101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4664 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4664  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  365  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4227  hypothetical protein  89.5 
 
 
186 aa  313  9e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5293  protein of unknown function DUF1470  59.89 
 
 
183 aa  198  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24720  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  53.67 
 
 
181 aa  175  4e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4103  hypothetical protein  47.22 
 
 
180 aa  163  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1443  hypothetical protein  49.72 
 
 
183 aa  161  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197682  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3999  protein of unknown function DUF1470  48.59 
 
 
187 aa  161  5.0000000000000005e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1406  protein of unknown function DUF1470  49.72 
 
 
183 aa  161  5.0000000000000005e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0606124  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0917  protein of unknown function DUF1470  49.17 
 
 
182 aa  161  6e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.782251  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1148  hypothetical protein  50 
 
 
184 aa  159  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1791  hypothetical protein  48.31 
 
 
180 aa  158  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1119  hypothetical protein  50 
 
 
184 aa  157  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1136  hypothetical protein  50 
 
 
184 aa  157  6e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4963  hypothetical protein  48.62 
 
 
183 aa  157  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241292  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2309  protein of unknown function DUF1470  45.3 
 
 
189 aa  147  8e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3877  protein of unknown function DUF1470  44.71 
 
 
181 aa  142  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000164809 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2620  protein of unknown function DUF1470  45.09 
 
 
186 aa  136  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000174145  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1178  hypothetical protein  38.01 
 
 
182 aa  103  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2338  hypothetical protein  38.15 
 
 
182 aa  101  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4616  hypothetical protein  37.96 
 
 
192 aa  84.3  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0252967  hitchhiker  0.00238598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7774  hypothetical protein  37.68 
 
 
189 aa  84  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3946  hypothetical protein  38.84 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.839426  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8299  hypothetical protein  35.88 
 
 
181 aa  78.6  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1581  hypothetical protein  44.44 
 
 
187 aa  75.5  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.345604 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3432  protein of unknown function DUF1470  38.71 
 
 
174 aa  74.3  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2901  hypothetical protein  34.55 
 
 
175 aa  74.3  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0544322  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3685  protein of unknown function DUF1470  34.59 
 
 
183 aa  72  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5759  hypothetical protein  28.12 
 
 
178 aa  72  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11890  Protein of unknown function (DUF1470)  31.38 
 
 
200 aa  70.9  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7704  protein of unknown function DUF1470  33.33 
 
 
216 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0451  protein of unknown function DUF1470  38.83 
 
 
177 aa  70.1  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0577  hypothetical protein  30.77 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5129  hypothetical protein  38.32 
 
 
183 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116478  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6164  hypothetical protein  34.15 
 
 
195 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16944  hitchhiker  0.00195303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4402  protein of unknown function DUF1470  30.59 
 
 
183 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21490  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  41.32 
 
 
262 aa  60.8  0.000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0341  hypothetical protein  30.49 
 
 
204 aa  59.7  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0323  protein of unknown function DUF1470  32.26 
 
 
187 aa  58.2  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1030  hypothetical protein  46.15 
 
 
176 aa  57.8  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.962986  normal  0.138179 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1905  protein of unknown function DUF1470  35.79 
 
 
172 aa  57.4  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2411  hypothetical protein  29.75 
 
 
187 aa  56.6  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4814  protein of unknown function DUF1470  30.83 
 
 
179 aa  56.6  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4083  protein of unknown function DUF1470  31.43 
 
 
169 aa  56.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1076  protein of unknown function DUF1470  29.53 
 
 
177 aa  54.3  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0563895  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5018  hypothetical protein  28.75 
 
 
194 aa  54.3  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.212987 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0408  hypothetical protein  28.8 
 
 
195 aa  53.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.630736  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9282  hypothetical protein  42.31 
 
 
183 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4823  protein of unknown function DUF1470  32.67 
 
 
192 aa  52.4  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3746  protein of unknown function DUF1470  32.67 
 
 
192 aa  52.4  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10286  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1894  hypothetical protein  29.31 
 
 
191 aa  50.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2347  protein of unknown function DUF1470  36.27 
 
 
171 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8439  protein of unknown function DUF1470  37.21 
 
 
190 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.275326 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4029  hypothetical protein  29.71 
 
 
192 aa  48.5  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462167  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6487  hypothetical protein  40.58 
 
 
204 aa  48.1  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26800  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  32.68 
 
 
175 aa  48.1  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_003296  RS05465  hypothetical protein  35.35 
 
 
199 aa  47.8  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889335  normal  0.0895575 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0777  hypothetical protein  41.03 
 
 
186 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.25881 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7176  protein of unknown function DUF1470  32.41 
 
 
210 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3480  protein of unknown function DUF1470  36.07 
 
 
193 aa  47  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2288  protein of unknown function DUF1470  30.17 
 
 
164 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.741376 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0954  hypothetical protein  31.91 
 
 
184 aa  46.6  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4753  hypothetical protein  30.89 
 
 
211 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268906  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47200  hypothetical protein  37.68 
 
 
195 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3324  hypothetical protein  37.7 
 
 
193 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4291  protein of unknown function DUF1470  38.64 
 
 
166 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1908  protein of unknown function DUF1470  38.81 
 
 
208 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.975753  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2428  hypothetical protein  43.06 
 
 
185 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0177  hypothetical protein  36.67 
 
 
190 aa  45.8  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2523  hypothetical protein  40.58 
 
 
204 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0715162  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3136  hypothetical protein  40.58 
 
 
204 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.833927  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3152  hypothetical protein  40.58 
 
 
204 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.111962 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3191  hypothetical protein  39.13 
 
 
204 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0489705  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0861  protein of unknown function DUF1470  42.86 
 
 
179 aa  45.1  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0214303  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6461  hypothetical protein  33.96 
 
 
210 aa  45.1  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0507888  normal  0.43229 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2691  protein of unknown function DUF1470  28.57 
 
 
206 aa  45.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2488  protein of unknown function DUF1470  45.28 
 
 
196 aa  45.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4338  hypothetical protein  36.61 
 
 
182 aa  45.1  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.938729  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3074  hypothetical protein  37.68 
 
 
204 aa  44.7  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.368693 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1455  protein of unknown function DUF1470  31.07 
 
 
206 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4029  hypothetical protein  30.3 
 
 
205 aa  44.3  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3390  hypothetical protein  27.22 
 
 
180 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388743  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1862  hypothetical protein  31.58 
 
 
180 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3386  hypothetical protein  26.11 
 
 
182 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0643797  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3059  hypothetical protein  31.58 
 
 
182 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000109347  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3363  hypothetical protein  25.99 
 
 
180 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2145  protein of unknown function DUF1470  47.92 
 
 
184 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3165  hypothetical protein  41.67 
 
 
182 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.294475  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3415  hypothetical protein  41.67 
 
 
182 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2131  hypothetical protein  41.38 
 
 
181 aa  42.7  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2691  protein of unknown function DUF1470  31.82 
 
 
194 aa  42.4  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3385  hypothetical protein  41.67 
 
 
180 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1923  protein of unknown function DUF1470  34.33 
 
 
200 aa  42.4  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3149  hypothetical protein  25.86 
 
 
182 aa  42  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000197101  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5342  hypothetical protein  29.29 
 
 
219 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74312  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4844  hypothetical protein  28.77 
 
 
215 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10336  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5519  hypothetical protein  29.29 
 
 
219 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3071  hypothetical protein  41.38 
 
 
210 aa  41.6  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5067  hypothetical protein  38.57 
 
 
200 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4790  protein of unknown function DUF1470  26.16 
 
 
172 aa  41.6  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0437563  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0139  hypothetical protein  27.59 
 
 
206 aa  41.6  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.772126  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>