96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1997 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1997  class II aldolase/adducin family protein  100 
 
 		 337 aa  692    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.100519 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2155  class II aldolase/adducin family protein  35.48 
 
 		 351 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0989166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3221  hypothetical protein  36.28 
 
 		 341 aa  220  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2032  class II aldolase/adducin family protein  30.95 
 
 		 384 aa  205  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.635701  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2186  hypothetical protein  35.04 
 
 		 378 aa  204  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14011  hypothetical protein  32.35 
 
 		 334 aa  184  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2575  hypothetical protein  31.44 
 
 		 330 aa  161  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1395  class II aldolase/adducin-like  32.13 
 
 		 320 aa  160  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0324487 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2009  short chain dehydrogenase  30.34 
 
 		 705 aa  90.9  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.333883 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1972  short chain dehydrogenase  30.13 
 
 		 705 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000839125  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1642  short chain dehydrogenase  32.49 
 
 		 705 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3212  short chain dehydrogenase  29.32 
 
 		 689 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2749  class II aldolase/adducin family protein  32.14 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2336  short chain dehydrogenase  28.1 
 
 		 706 aa  80.1  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.308198  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0410  short chain dehydrogenase  29.61 
 
 		 701 aa  79.7  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0195  short chain dehydrogenase  24.75 
 
 		 705 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2746  short chain dehydrogenase  25.33 
 
 		 705 aa  78.2  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0705  short chain dehydrogenase  28.19 
 
 		 680 aa  75.5  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0696  class II aldolase/adducin family protein  23.66 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2988  short chain dehydrogenase  30.27 
 
 		 700 aa  73.2  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0401  short chain dehydrogenase  25.25 
 
 		 652 aa  73.2  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2003  short chain dehydrogenase  27.47 
 
 		 705 aa  72.8  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1679  short chain dehydrogenase  30.5 
 
 		 696 aa  72  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.962871  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1970  short chain dehydrogenase  24.2 
 
 		 653 aa  72  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4827  short chain dehydrogenase  29.38 
 
 		 684 aa  70.9  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2454  short chain dehydrogenase  27.32 
 
 		 694 aa  70.1  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.86013  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2857  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  28.34 
 
 		 701 aa  69.7  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.886438 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2254  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  29.05 
 
 		 691 aa  69.7  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658882  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1803  short chain dehydrogenase  27.88 
 
 		 705 aa  69.7  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4397  short chain dehydrogenase  27.74 
 
 		 657 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4460  short chain dehydrogenase  27.74 
 
 		 657 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134448  normal  0.127863 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3145  short chain dehydrogenase  30.9 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191553 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1802  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  27.87 
 
 		 701 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310518  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3499  short chain dehydrogenase  29.19 
 
 		 413 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.110567  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3516  short chain dehydrogenase  30.3 
 
 		 664 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390317  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1605  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  26.46 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4067  class II aldolase/adducin family protein  29.15 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3704  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  27.69 
 
 		 678 aa  59.3  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.701668 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4810  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  26.97 
 
 		 695 aa  59.3  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1895  short chain dehydrogenase  23.49 
 
 		 698 aa  58.5  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.196702  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3743  short chain dehydrogenase  26.17 
 
 		 571 aa  57.8  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4390  short chain dehydrogenase  26.29 
 
 		 677 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639544  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4771  short chain dehydrogenase  26.29 
 
 		 677 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4477  short chain dehydrogenase  26.29 
 
 		 677 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3625  short chain dehydrogenase  26 
 
 		 687 aa  57  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000228222  normal  0.0356352 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4610  short chain dehydrogenase  28.42 
 
 		 707 aa  57  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3046  short chain dehydrogenase  26.46 
 
 		 676 aa  56.6  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.854691  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1386  short chain dehydrogenase  26.24 
 
 		 691 aa  56.2  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.88189  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2381  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  27.46 
 
 		 677 aa  54.7  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0429  short chain dehydrogenase  27.54 
 
 		 680 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3316  short chain dehydrogenase  26.57 
 
 		 730 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193646 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25371  short chain dehydrogenase  28.95 
 
 		 715 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3305  short chain dehydrogenase  26.29 
 
 		 680 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4672  short chain dehydrogenase  26.15 
 
 		 679 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174921  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05820  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  25.38 
 
 		 689 aa  54.7  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3106  short chain dehydrogenase  26.15 
 
 		 685 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0887  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  25.38 
 
 		 684 aa  54.7  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1605  short chain dehydrogenase  28.99 
 
 		 690 aa  53.5  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.043834 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29640  short chain dehydrogenase  26.5 
 
 		 683 aa  53.5  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3884  short chain dehydrogenase  26.63 
 
 		 706 aa  50.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  32.21 
 
 		 231 aa  51.2  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4925  short chain dehydrogenase  28.04 
 
 		 707 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000252534  normal  0.445415 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  32.21 
 
 		 243 aa  50.8  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2693  short chain dehydrogenase  27.22 
 
 		 682 aa  49.3  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1303  short chain dehydrogenase  25.7 
 
 		 729 aa  49.3  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.851428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5014  putative aldolase  24.78 
 
 		 224 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0583347  normal  0.341145 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4323  putative aldolase  24.79 
 
 		 225 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6711  short chain dehydrogenase  27.81 
 
 		 677 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2731  short chain dehydrogenase  23.32 
 
 		 729 aa  46.6  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  27.81 
 
 		 222 aa  46.2  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5310  putative aldolase  24.15 
 
 		 222 aa  46.2  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.711943 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  29.37 
 
 		 210 aa  45.8  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3454  short chain dehydrogenase  24.58 
 
 		 730 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.117557 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4215  short chain dehydrogenase  31.25 
 
 		 713 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.252283  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4650  putative aldolase  23.85 
 
 		 221 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.590566  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2214  short chain dehydrogenase  26.82 
 
 		 707 aa  45.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2532 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0424  class II aldolase/adducin family protein  25.54 
 
 		 222 aa  45.4  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.130241  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3319  class II aldolase/adducin family protein  27.17 
 
 		 253 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.930557  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1137  putative aldolase  25.12 
 
 		 226 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.73575 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1724  short chain dehydrogenase  25.27 
 
 		 705 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616533  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2413  short chain dehydrogenase  25.59 
 
 		 688 aa  44.3  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0694  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  24.72 
 
 		 726 aa  43.9  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.180727  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0223  short chain dehydrogenase  21.65 
 
 		 699 aa  43.5  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.133149  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1346  class II aldolase/adducin family protein  30.48 
 
 		 189 aa  43.5  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0532237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2311  short chain dehydrogenase  25.59 
 
 		 688 aa  43.1  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0950  class II aldolase/adducin family protein  31.03 
 
 		 212 aa  43.1  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2876  putative aldolase  31.03 
 
 		 212 aa  43.1  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3035  putative aldolase  31.03 
 
 		 212 aa  43.1  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02588  hypothetical protein  31.03 
 
 		 212 aa  43.1  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02553  hypothetical protein  31.03 
 
 		 212 aa  43.1  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0974  putative aldolase  31.03 
 
 		 212 aa  43.1  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.776053  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3136  putative aldolase  31.03 
 
 		 212 aa  43.1  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0814  class II aldolase/adducin family protein  31.67 
 
 		 192 aa  43.1  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.537097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5807  short chain dehydrogenase  24.56 
 
 		 698 aa  42.7  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402593  normal  0.0411689 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1697  class II aldolase/adducin family protein  27.62 
 
 		 188 aa  42.4  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1486  class II aldolase/adducin family protein  26.67 
 
 		 190 aa  42.7  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>