More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1295 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3483  type II secretion system protein E  62.73 
 
 		 598 aa  637    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136684  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1295  type II secretion system protein  100 
 
 		 566 aa  1138    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00227246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1434  type II secretion system protein E  63.11 
 
 		 558 aa  692    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.351728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1982  type II secretion system protein E  58.73 
 
 		 573 aa  640    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.981524  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2588  type II secretion system protein E  62.32 
 
 		 599 aa  704    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2463  type II secretion system protein E  61.9 
 
 		 596 aa  642    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1341  type II secretion system protein E  62.85 
 
 		 570 aa  690    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2419  type II secretion system protein E  61.01 
 
 		 559 aa  667    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29150  type II secretion system protein E  61.16 
 
 		 568 aa  637    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0342357  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3880  type II secretion system protein E  66.01 
 
 		 567 aa  731    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2454  type II secretion system protein E  61.61 
 
 		 557 aa  631  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2288  type II secretion system protein E  62.55 
 
 		 598 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0404074  normal  0.787377 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3223  type II secretion system protein E  62.28 
 
 		 564 aa  620  1e-176  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.354851 
 
 
-
 
NC_003296  RS02972  putative general secretion pathway GSPE-related protein  62.78 
 
 		 561 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.976775  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2308  putative GSPE-related protein  58 
 
 		 567 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.173672 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4711  type II secretion system protein E  55.99 
 
 		 568 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2614  type II secretion system protein E  56.87 
 
 		 580 aa  553  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.574914 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1924  type II secretion system protein E  56.72 
 
 		 576 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1864  type II secretion system protein E  52.2 
 
 		 573 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.468476 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1783  type IV pilus biogenesis protein PilB, putative  54.49 
 
 		 574 aa  529  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3004  type II secretion system protein E  53.28 
 
 		 573 aa  522  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000330393 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1451  type II secretion system protein E  51.71 
 
 		 574 aa  525  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2420  type II secretion system protein E  52.1 
 
 		 573 aa  520  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0131  type II secretory pathway and PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  51.08 
 
 		 578 aa  520  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1279  type II secretion system protein E  52.9 
 
 		 573 aa  519  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1684  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  60.39 
 
 		 577 aa  506  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1576  type II secretion system protein E  50.67 
 
 		 546 aa  505  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.22471  normal  0.0615675 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1433  type II secretion system protein E  51.87 
 
 		 544 aa  481  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795188  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00952  GSPE-like protein  57.29 
 
 		 414 aa  457  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.543413  normal  0.759947 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  40.11 
 
 		 871 aa  392  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  49.24 
 
 		 564 aa  374  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  40.64 
 
 		 571 aa  365  1e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.68 
 
 		 563 aa  364  2e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  40.39 
 
 		 553 aa  364  3e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  37.77 
 
 		 570 aa  362  7.0000000000000005e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29490  putative type II secretion protein  39.52 
 
 		 575 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.39 
 
 		 568 aa  360  3e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  39.53 
 
 		 578 aa  360  5e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  40.33 
 
 		 561 aa  359  8e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.49 
 
 		 568 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.49 
 
 		 568 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  46.3 
 
 		 520 aa  357  2.9999999999999997e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  39.93 
 
 		 553 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  38.31 
 
 		 568 aa  357  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  38.57 
 
 		 553 aa  354  2e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  38.33 
 
 		 555 aa  353  4e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  45.75 
 
 		 575 aa  353  5e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  38.59 
 
 		 554 aa  353  5.9999999999999994e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  40.28 
 
 		 585 aa  352  1e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  37.37 
 
 		 571 aa  351  2e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.32 
 
 		 571 aa  350  3e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  41 
 
 		 553 aa  350  3e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  37 
 
 		 568 aa  350  5e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  37.61 
 
 		 558 aa  350  6e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  45.8 
 
 		 520 aa  349  8e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  42.5 
 
 		 578 aa  348  1e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  37.69 
 
 		 568 aa  348  2e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16170  type II secretion system protein E, GspE  40.19 
 
 		 569 aa  347  4e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  47.19 
 
 		 521 aa  347  4e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  45.07 
 
 		 499 aa  345  1e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  42.89 
 
 		 520 aa  345  1e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  39.1 
 
 		 552 aa  345  1e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  36.5 
 
 		 565 aa  345  1e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.56 
 
 		 568 aa  345  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  36.48 
 
 		 563 aa  344  2e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  36.17 
 
 		 558 aa  344  2.9999999999999997e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.05 
 
 		 568 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.59 
 
 		 568 aa  343  4e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.88 
 
 		 568 aa  343  5e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  39.71 
 
 		 556 aa  342  1e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  36.12 
 
 		 562 aa  342  1e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  42.93 
 
 		 577 aa  341  2e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  37.16 
 
 		 573 aa  341  2e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  41.19 
 
 		 580 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2079  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.78 
 
 		 578 aa  340  2.9999999999999998e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292786 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  46.84 
 
 		 503 aa  340  4e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3438  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.02 
 
 		 569 aa  340  4e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.141365  normal  0.083139 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  42.42 
 
 		 563 aa  340  5e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2030  general secretion pathway protein E  43.15 
 
 		 502 aa  339  7e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  41.6 
 
 		 521 aa  339  8e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4205  general secretory pathway protein E  41.6 
 
 		 521 aa  339  8e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0150  general secretory pathway protein E  41.6 
 
 		 521 aa  339  8e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  40.11 
 
 		 577 aa  339  9e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2071  ATPase  42 
 
 		 666 aa  339  9e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  45.55 
 
 		 500 aa  339  9.999999999999999e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  40 
 
 		 560 aa  338  9.999999999999999e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4695  type II secretion system protein E  42.56 
 
 		 668 aa  339  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.912927 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23990  general secretion pathway protein E  43.15 
 
 		 502 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  46.17 
 
 		 514 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  37.48 
 
 		 577 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  44.14 
 
 		 577 aa  338  1.9999999999999998e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0154  general secretory pathway protein E  41.41 
 
 		 521 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0425  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.54 
 
 		 569 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00261577  hitchhiker  0.000552387 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1022  type II secretion system protein E  42.34 
 
 		 554 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0392  type II secretion system protein E  37.1 
 
 		 586 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2648  type II secretion system protein E  46.04 
 
 		 579 aa  337  3.9999999999999995e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0969268  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  39.36 
 
 		 574 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2210  general secretory pathway protein E  40.16 
 
 		 477 aa  337  5e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1731  type II secretion system protein E  42.64 
 
 		 561 aa  336  5.999999999999999e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0239334 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0376  type II secretion system protein E  34.55 
 
 		 670 aa  336  7e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>