51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_11890 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_11890  Protein of unknown function (DUF1470)  100 
 
 		 200 aa  401  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1905  protein of unknown function DUF1470  46.24 
 
 		 172 aa  155  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3432  protein of unknown function DUF1470  44.62 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4616  hypothetical protein  35.53 
 
 		 192 aa  95.1  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0252967  hitchhiker  0.00238598 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2288  protein of unknown function DUF1470  43.93 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.741376 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1581  hypothetical protein  40 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.345604 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4083  protein of unknown function DUF1470  40 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7774  hypothetical protein  39.02 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24720  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  32.29 
 
 		 181 aa  72  0.000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6164  hypothetical protein  36.84 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16944  hitchhiker  0.00195303 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4814  protein of unknown function DUF1470  40 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1791  hypothetical protein  38.68 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4664  hypothetical protein  31.69 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4790  protein of unknown function DUF1470  31.82 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0437563  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4227  hypothetical protein  30.41 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3685  protein of unknown function DUF1470  35.67 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2309  protein of unknown function DUF1470  30.85 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1178  hypothetical protein  31.02 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1148  hypothetical protein  30.37 
 
 		 184 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1119  hypothetical protein  30.37 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1136  hypothetical protein  30.37 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2620  protein of unknown function DUF1470  30.56 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000174145  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3999  protein of unknown function DUF1470  29.79 
 
 		 187 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5293  protein of unknown function DUF1470  35.4 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0451  protein of unknown function DUF1470  32.17 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4402  protein of unknown function DUF1470  36.21 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0917  protein of unknown function DUF1470  33.63 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.782251  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8299  hypothetical protein  33.77 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0341  hypothetical protein  33.64 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0408  hypothetical protein  33.64 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.630736  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2338  hypothetical protein  33.93 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3946  hypothetical protein  34.43 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.839426  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2411  hypothetical protein  27.57 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7704  protein of unknown function DUF1470  31.47 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1443  hypothetical protein  33.04 
 
 		 183 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4963  hypothetical protein  31.03 
 
 		 183 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0577  hypothetical protein  28.21 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0323  protein of unknown function DUF1470  31.93 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4103  hypothetical protein  28.12 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5759  hypothetical protein  29.52 
 
 		 178 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2347  protein of unknown function DUF1470  32.65 
 
 		 171 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2901  hypothetical protein  33.33 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0544322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4338  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.938729  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5018  hypothetical protein  28.19 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.212987 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3877  protein of unknown function DUF1470  30.68 
 
 		 181 aa  43.9  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000164809 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5144  protein of unknown function DUF1470  54.55 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.478399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5129  hypothetical protein  25.35 
 
 		 183 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0212  hypothetical protein  43.75 
 
 		 226 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0220  hypothetical protein  42.86 
 
 		 219 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646093 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1406  protein of unknown function DUF1470  30.93 
 
 		 183 aa  42  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0606124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6461  hypothetical protein  36.92 
 
 		 210 aa  41.2  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0507888  normal  0.43229 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>