284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_26420 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_26420  phytoene synthase  100 
 
 		 321 aa  640    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5455  phytoene synthase  67.64 
 
 		 316 aa  391  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0351935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5076  phytoene synthase  67.64 
 
 		 316 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5164  phytoene synthase  67.64 
 
 		 316 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1579  squalene/phytoene synthase  64.01 
 
 		 315 aa  371  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212502  normal  0.0425272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3811  Squalene/phytoene synthase  66.34 
 
 		 310 aa  353  2.9999999999999997e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1846  squalene/phytoene synthase  64.65 
 
 		 314 aa  345  5e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  59.2 
 
 		 330 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3572  Phytoene synthase  57.28 
 
 		 325 aa  309  4e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.873206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5132  squalene/phytoene synthase  50 
 
 		 326 aa  252  6e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126114  normal  0.060719 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1383  phytoene synthase  47.77 
 
 		 339 aa  251  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.244204  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  52.74 
 
 		 317 aa  245  8e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  47.8 
 
 		 332 aa  232  6e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  47.59 
 
 		 312 aa  223  4e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3828  Phytoene synthase  48.2 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.597595  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  46.62 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0469  Squalene/phytoene synthase  44.36 
 
 		 294 aa  186  4e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2501  Phytoene synthase  43.2 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000012826  normal  0.0149177 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  40.13 
 
 		 313 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  33.8 
 
 		 324 aa  145  9e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  38.38 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  37.59 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  34.74 
 
 		 298 aa  139  4.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  34.88 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  34.68 
 
 		 308 aa  136  5e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  36.43 
 
 		 337 aa  135  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  34.38 
 
 		 302 aa  135  9e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  34.98 
 
 		 304 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  31.89 
 
 		 325 aa  134  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2046  Squalene/phytoene synthase  35.11 
 
 		 279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.951992  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  35.55 
 
 		 310 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  35.55 
 
 		 310 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  36.73 
 
 		 310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  35.77 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1004  Phytoene synthase  34.58 
 
 		 318 aa  130  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.372404  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  34.2 
 
 		 312 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  32.67 
 
 		 310 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  31.6 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  31.45 
 
 		 302 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  31.72 
 
 		 311 aa  126  6e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  32.29 
 
 		 312 aa  125  7e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  31.36 
 
 		 302 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  34.18 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  31.1 
 
 		 302 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2699  Phytoene synthase  33.55 
 
 		 316 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  31.89 
 
 		 310 aa  125  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  32.38 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  28.57 
 
 		 310 aa  123  4e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  29.66 
 
 		 309 aa  122  8e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3904  Phytoene synthase  34.62 
 
 		 326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  32.04 
 
 		 313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  28.67 
 
 		 310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  30.5 
 
 		 302 aa  119  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0276  Squalene/phytoene synthase  37.14 
 
 		 321 aa  119  9e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.54913  normal  0.0299312 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0143  Squalene/phytoene synthase  32.64 
 
 		 324 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.699038  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  29.66 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  30.07 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2244  Phytoene synthase  34.55 
 
 		 303 aa  117  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2441  Phytoene synthase  31.85 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.214033  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  30.18 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2267  Squalene/phytoene synthase  32.61 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0306  squalene/phytoene synthase  31.83 
 
 		 288 aa  114  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  31.02 
 
 		 278 aa  113  5e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2819  Phytoene synthase  33.96 
 
 		 335 aa  113  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_56481  phytoene synthase  32.17 
 
 		 505 aa  112  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2092  Phytoene synthase  35.98 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal  0.0129456 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12559  predicted protein  34 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.209763  normal  0.196988 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0058  squalene/phytoene synthase  30.77 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00920  phytoene synthetase  34.97 
 
 		 279 aa  109  6e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2036  phytoene synthase  31.78 
 
 		 278 aa  109  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2544  Squalene/phytoene synthase  42.46 
 
 		 307 aa  108  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.11325  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  32.76 
 
 		 281 aa  107  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  27.33 
 
 		 316 aa  106  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0494  phytoene synthase  34.56 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  34.15 
 
 		 288 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  29.82 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  31.67 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  30.18 
 
 		 575 aa  102  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  32.47 
 
 		 293 aa  102  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6667  squalene synthase HpnD  34.81 
 
 		 287 aa  102  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3012  squalene/phytoene synthase  31.25 
 
 		 353 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.352634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  31.82 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  27.8 
 
 		 316 aa  101  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5959  Squalene/phytoene synthase  34.48 
 
 		 278 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.581126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  31.34 
 
 		 280 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1549  squalene/phytoene synthase  32.17 
 
 		 279 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2476  Squalene/phytoene synthase  29.83 
 
 		 321 aa  100  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1371  squalene/phytoene synthase  32.64 
 
 		 302 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1486  Phytoene synthase  30.07 
 
 		 280 aa  100  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000477032 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  35.04 
 
 		 303 aa  99.8  6e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  31.11 
 
 		 278 aa  99  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12760  phytoene/squalene synthetase  40.84 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.614964 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1618  squalene/phytoene synthase  31.37 
 
 		 364 aa  97.4  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1075  squalene/phytoene synthase  36.93 
 
 		 283 aa  98.2  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3201  Squalene/phytoene synthase  32.25 
 
 		 357 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  30.74 
 
 		 280 aa  97.1  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3405  squalene synthase HpnC  30.42 
 
 		 310 aa  96.7  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151553  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5619  Squalene/phytoene synthase  37.16 
 
 		 275 aa  96.7  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2842  squalene/phytoene synthase  30.1 
 
 		 338 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  30.42 
 
 		 279 aa  95.1  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>