More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0881 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0881  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 266 aa  517  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2809  regulatory protein, LuxR  43.8 
 
 		 286 aa  160  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1620  LuxR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4025  LuxR family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 300 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.449136  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2084  LuxR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 288 aa  136  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4865  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 281 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0959639 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4194  LuxR family GAF modulated transcriptional regulator  37.79 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0104113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1565  response regulator receiver protein  38.37 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4439  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.93 
 
 		 285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4526  putative GAF sensor protein  34.93 
 
 		 285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4820  putative GAF sensor protein  34.93 
 
 		 285 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0084  regulatory protein LuxR  36.92 
 
 		 267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3743  transcriptional regulator, LuxR family  39.09 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1536  LuxR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.413488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0530  transcriptional regulator, LuxR family  43.82 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  52.86 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0618  transcriptional regulator, LuxR family  49.23 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.59 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3639  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.95 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.274763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3599  LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.161431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0655  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1309  two component LuxR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  47.22 
 
 		 916 aa  59.3  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1240  two component LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2449  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.39 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5022  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 947 aa  58.9  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362862  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2932  regulatory protein, LuxR  52.31 
 
 		 919 aa  58.9  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3324  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.94 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0107044  normal  0.345616 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.48 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.00104431 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0236  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.7 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1669  two component LuxR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0544  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.71 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0807  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.54 
 
 		 228 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.218712 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3548  transcriptional regulator  50 
 
 		 924 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41810  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 901 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.51 
 
 		 226 aa  57  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1908  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.264232 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.98 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0882  LuxR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.9 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3973  putative GAF sensor protein  29.38 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.057323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29510  ATP-dependent transcriptional regulator  39.81 
 
 		 992 aa  56.6  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.611914 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  44 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1617  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1030  regulatory protein, LuxR  33.79 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.59 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0915  two component LuxR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000299753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02200  two component transcriptional regulator, LuxR family  44 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0183  two component LuxR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.541303  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2340  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.66 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.1 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1505  transcriptional regulator, LuxR family  46.88 
 
 		 522 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3055  response regulator receiver  36.59 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1627  two component LuxR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0484719  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1626  two component LuxR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.947018 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3534  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.8 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0149  DNA-binding response regulator  40.62 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1588  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.67 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1960  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  44.87 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2130  DNA-binding response regulator, LuxR family  37.1 
 
 		 222 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1940  LuxR response regulator receiver  37.1 
 
 		 222 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.95717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0087  two component transcriptional regulator, LuxR  40.54 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.197031  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2068  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.67 
 
 		 212 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.385073  normal  0.894995 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2373  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.62 
 
 		 192 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.44 
 
 		 894 aa  55.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2722  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.93 
 
 		 947 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1633  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0528  two component LuxR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 201 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.653057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 221 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4896  response regulator receiver  43.02 
 
 		 215 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.446448  normal  0.220667 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1723  two component LuxR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 240 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2539  regulatory protein, LuxR  42.25 
 
 		 904 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50873  hitchhiker  0.00362349 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0601  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.56 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1319  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0542522  decreased coverage  0.000972679 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 216 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32780  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  40.82 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1543  LuxR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 156 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.24149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0582  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6441  response regulator receiver protein  48.33 
 
 		 227 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176234  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5374  two component response regulator  40 
 
 		 779 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  44.83 
 
 		 896 aa  54.7  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  46.55 
 
 		 933 aa  54.3  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.98 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 214 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1676  two component LuxR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0647  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.47 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.518884  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4164  LuxR transcriptional regulator  49.15 
 
 		 960 aa  53.9  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950161  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0351  LuxR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 258 aa  53.5  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.637296  normal  0.0151595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0541  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.27 
 
 		 221 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.318618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  46.38 
 
 		 219 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  42.47 
 
 		 922 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2445  response regulator receiver protein  49.02 
 
 		 218 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115114  normal  0.02149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5265  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.28 
 
 		 218 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1269  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 226 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 244 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.56 
 
 		 222 aa  53.9  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>