More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_16450 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9155  lysyl-tRNA synthetase  70.8 
 
 		 500 aa  727    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3422  lysyl-tRNA synthetase  72.24 
 
 		 499 aa  729    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4482  lysyl-tRNA synthetase  72.55 
 
 		 499 aa  734    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4987  lysyl-tRNA synthetase  74.9 
 
 		 500 aa  778    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.771259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2881  lysyl-tRNA synthetase  78.07 
 
 		 496 aa  799    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.075021  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8377  lysyl-tRNA synthetase  64.1 
 
 		 506 aa  649    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16450  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 499 aa  1014    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0637  lysyl-tRNA synthetase  62.65 
 
 		 528 aa  632  1e-180  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4277  lysyl-tRNA synthetase  64.5 
 
 		 502 aa  629  1e-179  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.654573 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4711  lysyl-tRNA synthetase  63.89 
 
 		 502 aa  625  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243441  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  62.3 
 
 		 1113 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0216  lysyl-tRNA synthetase  61.13 
 
 		 501 aa  598  1e-170  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404886  normal  0.127983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6309  lysyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 501 aa  587  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0855  lysyl-tRNA synthetase  60.12 
 
 		 504 aa  588  1e-166  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  59.14 
 
 		 1100 aa  583  1.0000000000000001e-165  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0329  lysyl-tRNA synthetase  60.61 
 
 		 503 aa  580  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0720  lysyl-tRNA synthetase  59.18 
 
 		 503 aa  562  1.0000000000000001e-159  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  0.145533 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31970  lysyl-tRNA synthetase (class II)  58.67 
 
 		 510 aa  561  1.0000000000000001e-159  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2977  lysyl-tRNA synthetase  59.06 
 
 		 504 aa  562  1.0000000000000001e-159  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.120285  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5144  lysyl-tRNA synthetase  59.11 
 
 		 512 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4758  lysyl-tRNA synthetase  59.31 
 
 		 512 aa  557  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.38099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4844  lysyl-tRNA synthetase  59.31 
 
 		 512 aa  557  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0576  lysyl-tRNA synthetase  58 
 
 		 500 aa  552  1e-156  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.1487  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4000  lysyl-tRNA synthetase  56.41 
 
 		 507 aa  546  1e-154  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5360  lysyl-tRNA synthetase  57.89 
 
 		 509 aa  546  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370612  normal  0.216522 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0641  lysyl-tRNA synthetase  57.32 
 
 		 495 aa  542  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.15563 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13631  lysyl-tRNA synthetase  57.31 
 
 		 505 aa  544  1e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.57395e-59  normal  0.0200312 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12890  lysyl-tRNA synthetase (class II)  56.11 
 
 		 502 aa  541  1e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0133257  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1428  lysyl-tRNA synthetase  59.11 
 
 		 501 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.680622  normal  0.318104 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2092  lysyl-tRNA synthetase  56.37 
 
 		 515 aa  536  1e-151  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  54.71 
 
 		 1098 aa  537  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0165  lysyl-tRNA synthetase  56.48 
 
 		 510 aa  536  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4347  lysyl-tRNA synthetase  57.4 
 
 		 516 aa  538  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24660  lysyl-tRNA synthetase  56.48 
 
 		 520 aa  528  1e-149  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  55.21 
 
 		 1094 aa  528  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0329  lysyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 		 512 aa  524  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01510  lysyl-tRNA synthetase  55.58 
 
 		 504 aa  520  1e-146  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  53.47 
 
 		 1138 aa  505  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  52.04 
 
 		 1147 aa  507  9.999999999999999e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0393  lysine--tRNA ligase  53.58 
 
 		 565 aa  498  1e-140  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  51.9 
 
 		 1111 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  51.9 
 
 		 1112 aa  498  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  51.9 
 
 		 1112 aa  498  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  51.51 
 
 		 1101 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  52.3 
 
 		 1100 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 1172 aa  488  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 		 1120 aa  469  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1777  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 560 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0105014  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 		 491 aa  436  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 501 aa  436  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 		 1118 aa  434  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 		 494 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 		 489 aa  427  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0640  lysyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 		 496 aa  426  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 		 494 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0480  lysyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 		 496 aa  426  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 		 510 aa  428  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 499 aa  422  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6390  lysyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 		 583 aa  423  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 		 494 aa  419  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1485  lysyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 		 562 aa  419  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 511 aa  416  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 		 501 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 495 aa  412  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0968  lysyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 		 515 aa  412  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.685874 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 		 490 aa  414  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0078  lysyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 		 489 aa  414  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518607  normal  0.367083 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1242  lysyl-tRNA synthetase  44 
 
 		 502 aa  413  1e-114  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1675  lysyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 		 492 aa  411  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100386  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3888  lysyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 505 aa  411  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0271  lysyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 		 508 aa  411  1e-113  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000549631  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1001  lysyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 		 502 aa  409  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000393607  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1586  lysyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 		 507 aa  409  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 		 504 aa  409  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 		 489 aa  411  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3308  lysyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 505 aa  410  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2319  lysyl-tRNA synthetase  47.3 
 
 		 1132 aa  410  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 		 508 aa  410  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3384  lysyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 502 aa  409  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05510  lysyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 563 aa  409  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 		 502 aa  409  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 505 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1370  lysyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 		 578 aa  408  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.394303 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1508  lysyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 514 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.781573  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 499 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 505 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 505 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3376  lysyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 505 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 505 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 		 561 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 499 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0009  lysyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 		 489 aa  408  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00617172  hitchhiker  0.00000378083 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1827  lysyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 		 503 aa  405  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  44.58 
 
 		 505 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 499 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 505 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3208  lysyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 505 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.563866 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3274  lysyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 505 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3271  lysyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 505 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1739  lysyl-tRNA synthetase  46.4 
 
 		 509 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.326281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>