63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0530 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0530  peptidase C60 sortase A and B  100 
 
 
298 aa  578  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0197121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1052  hypothetical protein  50.33 
 
 
291 aa  251  9.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236232  hitchhiker  0.00758039 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0528  peptidase C60 sortase A and B  49.4 
 
 
368 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0135812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1017  hypothetical protein  54.82 
 
 
284 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0916  putative secreted protein  44.55 
 
 
188 aa  167  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.998693  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2368  peptidase C60 sortase A and B  52.87 
 
 
212 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00022706  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0613  peptidase C60 sortase A and B  50.97 
 
 
178 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.405747  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1112  hypothetical protein  49.16 
 
 
192 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  0.429356 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3604  peptidase C60, sortase A and B  44.85 
 
 
225 aa  143  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.126497 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1460  peptidase C60, sortase A and B  50.31 
 
 
309 aa  143  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  decreased coverage  0.00772893 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0348  peptidase C60, sortase A and B  51.03 
 
 
214 aa  142  9e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0108508 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1719  peptidase C60 sortase A and B  50.34 
 
 
203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724245  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1734  peptidase C60, sortase A and B  51.03 
 
 
214 aa  136  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3186  peptidase C60 sortase A and B  43.79 
 
 
245 aa  135  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0385448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7838  peptidase C60 sortase A and B  46.54 
 
 
946 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0706316 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2482  peptidase C60 sortase A and B  54.19 
 
 
196 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00306249  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13180  sortase (surface protein transpeptidase)  49.34 
 
 
213 aa  134  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3534  peptidase C60, sortase A and B  47.1 
 
 
279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3978  peptidase C60 sortase A and B  45.14 
 
 
247 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107893  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3574  peptidase C60 sortase A and B  45.14 
 
 
247 aa  132  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5005  peptidase C60 sortase A and B  47.95 
 
 
347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387743  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3985  peptidase C60 sortase A and B  42.33 
 
 
223 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136335  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3164  peptidase C60 sortase A and B  46 
 
 
208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  hitchhiker  0.0000126147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8256  peptidase C60 sortase A and B  43.59 
 
 
242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3909  peptidase C60 sortase A and B  45.81 
 
 
279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.985373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1145  hypothetical protein  43.75 
 
 
187 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895027  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6891  hypothetical protein  41.56 
 
 
235 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0141  peptidase C60 sortase A and B  45.14 
 
 
216 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0428  peptidase C60 sortase A and B  43.59 
 
 
235 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4117  peptidase C60 sortase A and B  46.67 
 
 
210 aa  125  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5708  peptidase C60 sortase A and B  44.3 
 
 
167 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0157  peptidase C60 sortase A and B  44.44 
 
 
235 aa  114  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4659  peptidase C60 sortase A and B  46.21 
 
 
267 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1793  peptidase C60 sortase A and B  37.82 
 
 
276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000420005  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3106  peptidase C60 sortase A and B  44.76 
 
 
226 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.474444  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4636  peptidase C60 sortase A and B  41.1 
 
 
220 aa  100  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0567  peptidase C60 sortase A and B  37.06 
 
 
321 aa  92.8  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0474  peptidase C60 sortase A and B  39.42 
 
 
222 aa  92.4  9e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4732  peptidase C60 sortase A and B  40.56 
 
 
202 aa  89  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3472  peptidase C60 sortase A and B  37.84 
 
 
156 aa  85.9  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4206  peptidase C60, sortase A and B  38.62 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0141  peptidase C60, sortase A and B  39.44 
 
 
241 aa  79  0.00000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0373  peptidase C60 sortase A and B  33.94 
 
 
243 aa  66.6  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0221  peptidase C60, sortase A and B  32.1 
 
 
238 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2595  peptidase C60, sortase A and B  34.36 
 
 
213 aa  60.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09850  sortase (surface protein transpeptidase)  31.03 
 
 
144 aa  58.5  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.618908  normal  0.0802521 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2061  peptidase C60 sortase A and B  30.64 
 
 
194 aa  58.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.244992  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  34.82 
 
 
375 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31940  sortase family enzyme  28.87 
 
 
260 aa  53.1  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0575864  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  38.93 
 
 
197 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  37.11 
 
 
384 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4170  sortase family protein  30.98 
 
 
238 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.578913  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1131  peptidase C60 sortase A and B  30 
 
 
238 aa  49.7  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1357  sortase family protein  31.29 
 
 
235 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3728  peptidase C60, sortase A and B  33.33 
 
 
244 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00867871 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4642  sortase family protein  33.33 
 
 
302 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.068472  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0208  peptidase C60 sortase A and B  27.87 
 
 
248 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.784378  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13700  sortase (surface protein transpeptidase)  26.55 
 
 
226 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0136  peptidase C60 sortase A and B  35.96 
 
 
308 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.765085  hitchhiker  0.000446536 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3681  peptidase C60 sortase A and B  32.03 
 
 
243 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.464105  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1772  peptidase C60 sortase A and B  29.3 
 
 
228 aa  44.3  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2959  peptidase C60 sortase A and B  33.73 
 
 
298 aa  42.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0608881  hitchhiker  0.000198401 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2999  sortase family protein  37.5 
 
 
257 aa  42.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0632399  normal  0.545839 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>