82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0451 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0451  protein of unknown function DUF1470  100 
 
 
177 aa  362  2e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3432  protein of unknown function DUF1470  35.39 
 
 
174 aa  94.4  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2901  hypothetical protein  36.87 
 
 
175 aa  93.6  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0544322  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3946  hypothetical protein  48.54 
 
 
175 aa  94  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.839426  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8299  hypothetical protein  36.56 
 
 
181 aa  92.8  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1178  hypothetical protein  38.79 
 
 
182 aa  90.9  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2347  protein of unknown function DUF1470  34.46 
 
 
171 aa  90.5  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2338  hypothetical protein  36.48 
 
 
182 aa  90.5  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1581  hypothetical protein  40.6 
 
 
187 aa  89.4  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.345604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7774  hypothetical protein  33.86 
 
 
189 aa  88.2  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7704  protein of unknown function DUF1470  36.81 
 
 
216 aa  87.8  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2309  protein of unknown function DUF1470  37.79 
 
 
189 aa  87  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1406  protein of unknown function DUF1470  44.34 
 
 
183 aa  85.5  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0606124  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2411  hypothetical protein  31.02 
 
 
187 aa  84.3  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5293  protein of unknown function DUF1470  43.14 
 
 
183 aa  84  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4402  protein of unknown function DUF1470  44.55 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4083  protein of unknown function DUF1470  35.63 
 
 
169 aa  82.4  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4790  protein of unknown function DUF1470  35.54 
 
 
172 aa  82  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0437563  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3685  protein of unknown function DUF1470  34.5 
 
 
183 aa  81.6  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1791  hypothetical protein  41.58 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4103  hypothetical protein  44.44 
 
 
180 aa  80.5  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4616  hypothetical protein  35.34 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0252967  hitchhiker  0.00238598 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0917  protein of unknown function DUF1470  36.36 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.782251  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1905  protein of unknown function DUF1470  31.43 
 
 
172 aa  77.8  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0577  hypothetical protein  35.14 
 
 
191 aa  77  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3999  protein of unknown function DUF1470  38.32 
 
 
187 aa  77  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2620  protein of unknown function DUF1470  42.06 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000174145  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24720  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  32.41 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3877  protein of unknown function DUF1470  43.16 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000164809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6164  hypothetical protein  38.19 
 
 
195 aa  74.7  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16944  hitchhiker  0.00195303 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4814  protein of unknown function DUF1470  32.42 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2288  protein of unknown function DUF1470  39.68 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.741376 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1119  hypothetical protein  35.9 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0323  protein of unknown function DUF1470  36.63 
 
 
187 aa  70.5  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1136  hypothetical protein  35.9 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5759  hypothetical protein  30.99 
 
 
178 aa  70.5  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1148  hypothetical protein  35.9 
 
 
184 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1443  hypothetical protein  35.9 
 
 
183 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197682  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0408  hypothetical protein  30.18 
 
 
195 aa  67.8  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.630736  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4963  hypothetical protein  34.19 
 
 
183 aa  67.8  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241292  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0341  hypothetical protein  31.25 
 
 
204 aa  67.4  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5129  hypothetical protein  36.15 
 
 
183 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116478  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4227  hypothetical protein  37.86 
 
 
186 aa  61.6  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11890  Protein of unknown function (DUF1470)  32.17 
 
 
200 aa  59.7  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4664  hypothetical protein  35.42 
 
 
181 aa  58.9  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1455  protein of unknown function DUF1470  31.76 
 
 
206 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4338  hypothetical protein  40 
 
 
182 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.938729  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5018  hypothetical protein  43.06 
 
 
194 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.212987 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1541  hypothetical protein  46.81 
 
 
186 aa  52.4  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0656289  normal  0.28934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2145  protein of unknown function DUF1470  35.9 
 
 
184 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5067  hypothetical protein  44.12 
 
 
200 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4291  protein of unknown function DUF1470  35.87 
 
 
166 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1923  protein of unknown function DUF1470  31.69 
 
 
200 aa  49.3  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21490  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  35.79 
 
 
262 aa  47.8  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1921  protein of unknown function DUF1470  29.91 
 
 
186 aa  47.8  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000367455  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1894  hypothetical protein  26.77 
 
 
191 aa  46.6  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4029  hypothetical protein  28.47 
 
 
205 aa  45.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4029  hypothetical protein  31.21 
 
 
192 aa  45.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462167  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6461  hypothetical protein  32.81 
 
 
210 aa  45.1  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0507888  normal  0.43229 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6780  protein of unknown function DUF1470  37.74 
 
 
155 aa  44.7  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8439  protein of unknown function DUF1470  33.72 
 
 
190 aa  44.7  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.275326 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4842  protein of unknown function DUF1470  34.55 
 
 
216 aa  44.7  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6487  hypothetical protein  32.39 
 
 
204 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2523  hypothetical protein  32.39 
 
 
204 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0715162  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3136  hypothetical protein  32.39 
 
 
204 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.833927  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2488  protein of unknown function DUF1470  47.83 
 
 
196 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0559  protein of unknown function DUF1470  31.11 
 
 
197 aa  44.3  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2428  hypothetical protein  35.62 
 
 
185 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3285  hypothetical protein  29.91 
 
 
212 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0319342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1332  hypothetical protein  37.5 
 
 
152 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0870238 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1073  hypothetical protein  29.85 
 
 
233 aa  42.4  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00265826 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3386  hypothetical protein  29.87 
 
 
182 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0643797  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2131  hypothetical protein  31.17 
 
 
181 aa  42  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3191  hypothetical protein  30.99 
 
 
204 aa  42  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0489705  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3324  hypothetical protein  34.38 
 
 
193 aa  42  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7176  protein of unknown function DUF1470  31.25 
 
 
210 aa  42  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3480  protein of unknown function DUF1470  32.81 
 
 
193 aa  42  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05465  hypothetical protein  35 
 
 
199 aa  41.6  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889335  normal  0.0895575 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1731  protein of unknown function DUF1470  26.53 
 
 
185 aa  41.2  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2325  hypothetical protein  27.75 
 
 
198 aa  40.8  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2691  protein of unknown function DUF1470  30.38 
 
 
194 aa  40.8  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5618  protein of unknown function DUF1470  26.32 
 
 
204 aa  40.8  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.201097 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>