More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0510 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0500  extracellular solute-binding protein  57.54 
 
 		 643 aa  758    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.464453  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0510  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 655 aa  1337    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00108617  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1677  extracellular solute-binding protein  58.14 
 
 		 655 aa  759    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224475  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1687  extracellular solute-binding protein  55.07 
 
 		 664 aa  673    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.789812  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0293  extracellular solute-binding protein family 5  47.76 
 
 		 640 aa  574  1.0000000000000001e-162  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.835457  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1703  extracellular solute-binding protein family 5  46.18 
 
 		 638 aa  558  1e-158  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0608  extracellular solute-binding protein  42.2 
 
 		 658 aa  489  1e-137  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0360846  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0622  extracellular solute-binding protein  42.2 
 
 		 658 aa  488  1e-136  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.16709  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0890  extracellular solute-binding protein  42.66 
 
 		 657 aa  478  1e-133  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0868  extracellular solute-binding protein  42.17 
 
 		 657 aa  473  1e-132  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5515  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  38.64 
 
 		 633 aa  413  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171495  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2454  extracellular solute-binding protein  37.44 
 
 		 682 aa  390  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39331 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5255  extracellular solute-binding protein family 5  34.25 
 
 		 651 aa  348  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.313455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5178  extracellular solute-binding protein family 5  33.87 
 
 		 645 aa  332  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758105  normal  0.361664 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4483  twin-arginine translocation pathway signal  34.09 
 
 		 686 aa  331  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5555  extracellular solute-binding protein  35.68 
 
 		 642 aa  325  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140103  normal  0.0740019 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5447  extracellular solute-binding protein family 5  32.59 
 
 		 645 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390622 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3373  extracellular solute-binding protein family 5  33.07 
 
 		 641 aa  313  9e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0279191  normal  0.223354 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4593  extracellular solute-binding protein  33.71 
 
 		 633 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.996188 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5700  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  31.09 
 
 		 638 aa  300  6e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0714934  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5971  extracellular solute-binding protein family 5  32.23 
 
 		 635 aa  292  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.989436  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0309  extracellular solute-binding protein family 5  32.55 
 
 		 765 aa  290  4e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7124  extracellular solute-binding protein family 5  32.24 
 
 		 635 aa  290  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.104115  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1805  extracellular solute-binding protein family 5  32.38 
 
 		 659 aa  288  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1530  extracellular solute-binding protein family 5  32.54 
 
 		 656 aa  287  4e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3683  extracellular solute-binding protein  33.6 
 
 		 639 aa  283  1e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.378617  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14300  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.56 
 
 		 671 aa  282  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.860083 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1927  extracellular solute-binding protein family 5  32.02 
 
 		 735 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3931  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  32.23 
 
 		 626 aa  268  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7228  extracellular solute-binding protein family 5  31.06 
 
 		 664 aa  260  6e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0309461  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2113  extracellular solute-binding protein family 5  31.44 
 
 		 729 aa  260  6e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0745668  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2808  extracellular solute-binding protein  30.91 
 
 		 727 aa  253  6e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2424  extracellular solute-binding protein  30.76 
 
 		 728 aa  252  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.935396 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6476  extracellular solute-binding protein  30.93 
 
 		 643 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.864629 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3050  extracellular solute-binding protein  31.35 
 
 		 757 aa  244  5e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0190244  normal  0.13375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2110  extracellular solute-binding protein  30.32 
 
 		 735 aa  243  7e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2830  extracellular solute-binding protein  33.08 
 
 		 655 aa  238  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108136  normal  0.289716 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0595  extracellular solute-binding protein family 5  31.3 
 
 		 645 aa  227  5.0000000000000005e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3160  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  27.89 
 
 		 679 aa  220  6e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4140  extracellular solute-binding protein  28.71 
 
 		 693 aa  187  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0860796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5120  ABC transporter substrate binding protein (alpha-galactoside)  28.87 
 
 		 695 aa  171  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0244807  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6877  extracellular solute-binding protein family 5  26.69 
 
 		 695 aa  163  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0668794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5907  extracellular solute-binding protein family 5  26.48 
 
 		 696 aa  159  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2595  extracellular solute-binding protein family 5  28.94 
 
 		 589 aa  156  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1660  extracellular solute-binding protein family 5  30.48 
 
 		 589 aa  145  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.299882  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 		 580 aa  142  3e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1663  extracellular solute-binding protein family 5  29.77 
 
 		 578 aa  140  8.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397427  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2510  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 		 584 aa  138  4e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.543923  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 		 595 aa  137  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  29.87 
 
 		 584 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2592  extracellular solute-binding protein family 5  30.65 
 
 		 573 aa  133  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 		 591 aa  132  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1832  extracellular solute-binding protein family 5  29 
 
 		 587 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315611  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1172  family 1 extracellular solute-binding protein  26.31 
 
 		 594 aa  122  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  25.61 
 
 		 607 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1326  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 		 587 aa  120  7e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000186412  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1182  extracellular solute-binding protein family 5  26.6 
 
 		 581 aa  119  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1386  extracellular solute-binding protein  27.3 
 
 		 578 aa  118  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  25.23 
 
 		 607 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  25.53 
 
 		 587 aa  114  6e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1344  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 638 aa  106  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.439366 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 		 539 aa  106  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 538 aa  103  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1367  extracellular solute-binding protein family 5  25.13 
 
 		 577 aa  99.8  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0090511  hitchhiker  0.000580883 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1564  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 578 aa  99.8  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00697686  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  22.96 
 
 		 627 aa  95.9  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0337  extracellular solute-binding protein family 5  25.11 
 
 		 581 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  22.5 
 
 		 545 aa  95.5  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1273  extracellular solute-binding protein family 5  24.64 
 
 		 593 aa  95.5  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0390  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 		 579 aa  94.4  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2270  extracellular solute-binding protein family 5  25.59 
 
 		 580 aa  94.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2321  extracellular solute-binding protein family 5  25.59 
 
 		 580 aa  94.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.815964 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1494  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 526 aa  94.4  6e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  23.4 
 
 		 580 aa  94  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1563  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 		 588 aa  94  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  0.279007 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0567  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.18 
 
 		 592 aa  93.2  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0542  extracellular solute-binding protein family 5  23.61 
 
 		 537 aa  93.6  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578152 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  25.31 
 
 		 533 aa  93.6  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0406  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 579 aa  93.2  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.18 
 
 		 538 aa  92.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  24.49 
 
 		 551 aa  92.8  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  23.21 
 
 		 579 aa  92.4  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0398  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.53 
 
 		 527 aa  92.4  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  24.81 
 
 		 534 aa  92  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1143  extracellular solute-binding protein family 5  24.04 
 
 		 577 aa  91.7  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0057674  normal  0.283725 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 		 510 aa  91.3  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0551  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 591 aa  90.9  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  26.18 
 
 		 540 aa  90.5  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  24.57 
 
 		 544 aa  89.7  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0418  extracellular solute-binding protein family 5  25.89 
 
 		 622 aa  89.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  25.9 
 
 		 534 aa  88.6  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4599  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 		 621 aa  88.6  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.593059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  23.54 
 
 		 546 aa  87.8  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0587  extracellular solute-binding protein family 5  25.32 
 
 		 534 aa  87.4  8e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 522 aa  87  9e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  24.06 
 
 		 544 aa  87  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3074  extracellular solute-binding protein family 5  25.51 
 
 		 621 aa  85.9  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000149398  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  23.54 
 
 		 548 aa  86.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2382  peptide ABC transporter  25.71 
 
 		 560 aa  85.9  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  23.89 
 
 		 544 aa  85.5  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>