157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1962 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_1962  transcriptional regulator, RpiR family  100 
 
 		 248 aa  496  1e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2247  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 250 aa  121  9e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0147  transcriptional regulator  29.11 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905215 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3071  transcriptional regulator, RpiR family  27.39 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0179  RpiR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0182  RpiR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2433  transcriptional regulator, RpiR family  27.06 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000784459  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0070  RpiR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0521  RpiR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.207231  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0269  transcriptional regulator, RpiR family  22.42 
 
 		 304 aa  65.5  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.409833  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1541  RpiR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000907266  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1993  transcriptional regulator, RpiR family  24.88 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2136  transcriptional regulator, RpiR family  28.15 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000108566  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0283  transcriptional regulator, RpiR family  19.27 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0300  RpiR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2582  RpiR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0307  hypothetical protein  25.99 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1234  transcriptional regulator, RpiR family  24.43 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1243  transcriptional regulator  23.26 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.665754  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0588  RpiR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 273 aa  62  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.189062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2799  transcriptional regulator, RpiR family  24.43 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.576789  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2563  RpiR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2713  RpiR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3371  transcriptional regulator, RpiR family  22.42 
 
 		 281 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.00000000707391 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1252  RpiR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.102619 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3657  transcriptional regulator, RpiR family  24.32 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3662  putative DNA-binding transcriptional regulator  23.42 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2584  hypothetical protein  21.4 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0151  transcriptional regulator, RpiR family  24.06 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1590  RpiR family transcriptional regulator  21.6 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000388341  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001002  transcriptional regulator RpiR family  21.4 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1686  transcriptional regulator  25.76 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0801516  hitchhiker  0.000000000302216 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1200  transcriptional regulator, RpiR family  23.08 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3564  RpiR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.536409  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02327  predicted DNA-binding transcriptional regulator  23.53 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3036  RpiR family transcriptional regulator  19.92 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02288  hypothetical protein  23.53 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2604  RpiR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4108  transcriptional regulator, RpiR family  28 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2234  transcriptional regulator, RpiR family  21.98 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3018  RpiR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.576007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3841  transcriptional regulator, RpiR family  23.35 
 
 		 283 aa  57  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.412935  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2581  RpiR family transcriptional regulator  19.63 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  hitchhiker  0.000000255705 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1373  hypothetical protein  22.82 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3960  RpiR family transcriptional regulator  21.3 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162661  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1776  transcriptional regulator, RpiR family  23.7 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1901  RpiR family phosphosugar-binding transcriptional regulator  25.9 
 
 		 290 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0626  RpiR family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2619  RpiR family transcriptional regulator  18.18 
 
 		 286 aa  55.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0176  RpiR family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0659  RpiR family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.78991  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0580  RpiR family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658912  normal  0.89076 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3745  RpiR family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0554  RpiR family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.335525  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0178  RpiR family transcriptional regulator  21.48 
 
 		 291 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0183  helix-turn-helix protein RpiR  21.48 
 
 		 291 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1142  putative DNA-binding transcriptional regulator  22.27 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3618  putative DNA-binding transcriptional regulator  22.27 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1248  putative DNA-binding transcriptional regulator  22.27 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.964935  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0456  transcriptional regulator, RpiR family  24.69 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000284572  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2323  putative transcriptional regulator  21.78 
 
 		 315 aa  53.5  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1348  transcriptional regulator, RpiR family  21 
 
 		 307 aa  53.1  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.478547  normal  0.506779 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0479  sugar isomerase (SIS)  28.87 
 
 		 202 aa  53.1  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0225  transcriptional regulator  22.94 
 
 		 242 aa  52.8  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0168  RpiR family transcriptional regulator  22.6 
 
 		 280 aa  52.8  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.057217  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1080  RpiR family transcriptional regulator  20.67 
 
 		 318 aa  52.4  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0801962  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1223  RpiR family transcriptional regulator  21.81 
 
 		 339 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.809611  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3022  transcriptional regulator, RpiR family  21.47 
 
 		 262 aa  52.4  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0042  RpiR family phosphosugar-binding transcriptional regulator  23.6 
 
 		 267 aa  52.4  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2447  RpiR family transcriptional regulator  21.81 
 
 		 332 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3444  RpiR family transcriptional regulator  21.81 
 
 		 339 aa  52.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0365  RpiR family transcriptional regulator  21.81 
 
 		 332 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3409  RpiR family transcriptional regulator  21.81 
 
 		 332 aa  52.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.977628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3444  RpiR family transcriptional regulator  21.81 
 
 		 332 aa  52.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2634  RpiR family transcriptional regulator  21.81 
 
 		 332 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1050  transcriptional regulator, RpiR family  22.08 
 
 		 272 aa  52.4  0.000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4058  RpiR family transcriptional regulator  22.32 
 
 		 291 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.369796  normal  0.143797 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0467  transcriptional regulator  24.69 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00031412  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0475  transcriptional regulator, RpiR family  21.49 
 
 		 327 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5684  putative transcriptional regulator, RpiR family  17.29 
 
 		 299 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.474804 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0031  RpiR family phosphosugar-binding transcriptional regulator , putative  23.08 
 
 		 265 aa  50.4  0.00003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.89127  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1216  RpiR family transcriptional regulator  20.21 
 
 		 334 aa  50.1  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.3152  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1662  RpiR family transcriptional regulator  21.4 
 
 		 284 aa  50.4  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.574027  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2832  RpiR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 319 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.233384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0876  transcriptional regulator  24.69 
 
 		 251 aa  49.7  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0549202  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2724  RpiR family transcriptional regulator  21.81 
 
 		 282 aa  50.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2088  RpiR family transcriptional regulator  21.92 
 
 		 284 aa  48.9  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0949278  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2295  RpiR family transcriptional regulator  20 
 
 		 284 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.651664  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0338  transcriptional regulator, RpiR family  24.07 
 
 		 282 aa  48.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0593  RpiR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 280 aa  48.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590128  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3077  transcriptional regulator, RpiR family  20 
 
 		 284 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143664 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2006  RpiR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 237 aa  48.5  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0473713 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0607  RpiR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 280 aa  48.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.173614  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1970  RpiR family transcriptional regulator  19.57 
 
 		 299 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1528  transcriptional regulator, RpiR family  21.97 
 
 		 320 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1524  transcriptional regulator  21.66 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2822  RpiR family transcriptional regulator  21.57 
 
 		 290 aa  47  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1678  transcriptional regulator  21.72 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00566045  normal  0.0111544 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1297  RpiR family transcriptional regulator  21.82 
 
 		 292 aa  46.6  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1406  RpiR family transcriptional regulator  21.82 
 
 		 292 aa  46.6  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>