More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1258 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1258  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 158 aa  307  2.9999999999999997e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16531  lipoprotein signal peptidase  57.05 
 
 		 165 aa  174  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.710647 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1211  lipoprotein signal peptidase  64.1 
 
 		 163 aa  152  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07781  lipoprotein signal peptidase  48.99 
 
 		 178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.246414  normal  0.0597023 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2475  lipoprotein signal peptidase  42.47 
 
 		 158 aa  104  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10211  putative lipoprotein signal peptidase  48.65 
 
 		 158 aa  103  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.148717  normal  0.209845 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  41.67 
 
 		 165 aa  101  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  41.98 
 
 		 157 aa  98.6  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09461  lipoprotein signal peptidase  39.61 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.268315  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  37.27 
 
 		 169 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0146  lipoprotein signal peptidase  49.59 
 
 		 161 aa  88.6  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4193  lipoprotein signal peptidase  43.7 
 
 		 173 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1726  lipoprotein signal peptidase  39.69 
 
 		 163 aa  88.2  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.88791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  36.02 
 
 		 169 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0139  lipoprotein signal peptidase  38.76 
 
 		 157 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000441491 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0142  lipoprotein signal peptidase  37.98 
 
 		 157 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4973  lipoprotein signal peptidase  41.98 
 
 		 160 aa  85.1  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0928  lipoprotein signal peptidase  39.44 
 
 		 148 aa  83.6  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1366  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0885  lipoprotein signal peptidase  34.19 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0111972  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1374  lipoprotein signal peptidase  40.41 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000912047  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  36.81 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06350  lipoprotein signal peptidase  34.75 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.27868  normal  0.129428 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1558  lipoprotein signal peptidase  39.47 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.714607  decreased coverage  0.00460941 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  39.22 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  37.78 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  32.9 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0553  lipoprotein signal peptidase  34.21 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0422697  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  32.26 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09981  lipoprotein signal peptidase  38.57 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0555  lipoprotein signal peptidase  38.26 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.803857  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  34.97 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  35.56 
 
 		 364 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  34.97 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0710  lipoprotein signal peptidase  38.26 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108511 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1185  lipoprotein signal peptidase  38.3 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021108  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  37.32 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  35.21 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10890  lipoprotein signal peptidase  34.97 
 
 		 201 aa  73.9  0.0000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280945  unclonable  0.00000000228732 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  32.14 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  35.22 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  34.39 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  35.25 
 
 		 358 aa  72.8  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  38.33 
 
 		 154 aa  72  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  37.21 
 
 		 181 aa  72  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  38.33 
 
 		 154 aa  72  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  34.18 
 
 		 173 aa  72  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0840  lipoprotein signal peptidase  34.96 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0174607 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  38.02 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1155  lipoprotein signal peptidase II  37.96 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0136608  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  30.72 
 
 		 164 aa  70.5  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  41.01 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0281  lipoprotein signal peptidase  40.3 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0645052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3783  lipoprotein signal peptidase  37.04 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.800649  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  35.62 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1015  lipoprotein signal peptidase  34.18 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000214304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  31.45 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  32.41 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  37.76 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  40.14 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  31.33 
 
 		 359 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1234  lipoprotein signal peptidase  34.21 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  31.33 
 
 		 359 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  36.11 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  35.42 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0255  lipoprotein signal peptidase  38.89 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385605  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3017  lipoprotein signal peptidase  42.5 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0853  signal peptidase II  36.57 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4558  lipoprotein signal peptidase  34.97 
 
 		 171 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  31.13 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  31.47 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  34.93 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  38.26 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  34.16 
 
 		 224 aa  67.4  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1081  lipoprotein signal peptidase  33.59 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  33.79 
 
 		 150 aa  67  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  35.66 
 
 		 178 aa  67  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  33.75 
 
 		 182 aa  67  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0645  lipoprotein signal peptidase  34.03 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  37.76 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0604  lipoprotein signal peptidase  34.03 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975545  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  33.57 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  32.62 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3937  lipoprotein signal peptidase  31.39 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  34.31 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  34.62 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  32 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0614  lipoprotein signal peptidase  33.9 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.107984 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  36.03 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  34.27 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  31.41 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  32.24 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  35.56 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>