48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1905 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1905  protein of unknown function DUF1470  100 
 
 		 172 aa  345  1e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11890  Protein of unknown function (DUF1470)  46.24 
 
 		 200 aa  155  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3432  protein of unknown function DUF1470  38.73 
 
 		 174 aa  97.1  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4083  protein of unknown function DUF1470  42.16 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0451  protein of unknown function DUF1470  31.43 
 
 		 177 aa  77.8  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2288  protein of unknown function DUF1470  42.73 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.741376 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4616  hypothetical protein  31.07 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0252967  hitchhiker  0.00238598 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4814  protein of unknown function DUF1470  42.31 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2309  protein of unknown function DUF1470  31.25 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1791  hypothetical protein  31.32 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1178  hypothetical protein  33.91 
 
 		 182 aa  64.3  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3685  protein of unknown function DUF1470  35.9 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1581  hypothetical protein  35.56 
 
 		 187 aa  60.8  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.345604 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24720  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  29.38 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2620  protein of unknown function DUF1470  32.75 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000174145  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4790  protein of unknown function DUF1470  30.63 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0437563  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4103  hypothetical protein  38.54 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7774  hypothetical protein  32.57 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4664  hypothetical protein  36.26 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5293  protein of unknown function DUF1470  33.33 
 
 		 183 aa  57  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3999  protein of unknown function DUF1470  32.46 
 
 		 187 aa  57  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4402  protein of unknown function DUF1470  36.27 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3877  protein of unknown function DUF1470  29.76 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000164809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2338  hypothetical protein  30.64 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2411  hypothetical protein  29.79 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6164  hypothetical protein  36.13 
 
 		 195 aa  53.9  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16944  hitchhiker  0.00195303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2347  protein of unknown function DUF1470  29.01 
 
 		 171 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3946  hypothetical protein  32.35 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.839426  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0341  hypothetical protein  29.05 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0323  protein of unknown function DUF1470  31.75 
 
 		 187 aa  51.6  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8299  hypothetical protein  32.12 
 
 		 181 aa  50.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5759  hypothetical protein  30.48 
 
 		 178 aa  50.8  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0408  hypothetical protein  34.58 
 
 		 195 aa  50.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.630736  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0917  protein of unknown function DUF1470  29.08 
 
 		 182 aa  50.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.782251  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4227  hypothetical protein  34.23 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7704  protein of unknown function DUF1470  32.35 
 
 		 216 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0577  hypothetical protein  27.42 
 
 		 191 aa  48.5  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2901  hypothetical protein  34 
 
 		 175 aa  48.1  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0544322  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1406  protein of unknown function DUF1470  36 
 
 		 183 aa  47.8  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0606124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1443  hypothetical protein  32.47 
 
 		 183 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1148  hypothetical protein  28.87 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1136  hypothetical protein  33.33 
 
 		 184 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1119  hypothetical protein  33.33 
 
 		 184 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4338  hypothetical protein  32.16 
 
 		 182 aa  45.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.938729  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0954  hypothetical protein  43.86 
 
 		 184 aa  44.7  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5129  hypothetical protein  34.83 
 
 		 183 aa  44.3  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5144  protein of unknown function DUF1470  49.06 
 
 		 203 aa  44.3  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.478399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4963  hypothetical protein  33.98 
 
 		 183 aa  41.6  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241292  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>