More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2362 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  100 
 
 		 654 aa  1299    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  42.61 
 
 		 671 aa  499  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2449  lytic transglycosylase, catalytic  44.9 
 
 		 644 aa  486  1e-136  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  41.97 
 
 		 642 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0702  Lytic transglycosylase catalytic  43.71 
 
 		 647 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2900  lytic transglycosylase catalytic  38.74 
 
 		 657 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0233  lytic murein transglycosylase, putative  39.37 
 
 		 651 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3053  lytic transglycosylase catalytic  38.68 
 
 		 650 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0364649 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3079  lytic transglycosylase, catalytic  38.46 
 
 		 650 aa  385  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2945  lytic transglycosylase catalytic  38.3 
 
 		 650 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78067  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6381  lytic transglycosylase, catalytic  39.22 
 
 		 607 aa  382  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0198  transglycosylase  37.93 
 
 		 655 aa  382  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2420  lytic transglycosylase, catalytic  38.62 
 
 		 650 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3034  lytic transglycosylase, catalytic  38.62 
 
 		 650 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3738  Lytic transglycosylase catalytic  37.6 
 
 		 655 aa  382  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0927783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0269  Slt family transglycosylase  38.71 
 
 		 651 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3314  lytic murein transglycosylase, putative  38.71 
 
 		 651 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0453  soluble lytic murein transglycosylase  38.71 
 
 		 651 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2984  putative lytic murein transglycosylase  38.71 
 
 		 651 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.270933  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0257  Slt family transglycosylase  38.71 
 
 		 651 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3029  lytic transglycosylase catalytic  37.72 
 
 		 650 aa  379  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.361985 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3364  putative lytic murein transglycosylase  38.71 
 
 		 651 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2108  putative lytic murein transglycosylase  38.71 
 
 		 651 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  38.83 
 
 		 657 aa  375  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0088  soluble lytic murein transglycosylase precursor transmembrane protein  37.33 
 
 		 650 aa  360  3e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  38.83 
 
 		 657 aa  360  6e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0176  lytic transglycosylase, catalytic  37.44 
 
 		 655 aa  359  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.364255 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3662  Lytic transglycosylase catalytic  37.66 
 
 		 650 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.874549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0527  lytic transglycosylase, catalytic  36.54 
 
 		 693 aa  357  3.9999999999999996e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.379018 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  38.8 
 
 		 660 aa  353  5e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3339  Lytic transglycosylase catalytic  37.17 
 
 		 650 aa  353  7e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0219  lytic transglycosylase, catalytic  37.88 
 
 		 653 aa  352  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  37.08 
 
 		 653 aa  348  1e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  38.37 
 
 		 678 aa  346  1e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  37.33 
 
 		 659 aa  345  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1999  lytic transglycosylase, catalytic  35.33 
 
 		 628 aa  342  2e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  38.03 
 
 		 663 aa  338  1.9999999999999998e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0652  lytic transglycosylase, catalytic  37.01 
 
 		 707 aa  338  1.9999999999999998e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0992  Lytic transglycosylase catalytic  36.79 
 
 		 676 aa  333  6e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1715  Lytic transglycosylase catalytic  34.42 
 
 		 652 aa  330  4e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.728382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  38.27 
 
 		 690 aa  325  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  32.2 
 
 		 642 aa  260  6e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  31.56 
 
 		 660 aa  260  6e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  32.2 
 
 		 642 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1892  Lytic transglycosylase catalytic  34.39 
 
 		 643 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1874  lytic transglycosylase, catalytic  30.9 
 
 		 706 aa  251  3e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.331721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2046  lytic transglycosylase, catalytic  31.13 
 
 		 735 aa  250  7e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.490447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  31.64 
 
 		 641 aa  250  7e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  31.63 
 
 		 649 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  31.99 
 
 		 657 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1765  soluble lytic murein transglycosylase  30.93 
 
 		 739 aa  248  3e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  31.83 
 
 		 650 aa  246  8e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  31.72 
 
 		 642 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  34.48 
 
 		 661 aa  243  9e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2373  Lytic transglycosylase catalytic  32.46 
 
 		 686 aa  241  2e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  32.3 
 
 		 643 aa  239  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  29.98 
 
 		 637 aa  233  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  29.5 
 
 		 669 aa  229  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  29.03 
 
 		 643 aa  227  5.0000000000000005e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  27.09 
 
 		 663 aa  227  6e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  31.38 
 
 		 642 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  31.19 
 
 		 642 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  30.66 
 
 		 661 aa  221  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  29.45 
 
 		 649 aa  219  1e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  28.98 
 
 		 649 aa  216  8e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  28.52 
 
 		 593 aa  214  5.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  28.34 
 
 		 593 aa  213  7.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03735  putative soluble lytic murein transglycosylase  28.44 
 
 		 576 aa  212  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  29.8 
 
 		 716 aa  212  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2125  lytic transglycosylase, catalytic  28.98 
 
 		 645 aa  211  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02649  soluble lytic murein transglycosylase  30.43 
 
 		 647 aa  207  6e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.787033  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  32.31 
 
 		 661 aa  204  6e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3613  lytic murein transglycosylase  28.81 
 
 		 639 aa  200  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0817  lytic murein transglycosylase  28.28 
 
 		 639 aa  199  9e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3484  lytic murein transglycosylase  28.81 
 
 		 639 aa  199  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  30.17 
 
 		 638 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2100  lytic transglycosylase catalytic  28.96 
 
 		 641 aa  198  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.254828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2285  Lytic transglycosylase catalytic  29.27 
 
 		 641 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1863  lytic transglycosylase, catalytic  29.15 
 
 		 641 aa  197  6e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.646597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2236  lytic transglycosylase, catalytic  29.03 
 
 		 641 aa  197  6e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0654901  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2053  lytic transglycosylase catalytic  28.78 
 
 		 641 aa  197  7e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00204351  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2529  lytic transglycosylase, catalytic  27.83 
 
 		 642 aa  197  7e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2111  lytic transglycosylase, catalytic  28.85 
 
 		 641 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.396511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4559  hypothetical protein  29.09 
 
 		 641 aa  196  9e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2273  lytic transglycosylase catalytic  29.09 
 
 		 641 aa  196  9e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0553  lytic murein transglycosylase  28.81 
 
 		 645 aa  193  7e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0564  lytic murein transglycosylase  27.91 
 
 		 643 aa  193  8e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2415  lytic transglycosylase catalytic  27.99 
 
 		 643 aa  192  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.853717  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2105  lytic transglycosylase, catalytic  28.85 
 
 		 641 aa  192  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.828929  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1979  lytic transglycosylase, catalytic  28.52 
 
 		 649 aa  192  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.99613 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2040  soluble lytic murein transglycosylase, putative  28.3 
 
 		 641 aa  191  5e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0293  lytic transglycosylase, catalytic  25.96 
 
 		 637 aa  190  5.999999999999999e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4906  lytic murein transglycosylase  28.5 
 
 		 645 aa  190  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4833  lytic murein transglycosylase  28.5 
 
 		 645 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4992  lytic murein transglycosylase  28.5 
 
 		 645 aa  189  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.971097 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00998  soluble lytic murein transglycosylase  27.76 
 
 		 648 aa  189  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3871  lytic murein transglycosylase  29.25 
 
 		 644 aa  188  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.006684  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4940  lytic murein transglycosylase  28.5 
 
 		 645 aa  188  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.183926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0675  lytic murein transglycosylase  28.88 
 
 		 642 aa  188  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520462  normal  0.586863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4940  lytic murein transglycosylase  27.93 
 
 		 645 aa  187  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>