More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6257 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6257  KpsF/GutQ family protein  100 
 
 
311 aa  636    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3262  arabinose-5-phosphate isomerase  65.27 
 
 
351 aa  424  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3249  KpsF/GutQ family sugar isomerase  65.27 
 
 
311 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.212815  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3211  KpsF/GutQ family sugar isomerase  65.27 
 
 
311 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7389  KpsF/GutQ  66.56 
 
 
310 aa  420  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1362  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  63.99 
 
 
333 aa  419  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5916  KpsF/GutQ family protein  65.58 
 
 
310 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0826034  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6185  KpsF/GutQ family protein  66.67 
 
 
291 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0503  KpsF/GutQ family protein  55.88 
 
 
311 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0294  arabinose-5-phosphate isomerase  50.48 
 
 
318 aa  323  3e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1617  arabinose-5-phosphate isomerase  50 
 
 
315 aa  305  5.0000000000000004e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.567393  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1437  arabinose-5-phosphate isomerase  50 
 
 
315 aa  305  8.000000000000001e-82  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.743757  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1778  arabinose-5-phosphate isomerase  50 
 
 
315 aa  304  1.0000000000000001e-81  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.458122  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5735  D-arabinose 5-phosphate isomerase  51.46 
 
 
320 aa  295  7e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  51.78 
 
 
321 aa  293  3e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0918  polysialic acid capsule expression protein, KpsF/GutQ family protein  46.41 
 
 
321 aa  290  3e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3810  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.51 
 
 
328 aa  288  9e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1123  KpsF/GutQ family protein  47.56 
 
 
342 aa  282  6.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  47.25 
 
 
331 aa  280  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0279  D-arabinose 5-phosphate isomerase  48.86 
 
 
363 aa  279  5e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.954706  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  51.12 
 
 
326 aa  278  6e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0286  D-arabinose 5-phosphate isomerase  48.53 
 
 
345 aa  278  9e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1148  D-arabinose 5-phosphate isomerase  48.86 
 
 
342 aa  278  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  50.17 
 
 
321 aa  278  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  48.86 
 
 
357 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0446  D-arabinose 5-phosphate isomerase  48.86 
 
 
328 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2104  hypothetical protein  48.41 
 
 
326 aa  277  2e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  49.67 
 
 
321 aa  275  5e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0617  KpsF/GutQ family protein  46.36 
 
 
319 aa  275  6e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.851934  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  50.83 
 
 
333 aa  275  8e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0282  KpsF/GutQ family protein  45.16 
 
 
321 aa  274  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001785  arabinose 5-phosphate isomerase  46.91 
 
 
329 aa  273  3e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4362  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.19 
 
 
328 aa  273  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.315495  normal  0.179965 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  50.82 
 
 
330 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  44.85 
 
 
315 aa  271  7e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  47.13 
 
 
323 aa  271  1e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  49.34 
 
 
333 aa  271  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4108  KpsF/GutQ family protein  48.85 
 
 
330 aa  268  8.999999999999999e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal  0.0965302 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  48 
 
 
324 aa  268  8.999999999999999e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  48.18 
 
 
321 aa  267  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  48 
 
 
324 aa  267  2e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0563  KpsF/GutQ family protein  46.6 
 
 
323 aa  267  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57393  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3910  KpsF/GutQ family protein  46.2 
 
 
310 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4898  KpsF/GutQ family protein  48.05 
 
 
335 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340772  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1393  KpsF/GutQ family protein  46.1 
 
 
310 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4237  KpsF/GutQ family protein  48.69 
 
 
333 aa  265  7e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  46.96 
 
 
323 aa  265  7e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  45.57 
 
 
323 aa  265  7e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  49.01 
 
 
339 aa  265  8e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03062  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.75 
 
 
328 aa  264  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00212199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  46.75 
 
 
328 aa  264  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03013  hypothetical protein  46.75 
 
 
328 aa  264  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.75 
 
 
328 aa  264  1e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.75 
 
 
328 aa  264  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3685  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.75 
 
 
328 aa  264  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.75 
 
 
328 aa  264  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.183909 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  48.68 
 
 
333 aa  265  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.75 
 
 
328 aa  264  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.75 
 
 
328 aa  264  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0401  KpsF/GutQ family protein  46.51 
 
 
326 aa  265  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3633  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.23 
 
 
328 aa  263  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6051  KpsF/GutQ family protein  48.68 
 
 
333 aa  264  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3507  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.73 
 
 
328 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3652  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.78 
 
 
328 aa  263  3e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  47 
 
 
326 aa  263  4e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  49.67 
 
 
325 aa  262  4.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0298  KpsF/GutQ family sugar isomerase  43.79 
 
 
322 aa  262  6e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  48.67 
 
 
326 aa  262  6e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1665  KpsF/GutQ family protein  42.99 
 
 
320 aa  262  6.999999999999999e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.309824  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3612  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.4 
 
 
328 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.164557 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3576  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.4 
 
 
328 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3674  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.4 
 
 
328 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  0.0549633 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3505  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.4 
 
 
328 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  47.65 
 
 
321 aa  260  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  48 
 
 
324 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  49.01 
 
 
322 aa  259  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0922  sugar isomerase  46.1 
 
 
330 aa  259  5.0000000000000005e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  44.07 
 
 
320 aa  258  8e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  44.07 
 
 
320 aa  258  8e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  48.68 
 
 
345 aa  258  1e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  48.68 
 
 
345 aa  258  1e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  44.73 
 
 
323 aa  257  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0879  KpsF/GutQ family protein  47.99 
 
 
329 aa  258  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00879092  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2063  KpsF/GutQ family protein  43.56 
 
 
321 aa  258  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.806095  normal  0.101433 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  49.01 
 
 
322 aa  257  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5294  KpsF/GutQ family protein  47.88 
 
 
332 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1492  KpsF/GutQ family protein  45.78 
 
 
330 aa  257  2e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.119105  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1811  KpsF/GutQ family protein  42.53 
 
 
319 aa  255  6e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1806  KpsF/GutQ family protein  46.43 
 
 
317 aa  255  7e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.172857 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  46.5 
 
 
324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4132  KpsF/GutQ family protein  50.17 
 
 
333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0822  KpsF/GutQ family protein  45.71 
 
 
332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  47.87 
 
 
329 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2225  KpsF/GutQ family protein  51.99 
 
 
341 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2171  KpsF/GutQ family protein  48.5 
 
 
322 aa  253  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0182  KpsF/GutQ family protein  48.21 
 
 
330 aa  253  4.0000000000000004e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0491  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  49.19 
 
 
327 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566737  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  46.82 
 
 
333 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3490  KpsF/GutQ family protein  50.17 
 
 
333 aa  252  6e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  47.16 
 
 
320 aa  252  7e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>