More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0975 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0975  short-chain dehydrogenase/reductase  100 
 
 		 221 aa  448  1e-125  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.264766  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1087  short-chain dehydrogenase/reductase  69.68 
 
 		 221 aa  295  4e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.236682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14521  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  60.18 
 
 		 221 aa  288  6e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00861762 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.9 
 
 		 221 aa  283  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.424112  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07591  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  61.54 
 
 		 221 aa  277  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01071  Short-chain dehydrogenases of various substrate specificities  58.82 
 
 		 221 aa  269  2e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.315767  normal  0.657338 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07551  short-chain dehydrogenase/reductase  57.92 
 
 		 221 aa  268  5e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1408  short-chain dehydrogenase/reductase family protein  58.37 
 
 		 224 aa  267  7e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.417919  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0705  short-chain dehydrogenase/reductase  57.92 
 
 		 221 aa  266  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.096337  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07571  short-chain dehydrogenase/reductase  57.92 
 
 		 221 aa  265  4e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08791  short-chain dehydrogenase/reductase  54.3 
 
 		 221 aa  246  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.96 
 
 		 223 aa  235  5.0000000000000005e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.36 
 
 		 223 aa  229  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0124  short chain dehydrogenase family protein  54.13 
 
 		 219 aa  228  8e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.635136  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4308  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  50.22 
 
 		 230 aa  207  9e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.58 
 
 		 223 aa  205  5e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01860  Short chain dehydrogenase family protein  48.4 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.42 
 
 		 223 aa  191  6e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.85459  normal  0.0309227 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1267  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.16 
 
 		 232 aa  166  4e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.139748 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0735  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.76 
 
 		 233 aa  162  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.965519  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2690  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.88 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.608582  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2459  csgA protein  44.21 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.54228  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2239  short chain dehydrogenase  41.13 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.09 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0036356  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1469  short-chain dehydrogenase/reductase  37.83 
 
 		 234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.57 
 
 		 231 aa  135  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1945  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 		 227 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.31 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.909495 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002919  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 229 aa  126  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1598  putative oxidoreductase protein  38.79 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.91 
 
 		 233 aa  121  8e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 		 231 aa  121  9e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.110275 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.16 
 
 		 231 aa  121  9e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.115059  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0979  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.13 
 
 		 232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0139  short chain dehydrogenase  38.7 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02810  hypothetical protein  38.79 
 
 		 247 aa  118  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1086  short chain dehydrogenase  36.13 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0107  short chain dehydrogenase  37.77 
 
 		 226 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.950091 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35363  predicted protein  34.31 
 
 		 253 aa  112  5e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.267844  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_10348  predicted protein  38.62 
 
 		 193 aa  111  8.000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03037  hypothetical protein  40.11 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2058  short chain dehydrogenase / reductase  39.01 
 
 		 221 aa  105  7e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.252145 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.32 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.7 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0229  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.33 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707447  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 256 aa  96.3  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00155018 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.28 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03161  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family superfamily (AFU_orthologue; AFUA_3G13450)  30.47 
 
 		 257 aa  94.7  9e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.560163  normal  0.771081 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0133  short chain dehydrogenase  32.9 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.17 
 
 		 228 aa  94  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.97281  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.91 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.44 
 
 		 228 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0722078 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3190  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 217 aa  92.8  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122274  normal  0.0405726 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3702  short chain dehydrogenase  33.04 
 
 		 227 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0819  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.18 
 
 		 228 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0125  short chain dehydrogenase  32.47 
 
 		 237 aa  92  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.330397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4571  short chain dehydrogenase  32.02 
 
 		 228 aa  92  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000728936  hitchhiker  0.00656486 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 258 aa  91.7  9e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3390  short chain dehydrogenase  29.6 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.47762 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03636  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family protein  30.38 
 
 		 241 aa  90.1  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.246288  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1118  C factor cell-cell signaling protein  33.16 
 
 		 259 aa  90.1  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.452189 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3970  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.4 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000119913  decreased coverage  0.00103281 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0460  short chain dehydrogenase  35.22 
 
 		 225 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.790746 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3129  short chain dehydrogenase  29.6 
 
 		 226 aa  89.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00830  cytoplasm protein, putative  28.26 
 
 		 260 aa  89.4  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0083  C factor  32.77 
 
 		 232 aa  89.4  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 		 248 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0592  short chain dehydrogenase  31.14 
 
 		 228 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.23035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3424  hypothetical protein  32.77 
 
 		 264 aa  88.6  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0632  short chain dehydrogenase  31.14 
 
 		 228 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000159867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000794  cell-cell signaling protein C-factor  31.36 
 
 		 235 aa  87.4  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0637  short chain dehydrogenase  31.86 
 
 		 228 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000253756 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3270  short chain dehydrogenase  28.7 
 
 		 226 aa  87.8  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.58 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1301  C factor cell-cell signaling protein  32.65 
 
 		 263 aa  87  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11130  short chain dehydrogenase  32.19 
 
 		 229 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0275  short chain dehydrogenase  34.33 
 
 		 236 aa  85.9  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0287555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2314  short chain dehydrogenase  33.48 
 
 		 225 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2943  short chain dehydrogenase  33.48 
 
 		 225 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2928  short chain dehydrogenase  33.48 
 
 		 225 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33463  short-chain alcohol dehydrogenase with NAD or NADP as acceptor  32.05 
 
 		 277 aa  85.9  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0120  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 		 256 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.28 
 
 		 233 aa  85.5  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0074  C factor cell-cell signaling protein  27.98 
 
 		 253 aa  85.5  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7188  putative glucose/ribitol dehydrogenase  39.51 
 
 		 254 aa  85.5  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.623309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 		 217 aa  85.5  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.325387 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2727  C-factor, putative  34.27 
 
 		 256 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0232972  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3642  CsgA, Rossman fold oxidoreductase  33.33 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36622  Predicted short chain-type dehydrogenase  29.6 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.329508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2584  short chain dehydrogenase  31.43 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.567266 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.66 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0676  short chain dehydrogenase  30.49 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000931099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.86 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2840  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.703441  normal  0.858614 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4256  short chain dehydrogenase  33.62 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.55035  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>