More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0569 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0569  response regulator receiver protein  100 
 
 		 129 aa  262  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303984  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  47.41 
 
 		 425 aa  104  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.141244  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1399  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.4 
 
 		 476 aa  99.4  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2943  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44 
 
 		 438 aa  93.2  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.641955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0377  DNA-binding response regulator  36.52 
 
 		 226 aa  89  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.306284  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0115  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.02 
 
 		 304 aa  85.1  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.113218  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 		 502 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.067402 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0363  response regulator receiver  38.84 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1483  DNA-binding response regulator  33.06 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4377  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 		 636 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1664  DNA-binding response regulator  33.05 
 
 		 226 aa  80.5  0.000000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 		 547 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1837  DNA-binding response regulator  31.45 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.591446  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2098  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 		 547 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000413163 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2024  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 		 517 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0106  response regulator receiver  38.66 
 
 		 218 aa  77.8  0.00000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0876  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.29 
 
 		 709 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0730078  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 396 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000364001 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0208  response regulator receiver domain-containing protein  33.62 
 
 		 564 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0448  response regulator receiver  33.33 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000838603  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1920  response regulator receiver  32.76 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0986  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 		 487 aa  70.5  0.000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1378  response regulator receiver domain-containing protein  29.06 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.321431  normal  0.0110306 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2422  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0749  two component transcriptional regulator  30 
 
 		 230 aa  68.2  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0851  two component transcriptional regulator  34.02 
 
 		 230 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1899  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.86 
 
 		 616 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.764058  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0281  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 		 526 aa  67.4  0.00000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.630164  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0268  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.35 
 
 		 456 aa  67  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540037 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0283  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.35 
 
 		 456 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1929  response regulator receiver protein  36.71 
 
 		 394 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.310245 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2122  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.19 
 
 		 953 aa  66.6  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0111685  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  38.98 
 
 		 544 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0722  response regulator receiver domain-containing protein  27.05 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0554017  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4363  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 563 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.470941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1504  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 563 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709749  normal  0.106415 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2139  response regulator receiver  33.62 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0987  response regulator receiver domain-containing protein  30.47 
 
 		 420 aa  65.5  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2575  sensor histidine kinase/response regulator  33.6 
 
 		 850 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3577  response regulator receiver protein  35.44 
 
 		 393 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2186  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 381 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000654459  hitchhiker  0.000162526 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0685  response regulator receiver  30.33 
 
 		 236 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.38 
 
 		 217 aa  64.3  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0495  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 456 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.27 
 
 		 233 aa  63.9  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2980  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1991  two component transcriptional regulator  31.82 
 
 		 229 aa  63.5  0.0000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.656084  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.15 
 
 		 902 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1135  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.86 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1320  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  37.93 
 
 		 460 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2165  response regulator  34.18 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0249002  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2293  LuxR family DNA-binding response regulator  37.89 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1706  response regulator receiver modulated serine phosphatase  34.18 
 
 		 393 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000168842 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2117  response regulator  33.33 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0129975  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1912  response regulator receiver:stage II sporulation E  33.33 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.432168  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2344  response regulator receiver domain-containing protein  32.8 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1682  response regulator receiver modulated serine phosphatase  34.18 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1620  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0904485  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3431  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 		 756 aa  63.5  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1362  DNA-binding response regulator  30.33 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.48 
 
 		 364 aa  63.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1525  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2359  putative two-component response regulator  35.44 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3688  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 564 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1530  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.754323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0693  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.56 
 
 		 229 aa  62  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0837  two component transcriptional regulator  29.17 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0460  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.903697  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2096  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.23 
 
 		 953 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000903564 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1041  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 365 aa  62.8  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1440  response regulator receiver protein  28.69 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  35.88 
 
 		 1156 aa  62  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0919  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.14 
 
 		 223 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1536  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0280  Fis family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 450 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.928901  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0347  PAS  32.74 
 
 		 513 aa  61.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3924  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 563 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2263  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 		 1009 aa  61.6  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1144  two component transcriptional regulator  32.74 
 
 		 225 aa  60.8  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  36.89 
 
 		 225 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 		 1033 aa  60.8  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0540  putative PAS/PAC sensor protein  32.48 
 
 		 573 aa  60.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  36.89 
 
 		 225 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1558  response regulator receiver protein  30.93 
 
 		 566 aa  61.2  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27940  putative two-component response regulator  35.44 
 
 		 394 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  36.89 
 
 		 225 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 		 674 aa  61.2  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0497  putative PAS/PAC sensor protein  32 
 
 		 574 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.710767  normal  0.476938 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0867  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 		 905 aa  60.8  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.768776  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0137  response regulator receiver protein  31.54 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0005  response regulator receiver domain-containing protein  30.97 
 
 		 229 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0566865  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0447  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  35.34 
 
 		 461 aa  60.8  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.06 
 
 		 763 aa  60.8  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0608  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.34 
 
 		 461 aa  60.8  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  33.68 
 
 		 213 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.3 
 
 		 234 aa  60.8  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3849  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  32.91 
 
 		 412 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  31.54 
 
 		 1643 aa  60.8  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 219 aa  60.5  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>