23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1332 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1332  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  300  6.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0870238 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1406  protein of unknown function DUF1470  34.21 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0606124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2338  hypothetical protein  31.86 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1178  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0917  protein of unknown function DUF1470  36.17 
 
 		 182 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.782251  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24720  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  36.56 
 
 		 181 aa  47.8  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1443  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4616  hypothetical protein  33.7 
 
 		 192 aa  44.3  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0252967  hitchhiker  0.00238598 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4963  hypothetical protein  32.32 
 
 		 183 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0451  protein of unknown function DUF1470  38.1 
 
 		 177 aa  43.5  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1119  hypothetical protein  31.31 
 
 		 184 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3685  protein of unknown function DUF1470  31.87 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2620  protein of unknown function DUF1470  28.89 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000174145  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1148  hypothetical protein  31.31 
 
 		 184 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1136  hypothetical protein  31.31 
 
 		 184 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3946  hypothetical protein  34.78 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.839426  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1791  hypothetical protein  29.73 
 
 		 180 aa  42.4  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7774  hypothetical protein  33.71 
 
 		 189 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3074  hypothetical protein  45.45 
 
 		 204 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.368693 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3136  hypothetical protein  45.24 
 
 		 204 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.833927  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2523  hypothetical protein  45.24 
 
 		 204 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0715162  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7176  protein of unknown function DUF1470  43.18 
 
 		 210 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3152  hypothetical protein  45.24 
 
 		 204 aa  40.4  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.111962 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>