More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_38900 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 226 aa  460  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  62.62 
 
 		 220 aa  268  5e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  48.8 
 
 		 218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  47.03 
 
 		 209 aa  195  5.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 224 aa  192  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  42.08 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  45.13 
 
 		 204 aa  144  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  42.72 
 
 		 202 aa  142  6e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 218 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 218 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 218 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 201 aa  118  7.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  35.35 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  35.61 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  35.32 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 212 aa  96.3  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 211 aa  91.7  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 212 aa  89.4  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 206 aa  85.5  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 215 aa  85.1  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 222 aa  85.1  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  29.55 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 218 aa  72  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 214 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  24.34 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 330 aa  68.9  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  24.76 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  36.27 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  26.13 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  24.61 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3750  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  24.87 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 245 aa  62  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 210 aa  62  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7871  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal  0.175428 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 190 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3827  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.31638 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  38.96 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1993  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2965  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0278757  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  23.72 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 273 aa  58.5  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  29.6 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>