More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0208 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0208  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 564 aa  1139    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1558  response regulator receiver protein  27.37 
 
 		 566 aa  227  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2157  response regulator receiver protein  22.36 
 
 		 577 aa  114  5e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3688  response regulator receiver protein  21.18 
 
 		 564 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3580  response regulator receiver protein  21.48 
 
 		 564 aa  108  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20780  putative two-component response regulator  20.14 
 
 		 571 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.283191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1784  putative two-component response regulator  20.03 
 
 		 571 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.22 
 
 		 486 aa  104  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.646626  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3451  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:stage II sporulation E  20.99 
 
 		 568 aa  104  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3924  response regulator receiver protein  21.65 
 
 		 563 aa  104  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0999  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.29 
 
 		 602 aa  101  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  hitchhiker  0.00369461 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1504  response regulator receiver protein  20.42 
 
 		 563 aa  101  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709749  normal  0.106415 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1964  response regulator  20.63 
 
 		 568 aa  100  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.58831  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1542  response regulator receiver domain-containing protein  20.24 
 
 		 567 aa  100  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3365  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2179  flagellar basal-body rod protein FlgC  23.33 
 
 		 575 aa  99.8  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4363  response regulator receiver protein  20.25 
 
 		 563 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.470941 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01717  putative response regulator  22.24 
 
 		 568 aa  98.2  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1991  response regulator receiver protein  20.75 
 
 		 574 aa  95.1  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3118  response regulator receiver domain-containing protein  22.22 
 
 		 563 aa  95.1  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0279  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.5 
 
 		 394 aa  94  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34360  Response regulator  19.55 
 
 		 575 aa  93.6  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.328347  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.53 
 
 		 425 aa  92.4  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.141244  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3849  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  22.6 
 
 		 412 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0157  response regulator  21.83 
 
 		 568 aa  90.9  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1594  response regulator receiver protein  22.96 
 
 		 548 aa  88.6  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2819  response regulator receiver protein  19.72 
 
 		 562 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0360472 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0905  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.88 
 
 		 380 aa  87.8  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1035  response regulator  24.2 
 
 		 380 aa  87  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2943  response regulator receiver modulated serine phosphatase  22.41 
 
 		 470 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2359  putative two-component response regulator  23.15 
 
 		 394 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1682  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25 
 
 		 412 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0377  DNA-binding response regulator  36.75 
 
 		 226 aa  86.7  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.306284  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4268  response regulator  23.65 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568873 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 396 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000364001 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0722  response regulator receiver domain-containing protein  34.71 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0554017  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1440  response regulator  22.95 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0915  sigma factor sigB regulation protein  24.14 
 
 		 380 aa  84  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116334  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2165  response regulator  24.68 
 
 		 393 aa  83.6  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0249002  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3577  response regulator receiver protein  24.68 
 
 		 393 aa  83.6  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0898  sigma factor sigB regulation protein  24.27 
 
 		 380 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.503671  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1920  response regulator receiver  33.33 
 
 		 226 aa  83.2  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1706  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.68 
 
 		 393 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000168842 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1088  response regulator  23.06 
 
 		 380 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1161  response regulator  23.65 
 
 		 380 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27940  putative two-component response regulator  23.1 
 
 		 394 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1929  response regulator receiver protein  22.58 
 
 		 394 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.310245 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0930  response regulator  23.34 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0994  response regulator  23.34 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2887  response regulator receiver modulated serine phosphatase  21.59 
 
 		 423 aa  80.9  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1070  response regulator  24.36 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.209800000000002e-41 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1991  two component transcriptional regulator  35.77 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.656084  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32720  Response regulator  21.93 
 
 		 394 aa  79.7  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2152  putative response regulator, putative serine phosphatase  22.03 
 
 		 434 aa  79.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0115  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.46 
 
 		 304 aa  79.3  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.113218  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0106  response regulator receiver  38.02 
 
 		 218 aa  78.2  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 		 1452 aa  77.8  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3302  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.26 
 
 		 472 aa  77.8  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.334689  normal  0.605218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1879  response regulator receiver protein  21.47 
 
 		 567 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.686257 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3023  response regulator receiver protein  23.61 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.566048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0448  response regulator receiver  27.71 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000838603  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2095  response regulator receiver protein  21.47 
 
 		 567 aa  77  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2117  response regulator  24.68 
 
 		 394 aa  77  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0129975  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1912  response regulator receiver:stage II sporulation E  21.59 
 
 		 394 aa  77  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.432168  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4963  two-component sensor response receiver component, histidine kinase  30.51 
 
 		 1122 aa  77  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3485  response regulator  30.06 
 
 		 422 aa  76.6  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0984  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  32.18 
 
 		 564 aa  76.3  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 502 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.067402 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0876  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.78 
 
 		 709 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0730078  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2647  response regulator receiver protein  20.93 
 
 		 418 aa  75.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0228439  normal  0.825958 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2943  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 438 aa  75.9  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.641955  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2119  response regulator  23.13 
 
 		 565 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3666  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  26.07 
 
 		 1129 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2122  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.57 
 
 		 953 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0111685  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 764 aa  75.1  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 		 544 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1870  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.53 
 
 		 379 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.177859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1399  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.34 
 
 		 476 aa  75.5  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1844  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.53 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3036  response regulator receiver protein  30.06 
 
 		 367 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.697745  hitchhiker  0.00756104 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3005  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.1 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000288968 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1648  response regulator receiver protein  25.42 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0057956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0964  two component transcriptional regulator  38.18 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.412408  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  20.2 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2396  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 126 aa  73.9  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.612966  normal  0.464694 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2096  response regulator receiver protein  22.24 
 
 		 577 aa  73.9  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.856197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2096  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.38 
 
 		 953 aa  73.6  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000903564 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2024  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 		 517 aa  73.6  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0853  two component transcriptional regulator, AraC family  36.57 
 
 		 509 aa  73.6  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1312  response regulator receiver protein  33.64 
 
 		 367 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000399806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1379  response regulator receiver protein  33.64 
 
 		 367 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00673289  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3534  response regulator receiver protein  20.46 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2267  response regulator receiver protein  31.78 
 
 		 367 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0287525  normal  0.0560142 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0569  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 129 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303984  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2249  response regulator receiver protein  22.52 
 
 		 577 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299733  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1248  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 118 aa  73.6  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2371  response regulator receiver protein  24.14 
 
 		 233 aa  73.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3440  response regulator receiver protein  24.27 
 
 		 572 aa  73.6  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2806  response regulator receiver protein  25.65 
 
 		 373 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2098  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 547 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000413163 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 126 aa  72.4  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>