  hypothetical protein  33.33 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1443  hypothetical protein  34.75 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197682  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0577  hypothetical protein  34.69 
 
 
191 aa  64.7  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24720  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  32.16 
 
 
181 aa  62.8  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4083  protein of unknown function DUF1470  33.98 
 
 
169 aa  62.4  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4963  hypothetical protein  34.04 
 
 
183 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241292  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1119  hypothetical protein  32.76 
 
 
184 aa  62  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1136  hypothetical protein  32.76 
 
 
184 aa  62  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1148  hypothetical protein  34.03 
 
 
184 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4790  protein of unknown function DUF1470  33.94 
 
 
172 aa  60.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0437563  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2288  protein of unknown function DUF1470  35.96 
 
 
164 aa  59.7  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.741376 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11890  Protein of unknown function (DUF1470)  36.21 
 
 
200 aa  58.9  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5129  hypothetical protein  35.42 
 
 
183 aa  58.9  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116478  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4227  hypothetical protein  31.58 
 
 
186 aa  58.5  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2620  protein of unknown function DUF1470  28.4 
 
 
186 aa  58.2  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000174145  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4338  hypothetical protein  41.86 
 
 
182 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.938729  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1178  hypothetical protein  33.13 
 
 
182 aa  55.1  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1905  protein of unknown function DUF1470  36.27 
 
 
172 aa  55.1  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2131  hypothetical protein  27.44 
 
 
181 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4664  hypothetical protein  28.83 
 
 
181 aa  51.6  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2338  hypothetical protein  28.31 
 
 
182 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5018  hypothetical protein  31.16 
 
 
194 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.212987 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4029  hypothetical protein  35.06 
 
 
192 aa  47.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462167  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3165  hypothetical protein  25.61 
 
 
182 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.294475  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3415  hypothetical protein  25.61 
 
 
182 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1862  hypothetical protein  26.22 
 
 
180 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3385  hypothetical protein  25.61 
 
 
180 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1455  protein of unknown function DUF1470  34.29 
 
 
206 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8439  protein of unknown function DUF1470  37.5 
 
 
190 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.275326 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3390  hypothetical protein  24.24 
 
 
180 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388743  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3149  hypothetical protein  24.39 
 
 
182 aa  42.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000197101  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3059  hypothetical protein  24.24 
 
 
182 aa  42  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000109347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2145  protein of unknown function DUF1470  41.67 
 
 
184 aa  41.2  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3480  protein of unknown function DUF1470  36.92 
 
 
193 aa  41.6  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3324  hypothetical protein  38.98 
 
 
193 aa  41.6  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>