99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_4108 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_4108  transcriptional regulator, RpiR family  100 
 
 		 243 aa  491  9.999999999999999e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2006  RpiR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 237 aa  185  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0473713 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3018  RpiR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.576007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1678  transcriptional regulator  28.28 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00566045  normal  0.0111544 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3022  transcriptional regulator, RpiR family  27.54 
 
 		 262 aa  75.1  0.0000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0182  RpiR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0179  RpiR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1477  RpiR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.26952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2730  RpiR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.69775  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2807  RpiR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2499  RpiR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 244 aa  67  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0225  transcriptional regulator  26.47 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3319  RpiR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2234  transcriptional regulator, RpiR family  26 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1373  hypothetical protein  23.98 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3662  transcriptional regulator, RpiR family  25.78 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.078396  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0456  transcriptional regulator, RpiR family  29.81 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000284572  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1050  transcriptional regulator, RpiR family  24.88 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0467  transcriptional regulator  28.28 
 
 		 242 aa  62  0.000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00031412  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1910  phosphosugar-binding transcriptional regulator  28.93 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0151  transcriptional regulator, RpiR family  30.3 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0876  transcriptional regulator  26.6 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0549202  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1355  transcriptional regulator  27.62 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.906845  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1243  transcriptional regulator  24.29 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.665754  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2136  transcriptional regulator, RpiR family  31.68 
 
 		 284 aa  58.5  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000108566  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2349  RpiR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2392  sugar isomerase (SIS)  28.46 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1962  transcriptional regulator, RpiR family  28 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29100  transcriptional regulator  18.1 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0464  transcriptional regulator  24.51 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.142049  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0168  RpiR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 280 aa  54.7  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.057217  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0178  RpiR family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 291 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0183  helix-turn-helix protein RpiR  23.29 
 
 		 291 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1686  transcriptional regulator  24.15 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0801516  hitchhiker  0.000000000302216 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3232  transcriptional regulator  24.73 
 
 		 274 aa  53.5  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0360083  normal  0.0600235 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1200  transcriptional regulator, RpiR family  26.73 
 
 		 304 aa  53.1  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2604  RpiR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 242 aa  52.8  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2498  transcriptional regulator  22.9 
 
 		 282 aa  52  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4018  RpiR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 284 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.772645  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1901  RpiR family phosphosugar-binding transcriptional regulator  24.88 
 
 		 290 aa  50.4  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3071  transcriptional regulator, RpiR family  25.96 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1541  RpiR family transcriptional regulator  21.5 
 
 		 266 aa  50.8  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000907266  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1394  transcriptional regulator, RpiR family  20.19 
 
 		 285 aa  50.1  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0784467  normal  0.640102 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1770  transcriptional regulator  25.57 
 
 		 283 aa  49.7  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000030583  hitchhiker  0.000572207 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1590  RpiR family transcriptional regulator  21.83 
 
 		 266 aa  49.7  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000388341  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4460  putative transcriptional regulator, RpiR family  22.83 
 
 		 287 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.857974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5684  putative transcriptional regulator, RpiR family  22.22 
 
 		 299 aa  48.9  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.474804 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3122  RpiR family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 282 aa  48.5  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  28.57 
 
 		 321 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1524  transcriptional regulator  24.53 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1993  transcriptional regulator, RpiR family  26.29 
 
 		 280 aa  47.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl641  putative transcriptional regulator  25.81 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  27.93 
 
 		 321 aa  47  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2738  hexulose-6-phosphate synthase/SIS domain-containing protein  26.61 
 
 		 389 aa  46.6  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2584  hypothetical protein  20.76 
 
 		 282 aa  46.6  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2713  RpiR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 285 aa  47  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0250  DNA-binding transcriptional repressor RpiR  22.69 
 
 		 287 aa  46.6  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2799  transcriptional regulator, RpiR family  23.74 
 
 		 285 aa  47  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.576789  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  28.57 
 
 		 321 aa  46.6  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3841  transcriptional regulator, RpiR family  24.76 
 
 		 283 aa  46.6  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.412935  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2247  transcriptional regulator  23.79 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3050  SIS domain-containing protein  27.27 
 
 		 177 aa  46.2  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3044  SIS domain-containing protein  27.27 
 
 		 177 aa  46.2  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.128664  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3311  transcriptional regulator, RpiR family  23.23 
 
 		 255 aa  46.2  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0607  RpiR family transcriptional regulator  40 
 
 		 280 aa  45.8  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.173614  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0593  RpiR family transcriptional regulator  40 
 
 		 280 aa  45.8  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590128  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3662  putative DNA-binding transcriptional regulator  19.72 
 
 		 282 aa  45.8  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1234  transcriptional regulator, RpiR family  23.74 
 
 		 285 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001002  transcriptional regulator RpiR family  21.76 
 
 		 283 aa  44.7  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2088  RpiR family transcriptional regulator  22.62 
 
 		 284 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0949278  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1080  RpiR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 318 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0801962  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0972  transcriptional regulator, RpiR family  22.6 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0147  transcriptional regulator  28 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905215 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2563  RpiR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 285 aa  44.7  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1252  RpiR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 285 aa  43.9  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.102619 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03961  DNA-binding transcriptional repressor  23.64 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03921  hypothetical protein  23.64 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0479  sugar isomerase (SIS)  28.46 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0550  transcriptional regulator  24.07 
 
 		 284 aa  43.9  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00967802  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3657  transcriptional regulator, RpiR family  23.72 
 
 		 285 aa  43.5  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  29.9 
 
 		 322 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0300  RpiR family transcriptional regulator  23.19 
 
 		 266 aa  43.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0307  hypothetical protein  23.19 
 
 		 266 aa  43.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3564  RpiR family transcriptional regulator  22.43 
 
 		 284 aa  43.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.536409  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2433  transcriptional regulator, RpiR family  22.01 
 
 		 282 aa  42.7  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000784459  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02327  predicted DNA-binding transcriptional regulator  22.83 
 
 		 285 aa  42.7  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3902  transcriptional regulator, RpiR family  23.18 
 
 		 296 aa  42.7  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02288  hypothetical protein  22.83 
 
 		 285 aa  42.7  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4555  DNA-binding transcriptional repressor RpiR  23.18 
 
 		 296 aa  42.7  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3937  DNA-binding transcriptional repressor RpiR  23.18 
 
 		 296 aa  42.7  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2129  DNA-binding transcriptional regulator HexR  33.33 
 
 		 289 aa  42.4  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl010  putative transcriptional regulator  31.2 
 
 		 244 aa  42.4  0.008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  27.62 
 
 		 322 aa  42  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2582  RpiR family transcriptional regulator  23.45 
 
 		 285 aa  42.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1541  transcriptional regulator  21.96 
 
 		 279 aa  42  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  28.87 
 
 		 321 aa  42  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0401  KpsF/GutQ family protein  28.32 
 
 		 326 aa  42  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2382  helix-turn-helix protein RpiR  22.07 
 
 		 290 aa  42  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2339  RpiR family transcriptional regulator  22.07 
 
 		 290 aa  42  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.146388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>