70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8299 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8299  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  367  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2901  hypothetical protein  70.52 
 
 
175 aa  236  9e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0544322  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3685  protein of unknown function DUF1470  54.12 
 
 
183 aa  186  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7704  protein of unknown function DUF1470  51.11 
 
 
216 aa  169  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3946  hypothetical protein  50.57 
 
 
175 aa  155  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.839426  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4402  protein of unknown function DUF1470  45.05 
 
 
183 aa  142  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5759  hypothetical protein  42.17 
 
 
178 aa  127  8.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0341  hypothetical protein  41.57 
 
 
204 aa  122  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0408  hypothetical protein  40.96 
 
 
195 aa  111  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.630736  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1581  hypothetical protein  40.29 
 
 
187 aa  99.4  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.345604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7774  hypothetical protein  39.55 
 
 
189 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4616  hypothetical protein  38.06 
 
 
192 aa  99.4  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0252967  hitchhiker  0.00238598 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0451  protein of unknown function DUF1470  36.56 
 
 
177 aa  92.8  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4083  protein of unknown function DUF1470  40.94 
 
 
169 aa  90.5  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2309  protein of unknown function DUF1470  39.55 
 
 
189 aa  87.8  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0917  protein of unknown function DUF1470  36.54 
 
 
182 aa  86.3  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.782251  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4103  hypothetical protein  36.59 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3999  protein of unknown function DUF1470  33.33 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5293  protein of unknown function DUF1470  37.32 
 
 
183 aa  82.4  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3432  protein of unknown function DUF1470  37.57 
 
 
174 aa  82  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1791  hypothetical protein  32.96 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6164  hypothetical protein  33.73 
 
 
195 aa  81.3  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16944  hitchhiker  0.00195303 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3877  protein of unknown function DUF1470  39.84 
 
 
181 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000164809 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0323  protein of unknown function DUF1470  33.6 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1178  hypothetical protein  33.33 
 
 
182 aa  74.3  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2338  hypothetical protein  33.73 
 
 
182 aa  73.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2620  protein of unknown function DUF1470  33.74 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000174145  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1406  protein of unknown function DUF1470  28.82 
 
 
183 aa  70.9  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0606124  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4227  hypothetical protein  36.64 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2411  hypothetical protein  30.72 
 
 
187 aa  70.5  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4790  protein of unknown function DUF1470  34.64 
 
 
172 aa  70.5  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0437563  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2347  protein of unknown function DUF1470  38.61 
 
 
171 aa  69.3  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24720  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  34.3 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4814  protein of unknown function DUF1470  32.22 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1148  hypothetical protein  35.68 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1119  hypothetical protein  35.68 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1443  hypothetical protein  34.81 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197682  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1136  hypothetical protein  35.68 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4664  hypothetical protein  33.06 
 
 
181 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4338  hypothetical protein  37.63 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.938729  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4963  hypothetical protein  34.07 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241292  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0577  hypothetical protein  33.33 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2288  protein of unknown function DUF1470  33.54 
 
 
164 aa  62.8  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.741376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5129  hypothetical protein  32.11 
 
 
183 aa  58.9  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116478  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11890  Protein of unknown function (DUF1470)  33.77 
 
 
200 aa  57.4  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1905  protein of unknown function DUF1470  32.12 
 
 
172 aa  50.8  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2145  protein of unknown function DUF1470  39.02 
 
 
184 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5018  hypothetical protein  34.94 
 
 
194 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.212987 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1923  protein of unknown function DUF1470  32.14 
 
 
200 aa  47.8  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4335  hypothetical protein  28.83 
 
 
178 aa  47.8  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0559  protein of unknown function DUF1470  32.12 
 
 
197 aa  46.2  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6461  hypothetical protein  28.96 
 
 
210 aa  45.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0507888  normal  0.43229 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4029  hypothetical protein  31.08 
 
 
192 aa  45.1  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462167  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4823  protein of unknown function DUF1470  28.17 
 
 
192 aa  45.1  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3746  protein of unknown function DUF1470  28.17 
 
 
192 aa  45.1  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10286  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05465  hypothetical protein  28.17 
 
 
199 aa  43.9  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889335  normal  0.0895575 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2691  protein of unknown function DUF1470  30.64 
 
 
194 aa  43.9  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0954  hypothetical protein  29.69 
 
 
184 aa  43.9  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3324  hypothetical protein  36.21 
 
 
193 aa  43.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5828  hypothetical protein  30.95 
 
 
190 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4291  protein of unknown function DUF1470  50 
 
 
166 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3480  protein of unknown function DUF1470  34.48 
 
 
193 aa  43.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1455  protein of unknown function DUF1470  30.14 
 
 
206 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6614  protein of unknown function DUF1470  31.3 
 
 
181 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216738  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1215  hypothetical protein  30.72 
 
 
207 aa  42.7  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.759773  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4029  hypothetical protein  25.6 
 
 
205 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9196  protein of unknown function DUF1470  31.63 
 
 
183 aa  41.2  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6780  protein of unknown function DUF1470  38.78 
 
 
155 aa  41.2  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0177  hypothetical protein  25.37 
 
 
190 aa  41.2  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1908  protein of unknown function DUF1470  27.01 
 
 
208 aa  40.8  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.975753  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>