155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0467 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0467  transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  491  9.999999999999999e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00031412  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2604  RpiR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 242 aa  138  7e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0225  transcriptional regulator  34.06 
 
 		 242 aa  119  6e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1477  RpiR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 246 aa  112  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.26952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2807  RpiR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 246 aa  112  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2730  RpiR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 246 aa  112  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.69775  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0876  transcriptional regulator  30.49 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0549202  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3319  RpiR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 243 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2499  RpiR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 244 aa  108  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3311  transcriptional regulator, RpiR family  31.11 
 
 		 255 aa  105  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0464  transcriptional regulator  27.66 
 
 		 248 aa  99.4  5e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.142049  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0179  RpiR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0182  RpiR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2136  transcriptional regulator, RpiR family  28.57 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000108566  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3071  transcriptional regulator, RpiR family  26.55 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1993  transcriptional regulator, RpiR family  27.75 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1910  phosphosugar-binding transcriptional regulator  24.04 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2349  RpiR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2392  sugar isomerase (SIS)  24.12 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2234  transcriptional regulator, RpiR family  21.52 
 
 		 244 aa  62  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4108  transcriptional regulator, RpiR family  28.28 
 
 		 243 aa  62  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2247  transcriptional regulator  27.94 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3232  transcriptional regulator  25.12 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0360083  normal  0.0600235 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3564  RpiR family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.536409  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2433  transcriptional regulator, RpiR family  23.08 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000784459  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0456  transcriptional regulator, RpiR family  27.91 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000284572  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0696  RpiR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000925251  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1373  hypothetical protein  23.22 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1528  transcriptional regulator, RpiR family  23.58 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1243  transcriptional regulator  19.91 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.665754  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1355  transcriptional regulator  26.23 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.906845  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2838  putative DNA-binding transcriptional regulator  25.65 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1142  putative DNA-binding transcriptional regulator  23.63 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3618  putative DNA-binding transcriptional regulator  23.63 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1248  putative DNA-binding transcriptional regulator  23.63 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.964935  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2950  putative DNA-binding transcriptional regulator  24.61 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2775  putative DNA-binding transcriptional regulator  24.61 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2734  putative DNA-binding transcriptional regulator  24.61 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2815  putative DNA-binding transcriptional regulator  24.61 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.901844 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0168  RpiR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 280 aa  54.7  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.057217  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2619  RpiR family transcriptional regulator  20.38 
 
 		 286 aa  53.9  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2584  hypothetical protein  21.65 
 
 		 282 aa  53.9  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1541  RpiR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000907266  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0300  RpiR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0307  hypothetical protein  24.89 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1163  sugar isomerase (SIS)  31.71 
 
 		 194 aa  53.5  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.105663  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3022  transcriptional regulator, RpiR family  23.5 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0800  sugar phosphate isomerase  29.6 
 
 		 320 aa  52.8  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02455  predicted DNA-binding transcriptional regulator  25 
 
 		 282 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1107  transcriptional regulator, RpiR family  25 
 
 		 282 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.379447  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02419  hypothetical protein  25 
 
 		 282 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3796  putative DNA-binding transcriptional regulator  25 
 
 		 282 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.796505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2714  putative DNA-binding transcriptional regulator  25 
 
 		 282 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2846  putative DNA-binding transcriptional regulator  25 
 
 		 282 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.632746  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2714  putative DNA-binding transcriptional regulator  25 
 
 		 282 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2926  putative DNA-binding transcriptional regulator  25 
 
 		 282 aa  52.8  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1348  transcriptional regulator, RpiR family  26.42 
 
 		 307 aa  52.4  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.478547  normal  0.506779 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2753  transcriptional regulator, RpiR family  23.98 
 
 		 304 aa  52.4  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1116  putative DNA-binding transcriptional regulator  25 
 
 		 282 aa  52  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0912  RpiR family transcriptional regulator  21.65 
 
 		 287 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0782  RpiR family transcriptional regulator  21.65 
 
 		 287 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0717  RpiR family transcriptional regulator  21.65 
 
 		 287 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0821  RpiR family transcriptional regulator  21.65 
 
 		 287 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0750  RpiR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 281 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.414867  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3122  RpiR family transcriptional regulator  20.85 
 
 		 282 aa  51.6  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0917  putative transcriptional regulator, RpiR family  21.65 
 
 		 287 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.47337e-41 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3662  putative DNA-binding transcriptional regulator  22.87 
 
 		 282 aa  51.6  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0731  RpiR family transcriptional regulator  21.65 
 
 		 287 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29100  transcriptional regulator  24.6 
 
 		 290 aa  51.2  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1962  transcriptional regulator, RpiR family  24.69 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3048  putative DNA-binding transcriptional regulator  23.92 
 
 		 282 aa  50.8  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0712519  normal  0.0247781 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1590  RpiR family transcriptional regulator  22.33 
 
 		 266 aa  50.4  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000388341  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1050  transcriptional regulator, RpiR family  23.21 
 
 		 272 aa  49.7  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001002  transcriptional regulator RpiR family  21.34 
 
 		 283 aa  49.7  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1124  RpiR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 282 aa  49.3  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.673079  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1799  phosphosugar isomerase-like protein  29.91 
 
 		 322 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1297  RpiR family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 292 aa  49.7  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2771  RpiR family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 292 aa  49.7  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114132 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1406  RpiR family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 292 aa  49.7  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0283  transcriptional regulator, RpiR family  22.33 
 
 		 279 aa  48.9  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0898  HTH-type transcriptional regulator, rpiR family  23.53 
 
 		 292 aa  49.3  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.679683  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0972  transcriptional regulator, RpiR family  26.27 
 
 		 281 aa  48.9  0.00006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0731  RpiR family transcriptional regulator  21.13 
 
 		 287 aa  48.9  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0986  putative transcriptional regulator, RpiR family  21.13 
 
 		 287 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3018  RpiR family transcriptional regulator  21.9 
 
 		 256 aa  48.9  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.576007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4460  putative transcriptional regulator, RpiR family  21.13 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.857974 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0151  transcriptional regulator, RpiR family  25.6 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3388  RpiR family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 284 aa  48.1  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0652  RpiR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 281 aa  47  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal  0.0629992 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0668  RpiR family transcriptional regulator  21.65 
 
 		 287 aa  47  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3213  KpsF/GutQ family protein  31.62 
 
 		 331 aa  47  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1200  transcriptional regulator, RpiR family  21.97 
 
 		 304 aa  46.6  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6051  KpsF/GutQ family protein  27.87 
 
 		 333 aa  46.2  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0875  putative transcriptional regulator, RpiR family  20.62 
 
 		 287 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1282  sugar isomerase (SIS)  30.61 
 
 		 202 aa  45.8  0.0006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.418782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1524  transcriptional regulator  23.42 
 
 		 282 aa  45.8  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0672  transcriptional regulator, RpiR family  22.77 
 
 		 281 aa  45.8  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.654483  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl641  putative transcriptional regulator  24.31 
 
 		 271 aa  45.4  0.0007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3272  RpiR family transcriptional regulator  21.02 
 
 		 289 aa  45.4  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.854433  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0679  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  30.97 
 
 		 328 aa  45.4  0.0008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>