More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0312 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0312  thymidylate kinase  100 
 
 
209 aa  420  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  71.15 
 
 
209 aa  304  8.000000000000001e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26491  thymidylate kinase  63.59 
 
 
216 aa  256  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01441  thymidylate kinase  54.07 
 
 
215 aa  244  8e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.65977 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  52.45 
 
 
212 aa  235  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  51.96 
 
 
212 aa  234  9e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01581  thymidylate kinase  49.28 
 
 
210 aa  229  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.978183  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  50.49 
 
 
212 aa  228  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1496  thymidylate kinase  53.59 
 
 
211 aa  226  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0919131  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02021  thymidylate kinase  53.11 
 
 
211 aa  221  4e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.409154  normal  0.831835 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  50 
 
 
215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  48.1 
 
 
211 aa  179  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  47.6 
 
 
225 aa  171  5.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  44.76 
 
 
209 aa  168  5e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  40.29 
 
 
204 aa  162  3e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  45.54 
 
 
213 aa  158  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  44.2 
 
 
234 aa  158  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  44.34 
 
 
207 aa  158  6e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  45.28 
 
 
213 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  43.87 
 
 
215 aa  157  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  44.76 
 
 
212 aa  155  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  45.75 
 
 
210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  46.23 
 
 
210 aa  153  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  45.19 
 
 
200 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  44.17 
 
 
217 aa  154  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  43.96 
 
 
203 aa  152  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  42.03 
 
 
207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  45.28 
 
 
210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  44.1 
 
 
207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  39.51 
 
 
199 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  48.11 
 
 
217 aa  151  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  47.28 
 
 
212 aa  150  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  39.02 
 
 
197 aa  150  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  41.23 
 
 
221 aa  149  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  44.55 
 
 
688 aa  149  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  46.15 
 
 
686 aa  148  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  40.58 
 
 
207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  43.27 
 
 
686 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  43.5 
 
 
208 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  41.46 
 
 
206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  39.81 
 
 
214 aa  145  3e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  45.71 
 
 
205 aa  146  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  36.67 
 
 
203 aa  145  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  44.68 
 
 
233 aa  145  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  41.33 
 
 
217 aa  145  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  40.98 
 
 
206 aa  145  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  43.13 
 
 
217 aa  145  6e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  43.13 
 
 
217 aa  144  7.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  45.93 
 
 
207 aa  144  8.000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  40.48 
 
 
206 aa  144  9e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  44.44 
 
 
210 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  40.19 
 
 
203 aa  143  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  40.1 
 
 
205 aa  143  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  41.98 
 
 
225 aa  142  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  41.26 
 
 
206 aa  142  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  41.26 
 
 
206 aa  142  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  43.15 
 
 
223 aa  142  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  45.07 
 
 
210 aa  141  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  37.44 
 
 
212 aa  141  7e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  43.66 
 
 
210 aa  141  8e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  40.49 
 
 
206 aa  141  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  43.22 
 
 
901 aa  140  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  39.81 
 
 
206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  44.76 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  40.78 
 
 
206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  43.65 
 
 
210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  37.44 
 
 
212 aa  139  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  40.67 
 
 
204 aa  139  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  42.25 
 
 
213 aa  139  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  40.29 
 
 
206 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  40.29 
 
 
206 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  40.29 
 
 
206 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2802  thymidylate kinase  40.28 
 
 
219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100646  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  44.1 
 
 
209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  40.18 
 
 
219 aa  138  6e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2498  thymidylate kinase  40.7 
 
 
219 aa  138  6e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00108643  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1461  dTMP kinase  40.69 
 
 
203 aa  138  6e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  49.15 
 
 
213 aa  138  6e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  44.5 
 
 
212 aa  138  7e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  39.6 
 
 
217 aa  138  7e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  42.45 
 
 
206 aa  137  7.999999999999999e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  43.84 
 
 
207 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  41.9 
 
 
211 aa  137  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  39.5 
 
 
208 aa  137  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  45.11 
 
 
216 aa  137  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  40.95 
 
 
212 aa  137  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  39.71 
 
 
223 aa  136  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  43.58 
 
 
211 aa  137  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  44.83 
 
 
214 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  45.23 
 
 
224 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  39.71 
 
 
223 aa  136  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  43.27 
 
 
671 aa  136  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  42.86 
 
 
705 aa  136  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  41.55 
 
 
205 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  42.79 
 
 
688 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  41.04 
 
 
222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  46.11 
 
 
707 aa  135  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  44.1 
 
 
214 aa  135  5e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  40.67 
 
 
234 aa  135  6.0000000000000005e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  42.65 
 
 
703 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>