68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_27110 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_27110  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  100 
 
 		 174 aa  357  4e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.902416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1921  protein of unknown function DUF1470  34.48 
 
 		 186 aa  94.7  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000367455  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9282  hypothetical protein  32.6 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2691  protein of unknown function DUF1470  30.48 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2428  hypothetical protein  31.52 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3071  hypothetical protein  30.11 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2145  protein of unknown function DUF1470  34.52 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1541  hypothetical protein  29.86 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0656289  normal  0.28934 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4291  protein of unknown function DUF1470  45.61 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1073  hypothetical protein  38.03 
 
 		 233 aa  53.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00265826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9196  protein of unknown function DUF1470  31.18 
 
 		 183 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0777  hypothetical protein  33.06 
 
 		 186 aa  51.6  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.25881 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0954  hypothetical protein  29.19 
 
 		 184 aa  51.6  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2338  hypothetical protein  27.68 
 
 		 182 aa  51.2  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6780  protein of unknown function DUF1470  29.81 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4308  hypothetical protein  25.93 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8439  protein of unknown function DUF1470  32.57 
 
 		 190 aa  48.5  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275326 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26800  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  52.63 
 
 		 175 aa  48.1  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0998  hypothetical protein  25.31 
 
 		 194 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3273  hypothetical protein  31.01 
 
 		 223 aa  46.6  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3390  hypothetical protein  50 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388743  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0952  hypothetical protein  26.83 
 
 		 194 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3059  hypothetical protein  50 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000109347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1123  hypothetical protein  26.83 
 
 		 194 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1076  protein of unknown function DUF1470  28.06 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0563895  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0853  hypothetical protein  26.83 
 
 		 194 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1036  hypothetical protein  26.83 
 
 		 194 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.26369e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0894  hypothetical protein  26.83 
 
 		 194 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4849  hypothetical protein  24.49 
 
 		 167 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1908  protein of unknown function DUF1470  30.77 
 
 		 208 aa  45.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.975753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1148  hypothetical protein  32.74 
 
 		 184 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1136  hypothetical protein  32.74 
 
 		 184 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1119  hypothetical protein  32.74 
 
 		 184 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4753  hypothetical protein  41.07 
 
 		 211 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2131  hypothetical protein  47.62 
 
 		 181 aa  45.1  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3650  hypothetical protein  46 
 
 		 210 aa  44.7  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.242781  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0870  hypothetical protein  26.83 
 
 		 194 aa  44.7  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0926819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3415  hypothetical protein  29.56 
 
 		 182 aa  44.3  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3165  hypothetical protein  29.56 
 
 		 182 aa  44.3  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.294475  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1923  protein of unknown function DUF1470  28.49 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3386  hypothetical protein  47.73 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0643797  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47200  hypothetical protein  38 
 
 		 195 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0139  hypothetical protein  41.07 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.772126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5342  hypothetical protein  41.07 
 
 		 219 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74312  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5519  hypothetical protein  41.07 
 
 		 219 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0883  hypothetical protein  41.18 
 
 		 214 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.275571 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3285  hypothetical protein  43.4 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0319342 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1226  protein of unknown function DUF1470  44.44 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5018  hypothetical protein  40 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.212987 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4844  hypothetical protein  41.67 
 
 		 215 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1081  protein of unknown function DUF1470  43.48 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8882  hitchhiker  0.000010734 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3385  hypothetical protein  28.93 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1862  hypothetical protein  27.92 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5391  hypothetical protein  41.67 
 
 		 220 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421091  normal  0.322257 
 
 
-
 
NC_003296  RS05465  hypothetical protein  41.67 
 
 		 199 aa  42.4  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889335  normal  0.0895575 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4963  hypothetical protein  28.18 
 
 		 183 aa  42.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3363  hypothetical protein  45.45 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1443  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  42.4  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197682  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3149  hypothetical protein  45.45 
 
 		 182 aa  42  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000197101  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3746  protein of unknown function DUF1470  37.5 
 
 		 192 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4823  protein of unknown function DUF1470  37.5 
 
 		 192 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3480  protein of unknown function DUF1470  35.94 
 
 		 193 aa  41.6  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5828  hypothetical protein  35.29 
 
 		 190 aa  41.6  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1731  protein of unknown function DUF1470  40 
 
 		 185 aa  41.2  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3324  hypothetical protein  35.94 
 
 		 193 aa  41.2  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1178  hypothetical protein  27.91 
 
 		 182 aa  41.2  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2691  protein of unknown function DUF1470  36 
 
 		 206 aa  40.8  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0559  protein of unknown function DUF1470  46.67 
 
 		 197 aa  40.8  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>