More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0300 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0307  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  545  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0300  RpiR family transcriptional regulator  100 
 
 		 266 aa  545  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0182  RpiR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0696  RpiR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000925251  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2433  transcriptional regulator, RpiR family  27.56 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000784459  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1993  transcriptional regulator, RpiR family  27.05 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1528  transcriptional regulator, RpiR family  30.36 
 
 		 320 aa  113  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1050  transcriptional regulator, RpiR family  25.71 
 
 		 272 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4022  transcriptional regulator, RpiR family  26.81 
 
 		 320 aa  112  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0204031  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0179  RpiR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 279 aa  112  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2771  RpiR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 292 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114132 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1406  RpiR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 292 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1297  RpiR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 292 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1686  transcriptional regulator  29.37 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0801516  hitchhiker  0.000000000302216 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0283  transcriptional regulator, RpiR family  27.85 
 
 		 279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1192  transcriptional regulator, RpiR family  26.82 
 
 		 293 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.497061  normal  0.760306 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1222  RpiR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 293 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.514843 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1202  RpiR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 293 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.658823 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1237  RpiR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 293 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.676137 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2323  putative transcriptional regulator  25.93 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0250  DNA-binding transcriptional repressor RpiR  28.57 
 
 		 287 aa  106  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2756  transcriptional regulator, RpiR family  26.15 
 
 		 298 aa  106  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1662  RpiR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 284 aa  106  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.574027  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2295  RpiR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 284 aa  106  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.651664  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2234  transcriptional regulator, RpiR family  27.46 
 
 		 244 aa  105  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0521  RpiR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 283 aa  104  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.207231  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2246  transcriptional regulator, RpiR family  28.45 
 
 		 284 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0898  HTH-type transcriptional regulator, rpiR family  26.72 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.679683  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2088  RpiR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0949278  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3077  transcriptional regulator, RpiR family  28.45 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143664 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7367  DNA-binding transcriptional repressor RpiR  27.31 
 
 		 291 aa  102  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276033  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1080  RpiR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 318 aa  102  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0801962  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0475  transcriptional regulator, RpiR family  24.46 
 
 		 327 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1044  RpiR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 338 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408154  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5684  putative transcriptional regulator, RpiR family  25 
 
 		 299 aa  99.8  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.474804 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3960  RpiR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 304 aa  99  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162661  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0550  RpiR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 287 aa  97.1  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1547  RpiR family transcriptional regulator  26 
 
 		 296 aa  97.1  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1776  transcriptional regulator, RpiR family  25.31 
 
 		 281 aa  96.7  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1373  hypothetical protein  23.89 
 
 		 278 aa  95.9  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35980  transcriptional regulator, RpiR family  25.2 
 
 		 333 aa  95.5  9e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.309329  normal  0.261129 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1544  transcriptional regulator, RpiR family  27.41 
 
 		 279 aa  94.7  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1799  RpiR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 309 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0151884  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3662  putative DNA-binding transcriptional regulator  22.39 
 
 		 282 aa  94.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3036  RpiR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2753  transcriptional regulator, RpiR family  29.44 
 
 		 304 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2136  transcriptional regulator, RpiR family  25.69 
 
 		 284 aa  94.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000108566  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1355  transcriptional regulator  26.53 
 
 		 273 aa  94.4  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.906845  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4899  RpiR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 287 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0183  helix-turn-helix protein RpiR  27.17 
 
 		 291 aa  93.2  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0178  RpiR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 291 aa  93.2  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3232  transcriptional regulator  22.32 
 
 		 274 aa  92.8  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0360083  normal  0.0600235 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3564  RpiR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 284 aa  92.4  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.536409  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0269  transcriptional regulator, RpiR family  23.66 
 
 		 304 aa  92.4  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.409833  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0588  RpiR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 273 aa  92  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.189062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1468  transcriptional regulator, RpiR family  25.81 
 
 		 286 aa  92  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000610661  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3209  RpiR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 320 aa  90.9  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3122  RpiR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 282 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3371  transcriptional regulator, RpiR family  22.96 
 
 		 281 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.00000000707391 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0731  RpiR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 287 aa  89.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2822  RpiR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 290 aa  89.7  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0744  RpiR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 305 aa  89.7  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.33357  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0695  RpiR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 305 aa  89.7  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.674181  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1541  RpiR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 266 aa  89.4  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000907266  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4018  RpiR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 284 aa  89  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.772645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1590  RpiR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 266 aa  88.6  9e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000388341  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0894  transcriptional regulator  24.7 
 
 		 289 aa  88.6  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0912  RpiR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 287 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1162  RpiR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 270 aa  88.6  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.164823  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0717  RpiR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 287 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0168  RpiR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 280 aa  88.2  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.057217  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06356  glucokinase  27.73 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3507  transcriptional regulator, RpiR family  24.21 
 
 		 342 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0619346 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0782  RpiR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0821  RpiR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4485  RpiR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0917  putative transcriptional regulator, RpiR family  25.58 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.47337e-41 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2853  transcriptional regulator, RpiR family  26.59 
 
 		 316 aa  86.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.543302 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4460  putative transcriptional regulator, RpiR family  25.19 
 
 		 287 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.857974 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02030  transcriptional regulatory protein HexR  23.72 
 
 		 288 aa  86.7  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0986  putative transcriptional regulator, RpiR family  25.58 
 
 		 287 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0731  RpiR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 287 aa  86.3  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4021  RpiR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 306 aa  86.3  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766323  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2047  RpiR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 176 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.573042  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4771  putative RpiR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 301 aa  85.9  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.978774  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0941  RpiR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 281 aa  85.5  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0472093  normal  0.387072 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0092  RpiR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 287 aa  85.5  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03961  DNA-binding transcriptional repressor  21.92 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001002  transcriptional regulator RpiR family  23.01 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1970  RpiR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2581  RpiR family transcriptional regulator  21.94 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  hitchhiker  0.000000255705 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03921  hypothetical protein  21.92 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0875  putative transcriptional regulator, RpiR family  25.19 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3657  transcriptional regulator, RpiR family  22.51 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5258  RpiR family transcriptional regulator  22.35 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.658899 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4516  transcriptional regulator, RpiR family  22.55 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.937314 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2950  putative DNA-binding transcriptional regulator  23.38 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2582  RpiR family transcriptional regulator  22.47 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0423  RpiR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2775  putative DNA-binding transcriptional regulator  23.38 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>