49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5759 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5759  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  364  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0341  hypothetical protein  63.8 
 
 
204 aa  224  7e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0408  hypothetical protein  64.42 
 
 
195 aa  211  5.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.630736  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3946  hypothetical protein  45.14 
 
 
175 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.839426  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8299  hypothetical protein  43.1 
 
 
181 aa  138  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3685  protein of unknown function DUF1470  42.77 
 
 
183 aa  136  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2901  hypothetical protein  45.45 
 
 
175 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0544322  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4402  protein of unknown function DUF1470  40.56 
 
 
183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7704  protein of unknown function DUF1470  36.61 
 
 
216 aa  118  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6164  hypothetical protein  37.96 
 
 
195 aa  85.5  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16944  hitchhiker  0.00195303 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0451  protein of unknown function DUF1470  32.96 
 
 
177 aa  81.6  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3999  protein of unknown function DUF1470  30.29 
 
 
187 aa  79.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1791  hypothetical protein  32.37 
 
 
180 aa  79  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2620  protein of unknown function DUF1470  31.71 
 
 
186 aa  79  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000174145  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0917  protein of unknown function DUF1470  32.37 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.782251  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7774  hypothetical protein  36.09 
 
 
189 aa  79  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4103  hypothetical protein  36.13 
 
 
180 aa  77  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2309  protein of unknown function DUF1470  38.32 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5293  protein of unknown function DUF1470  31.41 
 
 
183 aa  76.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4616  hypothetical protein  34.17 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0252967  hitchhiker  0.00238598 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1178  hypothetical protein  31.48 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3432  protein of unknown function DUF1470  33.33 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1581  hypothetical protein  36.97 
 
 
187 aa  75.1  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.345604 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4227  hypothetical protein  30.54 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2338  hypothetical protein  31.71 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4664  hypothetical protein  28.12 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4083  protein of unknown function DUF1470  35.35 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2411  hypothetical protein  27.03 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1406  protein of unknown function DUF1470  33.98 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0606124  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24720  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  30.94 
 
 
181 aa  67  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0323  protein of unknown function DUF1470  33.87 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3877  protein of unknown function DUF1470  31.39 
 
 
181 aa  64.3  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000164809 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2347  protein of unknown function DUF1470  33.33 
 
 
171 aa  61.6  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1148  hypothetical protein  28.66 
 
 
184 aa  60.8  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1136  hypothetical protein  28.66 
 
 
184 aa  60.8  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1119  hypothetical protein  28.66 
 
 
184 aa  60.8  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4814  protein of unknown function DUF1470  29.13 
 
 
179 aa  60.1  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1443  hypothetical protein  26.92 
 
 
183 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197682  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0577  hypothetical protein  27.55 
 
 
191 aa  57.8  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4790  protein of unknown function DUF1470  29.09 
 
 
172 aa  56.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0437563  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11890  Protein of unknown function (DUF1470)  31.03 
 
 
200 aa  56.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4338  hypothetical protein  36.46 
 
 
182 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.938729  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2288  protein of unknown function DUF1470  28.67 
 
 
164 aa  54.7  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.741376 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1905  protein of unknown function DUF1470  30.7 
 
 
172 aa  53.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4963  hypothetical protein  25 
 
 
183 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241292  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1923  protein of unknown function DUF1470  31.25 
 
 
200 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5129  hypothetical protein  27.97 
 
 
183 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116478  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2488  protein of unknown function DUF1470  38.46 
 
 
196 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5018  hypothetical protein  30.37 
 
 
194 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.212987 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>