More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0800 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0800  sugar phosphate isomerase  100 
 
 
320 aa  640    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1331  sugar phosphate isomerase  63.49 
 
 
317 aa  402  1e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.661187  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  44.55 
 
 
315 aa  251  1e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0503  KpsF/GutQ family protein  43.41 
 
 
311 aa  245  6e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0678  KpsF/GutQ family protein  42.31 
 
 
325 aa  245  8e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.732488  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3344  KpsF/GutQ family protein  42.31 
 
 
325 aa  245  8e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0677  KpsF/GutQ family protein  41.99 
 
 
325 aa  243  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.953587  normal  0.0677039 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3956  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  41.03 
 
 
325 aa  241  9e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0720  KpsF/GutQ family protein  42.61 
 
 
325 aa  241  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.500239  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  41.64 
 
 
321 aa  240  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  41.82 
 
 
322 aa  239  4e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  41.51 
 
 
322 aa  238  9e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  41.14 
 
 
331 aa  238  1e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  40.06 
 
 
323 aa  238  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  40.31 
 
 
321 aa  237  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  41.35 
 
 
333 aa  237  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3633  D-arabinose 5-phosphate isomerase  39.75 
 
 
328 aa  236  3e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  39.43 
 
 
323 aa  236  4e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3810  D-arabinose 5-phosphate isomerase  38.05 
 
 
328 aa  235  9e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3663  KpsF/GutQ family protein  39.74 
 
 
325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000627199  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0691  KpsF/GutQ family protein  39.74 
 
 
325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.983087  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1778  arabinose-5-phosphate isomerase  42.04 
 
 
315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.458122  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0721  KpsF/GutQ family protein  39.74 
 
 
325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6257  KpsF/GutQ family protein  42.81 
 
 
311 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5735  D-arabinose 5-phosphate isomerase  41.99 
 
 
320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0712  KpsF/GutQ family protein  39.74 
 
 
325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0114298 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3652  D-arabinose 5-phosphate isomerase  38.68 
 
 
328 aa  233  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  40.06 
 
 
333 aa  233  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  39.38 
 
 
321 aa  233  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1437  arabinose-5-phosphate isomerase  41.72 
 
 
315 aa  231  8.000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.743757  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1617  arabinose-5-phosphate isomerase  41.08 
 
 
315 aa  231  1e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.567393  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0282  KpsF/GutQ family protein  42.95 
 
 
321 aa  231  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0446  D-arabinose 5-phosphate isomerase  38.51 
 
 
328 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03062  D-arabinose 5-phosphate isomerase  39.12 
 
 
328 aa  230  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00212199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  39.12 
 
 
328 aa  230  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  39.12 
 
 
328 aa  231  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  39.12 
 
 
328 aa  230  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03013  hypothetical protein  39.12 
 
 
328 aa  230  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  39.12 
 
 
328 aa  230  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.183909 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3685  D-arabinose 5-phosphate isomerase  39.12 
 
 
328 aa  230  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  39.12 
 
 
328 aa  230  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  39.12 
 
 
328 aa  230  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1148  D-arabinose 5-phosphate isomerase  38.51 
 
 
342 aa  230  3e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5294  KpsF/GutQ family protein  39.94 
 
 
332 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  38.51 
 
 
357 aa  230  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3910  KpsF/GutQ family protein  41.23 
 
 
310 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  40.13 
 
 
321 aa  229  5e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  39.1 
 
 
339 aa  228  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  37.01 
 
 
320 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  37.01 
 
 
320 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1393  KpsF/GutQ family protein  40.26 
 
 
310 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3611  KpsF/GutQ family protein  40.06 
 
 
325 aa  228  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3674  D-arabinose 5-phosphate isomerase  37.85 
 
 
328 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  0.0549633 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0494  KpsF/GutQ family protein  38.36 
 
 
325 aa  228  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0102894  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3576  D-arabinose 5-phosphate isomerase  37.85 
 
 
328 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3612  D-arabinose 5-phosphate isomerase  37.85 
 
 
328 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.164557 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3507  D-arabinose 5-phosphate isomerase  37.85 
 
 
328 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  38.49 
 
 
324 aa  226  3e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  38.49 
 
 
324 aa  226  4e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  39.62 
 
 
323 aa  226  4e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3505  D-arabinose 5-phosphate isomerase  37.54 
 
 
328 aa  225  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  39.25 
 
 
323 aa  226  6e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3306  KpsF/GutQ family protein  39.81 
 
 
325 aa  225  7e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.57065 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0286  D-arabinose 5-phosphate isomerase  38.05 
 
 
345 aa  225  7e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  38.41 
 
 
324 aa  225  7e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0182  KpsF/GutQ family protein  39.94 
 
 
330 aa  225  9e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4235  KpsF/GutQ family protein  38.85 
 
 
325 aa  225  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000366362 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0279  D-arabinose 5-phosphate isomerase  38.36 
 
 
363 aa  224  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.954706  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1806  KpsF/GutQ family protein  40.19 
 
 
317 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.172857 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2171  KpsF/GutQ family protein  39.31 
 
 
322 aa  223  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0918  polysialic acid capsule expression protein, KpsF/GutQ family protein  40.13 
 
 
321 aa  224  2e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3083  arabinose-5-phosphate isomerase  40.06 
 
 
325 aa  224  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0731  arabinose-5-phosphate isomerase  38.22 
 
 
325 aa  223  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  40.38 
 
 
329 aa  223  3e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  38.24 
 
 
320 aa  223  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  37.46 
 
 
324 aa  223  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  38.61 
 
 
326 aa  223  4e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  38.98 
 
 
345 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  38.98 
 
 
345 aa  222  6e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  38.17 
 
 
326 aa  222  8e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  37.46 
 
 
344 aa  222  8e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7389  KpsF/GutQ  42.07 
 
 
310 aa  221  9e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  38.56 
 
 
325 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4362  D-arabinose 5-phosphate isomerase  38.12 
 
 
328 aa  221  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.315495  normal  0.179965 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  37.85 
 
 
324 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0617  KpsF/GutQ family protein  40.07 
 
 
319 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.851934  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  37.7 
 
 
333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0879  KpsF/GutQ family protein  38.78 
 
 
329 aa  220  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00879092  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  37.85 
 
 
326 aa  219  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0322  KpsF/GutQ family protein  37.13 
 
 
340 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3372  KpsF/GutQ family protein  37.74 
 
 
325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.600625  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  38.8 
 
 
321 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2104  hypothetical protein  38.68 
 
 
326 aa  219  5e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3219  polysialic acid capsule expression protein KpsF  40.56 
 
 
339 aa  219  6e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0213  KpsF/GutQ  40.06 
 
 
320 aa  219  7e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0294  arabinose-5-phosphate isomerase  38.91 
 
 
318 aa  219  7e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02814  conserved hypothetical protein  40.56 
 
 
339 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000939788  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1811  KpsF/GutQ family protein  40 
 
 
319 aa  218  1e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02764  hypothetical protein  40.56 
 
 
339 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000908304  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2225  KpsF/GutQ family protein  38.41 
 
 
341 aa  217  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>