126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05465 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05465  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  407  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889335  normal  0.0895575 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4823  protein of unknown function DUF1470  74.05 
 
 		 192 aa  261  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3746  protein of unknown function DUF1470  74.05 
 
 		 192 aa  261  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47200  hypothetical protein  60.66 
 
 		 195 aa  216  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0177  hypothetical protein  36.7 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6461  hypothetical protein  40.8 
 
 		 210 aa  115  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0507888  normal  0.43229 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3480  protein of unknown function DUF1470  36.76 
 
 		 193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1894  hypothetical protein  35.14 
 
 		 191 aa  112  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4029  hypothetical protein  40.31 
 
 		 205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3324  hypothetical protein  36.22 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1455  protein of unknown function DUF1470  39.09 
 
 		 206 aa  104  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7176  protein of unknown function DUF1470  39.2 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2691  protein of unknown function DUF1470  36.13 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4029  hypothetical protein  39.44 
 
 		 192 aa  90.9  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462167  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2560  protein of unknown function DUF1470  34.57 
 
 		 202 aa  84.7  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.306373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6614  protein of unknown function DUF1470  36.63 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0998  hypothetical protein  29.63 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0894  hypothetical protein  29.63 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0853  hypothetical protein  29.63 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0952  hypothetical protein  29.63 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1036  hypothetical protein  29.63 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.26369e-21 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0870  hypothetical protein  29.63 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0926819  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1123  hypothetical protein  29.63 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4335  hypothetical protein  32.95 
 
 		 178 aa  74.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0954  hypothetical protein  36.02 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4308  hypothetical protein  26.42 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0883  hypothetical protein  31.77 
 
 		 214 aa  71.2  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.275571 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6487  hypothetical protein  35.15 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9196  protein of unknown function DUF1470  34.02 
 
 		 183 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1923  protein of unknown function DUF1470  31.49 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1406  protein of unknown function DUF1470  34.65 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0606124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1215  hypothetical protein  33.5 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.759773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2523  hypothetical protein  31.63 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0715162  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3191  hypothetical protein  33.68 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0489705  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3136  hypothetical protein  31.63 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.833927  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1030  hypothetical protein  57.78 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.962986  normal  0.138179 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3074  hypothetical protein  33.16 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.368693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2488  protein of unknown function DUF1470  33.14 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4291  protein of unknown function DUF1470  41.89 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1908  protein of unknown function DUF1470  30.95 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.975753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2691  protein of unknown function DUF1470  41.46 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3459  protein of unknown function DUF1470  35.16 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5828  hypothetical protein  39.19 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5618  protein of unknown function DUF1470  27.37 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.201097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5067  hypothetical protein  47.62 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1541  hypothetical protein  36.23 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0656289  normal  0.28934 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3523  protein of unknown function DUF1470  35.23 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.550991  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9282  hypothetical protein  34.11 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2145  protein of unknown function DUF1470  42.86 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4842  protein of unknown function DUF1470  41.18 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3152  hypothetical protein  29.44 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.111962 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5144  protein of unknown function DUF1470  31.15 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.478399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3071  hypothetical protein  28.11 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2428  hypothetical protein  42.42 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5342  hypothetical protein  31.85 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74312  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5519  hypothetical protein  31.85 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1178  hypothetical protein  29.1 
 
 		 182 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8439  protein of unknown function DUF1470  44.62 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275326 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1921  protein of unknown function DUF1470  34.67 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000367455  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1464  hypothetical protein  29.28 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0559  protein of unknown function DUF1470  47.62 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3650  hypothetical protein  28.64 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.242781  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4849  hypothetical protein  30.94 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26800  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  32.47 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2338  hypothetical protein  28.65 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4753  hypothetical protein  31.85 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0139  hypothetical protein  32.56 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.772126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4844  hypothetical protein  28 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6249  protein of unknown function DUF1470  36 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0782544  normal  0.141305 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2309  protein of unknown function DUF1470  33.94 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3273  hypothetical protein  36.78 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0464  protein of unknown function DUF1470  32.24 
 
 		 177 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4227  hypothetical protein  34.65 
 
 		 186 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21490  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  40.91 
 
 		 262 aa  52.8  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5129  hypothetical protein  36.63 
 
 		 183 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5293  protein of unknown function DUF1470  29.75 
 
 		 183 aa  53.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3285  hypothetical protein  30.81 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0319342 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3999  protein of unknown function DUF1470  31.47 
 
 		 187 aa  52.4  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6780  protein of unknown function DUF1470  43.75 
 
 		 155 aa  52  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1731  protein of unknown function DUF1470  45.61 
 
 		 185 aa  52  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2411  hypothetical protein  29.55 
 
 		 187 aa  52  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2325  hypothetical protein  29.89 
 
 		 198 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1119  hypothetical protein  39.34 
 
 		 184 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1136  hypothetical protein  39.34 
 
 		 184 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1148  hypothetical protein  39.34 
 
 		 184 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1443  hypothetical protein  36.51 
 
 		 183 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4963  hypothetical protein  37.7 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8299  hypothetical protein  28.17 
 
 		 181 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1454  protein of unknown function DUF1470  30.85 
 
 		 174 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2397  protein of unknown function DUF1470  31.25 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.776458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4664  hypothetical protein  33.7 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4103  hypothetical protein  29.02 
 
 		 180 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1226  protein of unknown function DUF1470  41.94 
 
 		 181 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142417 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0451  protein of unknown function DUF1470  35 
 
 		 177 aa  49.3  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5391  hypothetical protein  39.66 
 
 		 220 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421091  normal  0.322257 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2620  protein of unknown function DUF1470  40.32 
 
 		 186 aa  48.9  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000174145  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3376  hypothetical protein  32.07 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1862  hypothetical protein  23.94 
 
 		 180 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0777  hypothetical protein  46 
 
 		 186 aa  48.5  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.25881 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1073  hypothetical protein  40 
 
 		 233 aa  48.5  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00265826 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>