39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2397 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2397  protein of unknown function DUF1470  100 
 
 
191 aa  372  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.776458  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1923  protein of unknown function DUF1470  34.59 
 
 
200 aa  75.1  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5067  hypothetical protein  32.28 
 
 
200 aa  68.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4029  hypothetical protein  31.32 
 
 
192 aa  62.8  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462167  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0559  protein of unknown function DUF1470  31.09 
 
 
197 aa  56.6  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4308  hypothetical protein  22.89 
 
 
194 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2691  protein of unknown function DUF1470  33.5 
 
 
194 aa  54.7  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0870  hypothetical protein  28.46 
 
 
194 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0926819  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0954  hypothetical protein  29.21 
 
 
184 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0998  hypothetical protein  23.5 
 
 
194 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1036  hypothetical protein  23.88 
 
 
194 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.26369e-21 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2325  hypothetical protein  26.42 
 
 
198 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0894  hypothetical protein  23.88 
 
 
194 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0853  hypothetical protein  23.88 
 
 
194 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0952  hypothetical protein  23.88 
 
 
194 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9282  hypothetical protein  33.13 
 
 
183 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4335  hypothetical protein  30.56 
 
 
178 aa  52  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1123  hypothetical protein  27.64 
 
 
194 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6614  protein of unknown function DUF1470  34.48 
 
 
181 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216738  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3480  protein of unknown function DUF1470  26.7 
 
 
193 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2428  hypothetical protein  37.89 
 
 
185 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0177  hypothetical protein  28.48 
 
 
190 aa  50.4  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3324  hypothetical protein  25.57 
 
 
193 aa  48.9  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2488  protein of unknown function DUF1470  29.83 
 
 
196 aa  48.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1908  protein of unknown function DUF1470  29.19 
 
 
208 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.975753  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5618  protein of unknown function DUF1470  32.58 
 
 
204 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.201097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2145  protein of unknown function DUF1470  31.52 
 
 
184 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4842  protein of unknown function DUF1470  40.3 
 
 
216 aa  45.1  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3071  hypothetical protein  32.1 
 
 
210 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3285  hypothetical protein  32.23 
 
 
212 aa  44.7  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0319342 
 
 
-
 
NC_003296  RS05465  hypothetical protein  30.47 
 
 
199 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889335  normal  0.0895575 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5828  hypothetical protein  30 
 
 
190 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4083  protein of unknown function DUF1470  37.5 
 
 
169 aa  42.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3685  protein of unknown function DUF1470  34.03 
 
 
183 aa  42.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1921  protein of unknown function DUF1470  26.42 
 
 
186 aa  42.4  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000367455  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1215  hypothetical protein  37.25 
 
 
207 aa  42  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.759773  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4844  hypothetical protein  29.66 
 
 
215 aa  41.6  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10336  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1541  hypothetical protein  27.85 
 
 
186 aa  41.6  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0656289  normal  0.28934 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47200  hypothetical protein  34.85 
 
 
195 aa  41.2  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>