122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2145 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2145  protein of unknown function DUF1470  100 
 
 
184 aa  370  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1073  hypothetical protein  48.91 
 
 
233 aa  148  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00265826 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1541  hypothetical protein  42.05 
 
 
186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0656289  normal  0.28934 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1921  protein of unknown function DUF1470  40 
 
 
186 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000367455  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9282  hypothetical protein  40.76 
 
 
183 aa  98.2  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2691  protein of unknown function DUF1470  36.17 
 
 
194 aa  93.6  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2428  hypothetical protein  39.41 
 
 
185 aa  91.7  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3071  hypothetical protein  34.32 
 
 
210 aa  87.4  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6780  protein of unknown function DUF1470  33.53 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4291  protein of unknown function DUF1470  35.71 
 
 
166 aa  79  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8439  protein of unknown function DUF1470  35.67 
 
 
190 aa  78.2  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.275326 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4335  hypothetical protein  32.94 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2338  hypothetical protein  32.32 
 
 
182 aa  64.7  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27110  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  34.52 
 
 
174 aa  63.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.902416  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3390  hypothetical protein  29.32 
 
 
180 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388743  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0777  hypothetical protein  41.56 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.25881 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0139  hypothetical protein  32.47 
 
 
206 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.772126  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1226  protein of unknown function DUF1470  52.08 
 
 
181 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142417 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1081  protein of unknown function DUF1470  52.08 
 
 
181 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8882  hitchhiker  0.000010734 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3059  hypothetical protein  30.91 
 
 
182 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000109347  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4844  hypothetical protein  32.65 
 
 
215 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10336  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2131  hypothetical protein  29.7 
 
 
181 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1923  protein of unknown function DUF1470  34.16 
 
 
200 aa  58.5  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3386  hypothetical protein  29.09 
 
 
182 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0643797  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3285  hypothetical protein  34.85 
 
 
212 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0319342 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1862  hypothetical protein  29.09 
 
 
180 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3385  hypothetical protein  30 
 
 
180 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3165  hypothetical protein  30 
 
 
182 aa  58.2  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.294475  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3415  hypothetical protein  30 
 
 
182 aa  58.2  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0954  hypothetical protein  32.57 
 
 
184 aa  58.2  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3149  hypothetical protein  30 
 
 
182 aa  57.8  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000197101  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5342  hypothetical protein  36.36 
 
 
219 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74312  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5519  hypothetical protein  36.36 
 
 
219 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2325  hypothetical protein  30.17 
 
 
198 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8299  hypothetical protein  32.29 
 
 
181 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4029  hypothetical protein  32.7 
 
 
192 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462167  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4753  hypothetical protein  53.19 
 
 
211 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268906  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5391  hypothetical protein  53.19 
 
 
220 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421091  normal  0.322257 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2309  protein of unknown function DUF1470  32.24 
 
 
189 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5828  hypothetical protein  38.36 
 
 
190 aa  55.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2397  protein of unknown function DUF1470  32.93 
 
 
191 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.776458  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0220  hypothetical protein  43.28 
 
 
219 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646093 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6461  hypothetical protein  28.42 
 
 
210 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0507888  normal  0.43229 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0559  protein of unknown function DUF1470  32.34 
 
 
197 aa  55.5  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1908  protein of unknown function DUF1470  28.49 
 
 
208 aa  55.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.975753  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1178  hypothetical protein  30.41 
 
 
182 aa  54.7  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3363  hypothetical protein  26.67 
 
 
180 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05465  hypothetical protein  34.35 
 
 
199 aa  53.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889335  normal  0.0895575 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0870  hypothetical protein  26.34 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0926819  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1455  protein of unknown function DUF1470  38.67 
 
 
206 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21490  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  40.7 
 
 
262 aa  53.1  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2488  protein of unknown function DUF1470  39.06 
 
 
196 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1406  protein of unknown function DUF1470  50 
 
 
183 aa  52.8  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0606124  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5067  hypothetical protein  32.05 
 
 
200 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3480  protein of unknown function DUF1470  33.77 
 
 
193 aa  52  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3324  hypothetical protein  27.51 
 
 
193 aa  51.6  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0998  hypothetical protein  25.81 
 
 
194 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2620  protein of unknown function DUF1470  26.82 
 
 
186 aa  51.6  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000174145  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0212  hypothetical protein  43.4 
 
 
226 aa  51.2  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1894  hypothetical protein  29.28 
 
 
191 aa  50.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0883  hypothetical protein  45.65 
 
 
214 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.275571 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7176  protein of unknown function DUF1470  35.94 
 
 
210 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1123  hypothetical protein  25.81 
 
 
194 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47200  hypothetical protein  36.14 
 
 
195 aa  50.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0451  protein of unknown function DUF1470  33.33 
 
 
177 aa  50.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0894  hypothetical protein  25.81 
 
 
194 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0853  hypothetical protein  25.81 
 
 
194 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0952  hypothetical protein  25.81 
 
 
194 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1119  hypothetical protein  32.67 
 
 
184 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1136  hypothetical protein  32.67 
 
 
184 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1148  hypothetical protein  32.67 
 
 
184 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1036  hypothetical protein  25.81 
 
 
194 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.26369e-21 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1030  hypothetical protein  31.07 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.962986  normal  0.138179 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4842  protein of unknown function DUF1470  41.67 
 
 
216 aa  49.3  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1076  protein of unknown function DUF1470  48.84 
 
 
177 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0563895  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5293  protein of unknown function DUF1470  38 
 
 
183 aa  49.3  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3376  hypothetical protein  34.93 
 
 
211 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4849  hypothetical protein  30 
 
 
167 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1581  hypothetical protein  46.38 
 
 
187 aa  48.9  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.345604 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4616  hypothetical protein  46.48 
 
 
192 aa  48.5  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0252967  hitchhiker  0.00238598 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1443  hypothetical protein  32 
 
 
183 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197682  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2523  hypothetical protein  26.92 
 
 
204 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0715162  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3136  hypothetical protein  26.92 
 
 
204 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.833927  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4963  hypothetical protein  31 
 
 
183 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241292  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1464  hypothetical protein  46.51 
 
 
205 aa  48.5  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1731  protein of unknown function DUF1470  42.86 
 
 
185 aa  48.1  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5144  protein of unknown function DUF1470  40.51 
 
 
203 aa  48.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.478399  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4308  hypothetical protein  25.6 
 
 
194 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3999  protein of unknown function DUF1470  50 
 
 
187 aa  47.8  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4029  hypothetical protein  37.93 
 
 
205 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2901  hypothetical protein  34 
 
 
175 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0544322  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3191  hypothetical protein  46.51 
 
 
204 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0489705  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1791  hypothetical protein  48.08 
 
 
180 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4823  protein of unknown function DUF1470  45.45 
 
 
192 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3746  protein of unknown function DUF1470  45.45 
 
 
192 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10286  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5129  hypothetical protein  42.31 
 
 
183 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116478  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6614  protein of unknown function DUF1470  28.75 
 
 
181 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216738  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7704  protein of unknown function DUF1470  39.19 
 
 
216 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5591  protein of unknown function DUF1470  25 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.166159  normal  0.646492 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3459  protein of unknown function DUF1470  40.98 
 
 
211 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>