233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2502 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2502  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  743    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.507952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0405  membrane-fusion protein  30.05 
 
 		 422 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.390525  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0093  membrane-fusion protein  28.64 
 
 		 422 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.149408  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0871  hypothetical protein  27.37 
 
 		 372 aa  144  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1130  secretion protein HlyD  35.11 
 
 		 481 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.522497  normal  0.0570738 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3039  secretion protein HlyD  33.1 
 
 		 509 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598574  normal  0.745605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0894  chromosome segregation ATPase-like protein  31.68 
 
 		 666 aa  127  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0111  hypothetical protein  26.72 
 
 		 312 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1754  secretion protein HlyD family protein  34.18 
 
 		 486 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0938  secretion protein HlyD family protein  29.31 
 
 		 464 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000158667  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6117  type I secretion adaptor protein  27.21 
 
 		 439 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3121  secretion protein HlyD family protein  24.4 
 
 		 498 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2229  hypothetical protein  28.57 
 
 		 169 aa  63.9  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.513911  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0225  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.05 
 
 		 347 aa  59.3  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.175978  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2225  secretion protein HlyD family protein  26.8 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818643  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3549  secretion protein HlyD family protein  26.8 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5897  multidrug resistance protein  25.78 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1312  RND family efflux transporter MFP subunit  31.46 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1730  secretion protein HlyD  25.29 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68130  multidrug resistance protein  25.33 
 
 		 394 aa  57  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00130699  normal  0.0310617 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2373  secretion protein HlyD family protein  26.8 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1842  secretion protein HlyD family protein  25.75 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0372122  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2220  RND family efflux transporter MFP subunit  28.32 
 
 		 399 aa  55.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1658  secretion protein HlyD family protein  25.23 
 
 		 330 aa  55.8  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2021  secretion protein HlyD family protein  23.55 
 
 		 413 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0240231 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2750  secretion protein HlyD  24.24 
 
 		 399 aa  54.7  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  24.83 
 
 		 489 aa  54.3  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1814  RND family efflux transporter MFP subunit  25.57 
 
 		 432 aa  54.3  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3748  multidrug resistance protein  26.64 
 
 		 402 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.155411  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.62 
 
 		 388 aa  53.9  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  29.34 
 
 		 380 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3061  secretion protein HlyD family protein  26.35 
 
 		 424 aa  53.5  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.404759  normal  0.464933 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3643  secretion protein HlyD  25.82 
 
 		 400 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.870857  normal  0.0330116 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5441  secretion protein HlyD  28.22 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649906 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5875  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.21 
 
 		 407 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0636  secretion protein HlyD family protein  23.64 
 
 		 329 aa  52.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0903899  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.33 
 
 		 428 aa  52.4  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1325  RND family efflux transporter MFP subunit  28.22 
 
 		 370 aa  52.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.784041  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0758  macrolide-specific efflux protein MacA  26.64 
 
 		 394 aa  52.4  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0225012  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3278  hypothetical protein  27.5 
 
 		 374 aa  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0031  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.13 
 
 		 392 aa  51.6  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  38.37 
 
 		 470 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2928  secretion protein HlyD  25.51 
 
 		 347 aa  51.6  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7039  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  27.14 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2071  RND efflux system membrane fusion protein  29.9 
 
 		 407 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  38.37 
 
 		 475 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3408  RND family efflux transporter MFP subunit  29.35 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128497  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  38.37 
 
 		 475 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16591  ABC transporter  25.09 
 
 		 294 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.501795 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  25.42 
 
 		 414 aa  51.2  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  25.37 
 
 		 417 aa  50.8  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2160  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.21 
 
 		 390 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.337788  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0859  HlyD family secretion protein  23.79 
 
 		 372 aa  50.4  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.585057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0635  RND family efflux transporter MFP subunit  23.39 
 
 		 406 aa  50.4  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.320707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2877  secretion protein HlyD  26.8 
 
 		 383 aa  50.4  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1080  MacA  26.53 
 
 		 394 aa  50.4  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0607  RND family efflux transporter MFP subunit  23.39 
 
 		 406 aa  50.4  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2951  secretion protein HlyD family protein  29.7 
 
 		 365 aa  50.1  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0916  HlyD family secretion protein  23.79 
 
 		 372 aa  50.4  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8164  secretion protein HlyD family protein  23.64 
 
 		 443 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2468  secretion protein HlyD family protein  21.05 
 
 		 393 aa  50.1  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.74 
 
 		 380 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2583  secretion protein HlyD family protein  26.9 
 
 		 437 aa  50.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.860708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  26.72 
 
 		 389 aa  50.1  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  27.89 
 
 		 390 aa  50.1  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0858  efflux pump membrane protein  25.19 
 
 		 391 aa  50.1  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4209  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.49 
 
 		 392 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.64 
 
 		 390 aa  49.7  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4301  secretion protein HlyD  26.21 
 
 		 335 aa  49.7  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1278  secretion protein HlyD  26.87 
 
 		 370 aa  49.7  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0363804  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5521  secretion protein HlyD family protein  40.7 
 
 		 468 aa  49.7  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0734962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2584  CzcB subfamily membrane fusion protein  25.44 
 
 		 409 aa  49.7  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0656  bacteriocin ABC transporter, putative  22.25 
 
 		 370 aa  49.7  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.2243  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.9 
 
 		 465 aa  49.7  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.9 
 
 		 465 aa  49.7  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2261  secretion protein HlyD family protein  26.47 
 
 		 408 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0232169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0118  hemolysin secretion protein-like  22.08 
 
 		 417 aa  48.9  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00640851  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0393  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.88 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3112  RND family efflux transporter MFP subunit  30.11 
 
 		 374 aa  49.3  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  26.94 
 
 		 397 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1047  RND family efflux transporter subunit MFP  26.87 
 
 		 461 aa  48.5  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0423833  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.51 
 
 		 379 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.75 
 
 		 468 aa  48.5  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1082  putative ABC transport system, lipoprotein  25 
 
 		 302 aa  48.5  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1763  Membrane Fusion Protein cluster 2 protein  25.53 
 
 		 520 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.305253 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5981  cation proton antiporter efflux protein CzcB  25.53 
 
 		 520 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000176523  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  22.69 
 
 		 417 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2610  RND family efflux transporter MFP subunit  28.74 
 
 		 493 aa  48.5  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.787622 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1389  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.43 
 
 		 374 aa  48.9  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  29.07 
 
 		 457 aa  48.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0820  HlyD family secretion protein  28.16 
 
 		 405 aa  47.8  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5559  secretion protein HlyD  26.42 
 
 		 366 aa  47.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1611  secretion protein HlyD  25.61 
 
 		 341 aa  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306933  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  25.24 
 
 		 431 aa  47.8  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1296  RND family efflux transporter MFP subunit  27 
 
 		 373 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00794293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6344  secretion protein HlyD family protein  21.27 
 
 		 387 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5267  secretion protein HlyD family protein  27.07 
 
 		 319 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.777645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5114  secretion protein HlyD family protein  27.07 
 
 		 319 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  24.64 
 
 		 326 aa  47.4  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  23.94 
 
 		 372 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>