More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1275 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1275  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  613  9.999999999999999e-175  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1195  hypothetical protein  82.67 
 
 		 329 aa  425  1e-118  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16401  permease  69.97 
 
 		 333 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.199558 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  29.67 
 
 		 340 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  33.01 
 
 		 382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  32.13 
 
 		 349 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07191  permease  29.74 
 
 		 359 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0518  hypothetical protein  34.22 
 
 		 387 aa  153  4e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4793  hypothetical protein  32.15 
 
 		 344 aa  150  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0134  hypothetical protein  25.85 
 
 		 358 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3863  hypothetical protein  33.63 
 
 		 347 aa  143  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.596541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07661  permease  26.78 
 
 		 358 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0677332 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  30.77 
 
 		 379 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3434  protein of unknown function UPF0118  31.94 
 
 		 345 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2670  protein of unknown function UPF0118  31.94 
 
 		 345 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1078  protein of unknown function UPF0118  30.12 
 
 		 336 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16391  permease  32.45 
 
 		 360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.216071 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  29.04 
 
 		 372 aa  130  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1196  hypothetical protein  32.42 
 
 		 359 aa  125  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09331  permease  25.22 
 
 		 347 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3895  hypothetical protein  32.1 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467618  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  32.22 
 
 		 364 aa  123  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0873  hypothetical protein  26.99 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.475897  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09321  permease  24.64 
 
 		 347 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3369  protein of unknown function UPF0118  28.57 
 
 		 344 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2742  protein of unknown function UPF0118  28.57 
 
 		 344 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  unclonable  0.00000000268058 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10101  permease  25.86 
 
 		 347 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0340  hypothetical protein  34.28 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5210  protein of unknown function UPF0118  31.32 
 
 		 345 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144016 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1450  hypothetical protein  29.68 
 
 		 350 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.996482  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1984  hypothetical protein  33.96 
 
 		 340 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372704  normal  0.185401 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2554  hypothetical protein  32.62 
 
 		 356 aa  106  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2262  hypothetical protein  26.76 
 
 		 381 aa  103  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141033  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1787  protein of unknown function UPF0118  35.64 
 
 		 392 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190485  normal  0.0890558 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1508  hypothetical protein  35.64 
 
 		 401 aa  100  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0662165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1508  protein of unknown function UPF0118  35.11 
 
 		 395 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  30.42 
 
 		 372 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1905  hypothetical protein  34.78 
 
 		 379 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.358826 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0956  hypothetical protein  29.21 
 
 		 349 aa  97.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0392869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  29.45 
 
 		 443 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0915  hypothetical protein  26.63 
 
 		 346 aa  96.3  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4216  hypothetical protein  35.93 
 
 		 346 aa  95.1  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  27.25 
 
 		 381 aa  93.2  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0581  protein of unknown function UPF0118  37.5 
 
 		 357 aa  89.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.96457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3439  hypothetical protein  28.93 
 
 		 370 aa  86.7  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.242294 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1274  hypothetical protein  32.14 
 
 		 359 aa  86.3  6e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.094175  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  26.84 
 
 		 529 aa  86.3  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4585  putative transport protein/permease  25.81 
 
 		 382 aa  86.3  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  27.19 
 
 		 357 aa  84.3  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3110  protein of unknown function UPF0118  31.03 
 
 		 383 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  28.24 
 
 		 371 aa  82.4  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0783  hypothetical protein  32.29 
 
 		 365 aa  82  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.930721  normal  0.646408 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  23.1 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  26.16 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  25.96 
 
 		 348 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  29.43 
 
 		 388 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  23.55 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  31.03 
 
 		 397 aa  79.7  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1751  hypothetical protein  35.68 
 
 		 353 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.903333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0244  protein of unknown function UPF0118  29.97 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2675  hypothetical protein  29.56 
 
 		 391 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173775  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2922  protein of unknown function UPF0118  27.54 
 
 		 357 aa  79  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.512956  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  27.92 
 
 		 353 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  27.92 
 
 		 353 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  28.93 
 
 		 354 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  27.92 
 
 		 353 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  27.92 
 
 		 353 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  27.92 
 
 		 353 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2711  hypothetical protein  28.57 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.569285 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  27.92 
 
 		 353 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  27.92 
 
 		 353 aa  78.2  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  27.92 
 
 		 353 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  27.92 
 
 		 353 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2700  hypothetical protein  30.1 
 
 		 368 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0306531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  28.08 
 
 		 362 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  28.08 
 
 		 355 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  28.08 
 
 		 355 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  28.08 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  25.65 
 
 		 438 aa  75.5  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  28.08 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2977  hypothetical protein  27.89 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4286  hypothetical protein  31.19 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  29.34 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4330  protein of unknown function UPF0118  25.9 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2899  hypothetical protein  24.5 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  29.24 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1742  putative permease PerM  26.02 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  23.95 
 
 		 390 aa  72  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  26.3 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  28.69 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  24.18 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0554  hypothetical protein  20.32 
 
 		 366 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  23.31 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  24.62 
 
 		 375 aa  71.2  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  26.69 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0456  protein of unknown function UPF0118  28.34 
 
 		 460 aa  70.5  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.204189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0225  protein of unknown function UPF0118  21.68 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651141  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1113  hypothetical protein  29.07 
 
 		 363 aa  70.9  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0939063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  23.41 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0568  hypothetical protein  20.13 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>