133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2338 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2338  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1178  hypothetical protein  67.63 
 
 		 182 aa  241  3.9999999999999997e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2620  protein of unknown function DUF1470  56.07 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000174145  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1148  hypothetical protein  41.21 
 
 		 184 aa  128  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1119  hypothetical protein  41.21 
 
 		 184 aa  127  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1136  hypothetical protein  41.21 
 
 		 184 aa  127  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5293  protein of unknown function DUF1470  43.96 
 
 		 183 aa  125  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24720  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  40.11 
 
 		 181 aa  121  7e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1443  hypothetical protein  40.11 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197682  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2309  protein of unknown function DUF1470  37.22 
 
 		 189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4963  hypothetical protein  39.01 
 
 		 183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0917  protein of unknown function DUF1470  37.57 
 
 		 182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.782251  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1406  protein of unknown function DUF1470  35.56 
 
 		 183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0606124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4103  hypothetical protein  37.36 
 
 		 180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3877  protein of unknown function DUF1470  38.15 
 
 		 181 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000164809 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0451  protein of unknown function DUF1470  39.52 
 
 		 177 aa  105  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1791  hypothetical protein  37.78 
 
 		 180 aa  104  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4664  hypothetical protein  38.15 
 
 		 181 aa  100  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3946  hypothetical protein  37.82 
 
 		 175 aa  95.9  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.839426  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4227  hypothetical protein  36.46 
 
 		 186 aa  95.5  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7704  protein of unknown function DUF1470  37.06 
 
 		 216 aa  94.7  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8299  hypothetical protein  36.16 
 
 		 181 aa  87.8  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3685  protein of unknown function DUF1470  38.12 
 
 		 183 aa  85.9  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7774  hypothetical protein  37.04 
 
 		 189 aa  84.7  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4616  hypothetical protein  37.78 
 
 		 192 aa  84.3  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0252967  hitchhiker  0.00238598 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3999  protein of unknown function DUF1470  31.67 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1921  protein of unknown function DUF1470  32.97 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000367455  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4083  protein of unknown function DUF1470  33.9 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1581  hypothetical protein  42.57 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.345604 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3432  protein of unknown function DUF1470  32.07 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0577  hypothetical protein  28.72 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5759  hypothetical protein  31.71 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5018  hypothetical protein  34.76 
 
 		 194 aa  72  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.212987 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2901  hypothetical protein  35.44 
 
 		 175 aa  70.9  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0544322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2145  protein of unknown function DUF1470  33.71 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0341  hypothetical protein  31.71 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1455  protein of unknown function DUF1470  33.33 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0323  protein of unknown function DUF1470  37.74 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0408  hypothetical protein  34.13 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.630736  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2691  protein of unknown function DUF1470  32.72 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4402  protein of unknown function DUF1470  31.61 
 
 		 183 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0559  protein of unknown function DUF1470  33.73 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2288  protein of unknown function DUF1470  34.15 
 
 		 164 aa  63.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.741376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6164  hypothetical protein  36.88 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16944  hitchhiker  0.00195303 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3071  hypothetical protein  29.78 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11890  Protein of unknown function (DUF1470)  34.71 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1541  hypothetical protein  31.43 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0656289  normal  0.28934 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6780  protein of unknown function DUF1470  31.1 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3480  protein of unknown function DUF1470  29.03 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0954  hypothetical protein  27.81 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2411  hypothetical protein  30.94 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4291  protein of unknown function DUF1470  48.98 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1731  protein of unknown function DUF1470  31.36 
 
 		 185 aa  57  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21490  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  50 
 
 		 262 aa  57  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05465  hypothetical protein  30.05 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889335  normal  0.0895575 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3324  hypothetical protein  29.12 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0177  hypothetical protein  38.24 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4029  hypothetical protein  32.61 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462167  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1905  protein of unknown function DUF1470  30.39 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1923  protein of unknown function DUF1470  30.15 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1073  hypothetical protein  46.51 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00265826 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1894  hypothetical protein  30.29 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6461  hypothetical protein  27.5 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0507888  normal  0.43229 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2428  hypothetical protein  42.65 
 
 		 185 aa  54.3  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4842  protein of unknown function DUF1470  42.86 
 
 		 216 aa  54.3  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5067  hypothetical protein  44.93 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2347  protein of unknown function DUF1470  38.37 
 
 		 171 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8439  protein of unknown function DUF1470  37.84 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275326 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5144  protein of unknown function DUF1470  31.87 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.478399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2488  protein of unknown function DUF1470  51.16 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27110  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  28.42 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.902416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4753  hypothetical protein  36.15 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4308  hypothetical protein  24.59 
 
 		 194 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5618  protein of unknown function DUF1470  25.41 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.201097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6614  protein of unknown function DUF1470  28.96 
 
 		 181 aa  52  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7176  protein of unknown function DUF1470  29.69 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4814  protein of unknown function DUF1470  37.5 
 
 		 179 aa  52  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3285  hypothetical protein  29.83 
 
 		 212 aa  51.6  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0319342 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2131  hypothetical protein  39.71 
 
 		 181 aa  51.2  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3376  hypothetical protein  28.02 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2523  hypothetical protein  27.37 
 
 		 204 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0715162  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3136  hypothetical protein  27.37 
 
 		 204 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.833927  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0998  hypothetical protein  24.04 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4029  hypothetical protein  28.65 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1464  hypothetical protein  28.87 
 
 		 205 aa  49.7  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5828  hypothetical protein  36 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47200  hypothetical protein  28.34 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0894  hypothetical protein  25.14 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0853  hypothetical protein  25.14 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0952  hypothetical protein  25.14 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0777  hypothetical protein  49.06 
 
 		 186 aa  48.9  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.25881 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1036  hypothetical protein  25.14 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.26369e-21 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5129  hypothetical protein  32.72 
 
 		 183 aa  48.5  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3152  hypothetical protein  39.66 
 
 		 204 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.111962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9282  hypothetical protein  38.1 
 
 		 183 aa  48.5  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3191  hypothetical protein  42.86 
 
 		 204 aa  48.1  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0489705  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4823  protein of unknown function DUF1470  30.22 
 
 		 192 aa  48.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2691  protein of unknown function DUF1470  29.02 
 
 		 206 aa  48.5  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3746  protein of unknown function DUF1470  30.22 
 
 		 192 aa  48.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5519  hypothetical protein  35.38 
 
 		 219 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>