48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6164 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6164  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  381  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16944  hitchhiker  0.00195303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4338  hypothetical protein  44.32 
 
 		 182 aa  99  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.938729  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7704  protein of unknown function DUF1470  39.2 
 
 		 216 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4616  hypothetical protein  39.1 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0252967  hitchhiker  0.00238598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8299  hypothetical protein  33.73 
 
 		 181 aa  81.3  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3685  protein of unknown function DUF1470  39.72 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5759  hypothetical protein  35.71 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0451  protein of unknown function DUF1470  38.19 
 
 		 177 aa  74.7  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0408  hypothetical protein  38.28 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.630736  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3999  protein of unknown function DUF1470  35 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0341  hypothetical protein  36.72 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3946  hypothetical protein  37.23 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.839426  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2309  protein of unknown function DUF1470  34.91 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4402  protein of unknown function DUF1470  39.53 
 
 		 183 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1581  hypothetical protein  43.56 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.345604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7774  hypothetical protein  39.67 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11890  Protein of unknown function (DUF1470)  36.84 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0917  protein of unknown function DUF1470  34.75 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.782251  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2620  protein of unknown function DUF1470  37.1 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000174145  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2901  hypothetical protein  33.58 
 
 		 175 aa  67.8  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0544322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4103  hypothetical protein  35.42 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3432  protein of unknown function DUF1470  42.5 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2347  protein of unknown function DUF1470  39.6 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1406  protein of unknown function DUF1470  37.88 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0606124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1791  hypothetical protein  38.39 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4083  protein of unknown function DUF1470  38.79 
 
 		 169 aa  60.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4814  protein of unknown function DUF1470  38.66 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0323  protein of unknown function DUF1470  38.14 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1148  hypothetical protein  35.26 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1119  hypothetical protein  35.26 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5293  protein of unknown function DUF1470  33.57 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24720  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  35.56 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1136  hypothetical protein  35.26 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4227  hypothetical protein  34.15 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4664  hypothetical protein  32.89 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1178  hypothetical protein  35.38 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4790  protein of unknown function DUF1470  37 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0437563  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2288  protein of unknown function DUF1470  37.61 
 
 		 164 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.741376 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3877  protein of unknown function DUF1470  33.33 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000164809 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1905  protein of unknown function DUF1470  36.13 
 
 		 172 aa  53.9  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1443  hypothetical protein  32.87 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4963  hypothetical protein  31.69 
 
 		 183 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2338  hypothetical protein  35.29 
 
 		 182 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0577  hypothetical protein  29.66 
 
 		 191 aa  48.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2411  hypothetical protein  33.33 
 
 		 187 aa  47.8  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5129  hypothetical protein  34.43 
 
 		 183 aa  44.7  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0954  hypothetical protein  31.08 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6461  hypothetical protein  41.54 
 
 		 210 aa  41.2  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0507888  normal  0.43229 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>