More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3319 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_3319  RpiR family transcriptional regulator  100 
 
 		 243 aa  502  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2499  RpiR family transcriptional regulator  69.75 
 
 		 244 aa  365  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2807  RpiR family transcriptional regulator  63.18 
 
 		 246 aa  341  7e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2730  RpiR family transcriptional regulator  63.18 
 
 		 246 aa  341  7e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.69775  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1477  RpiR family transcriptional regulator  63.18 
 
 		 246 aa  341  7e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.26952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2604  RpiR family transcriptional regulator  47.68 
 
 		 242 aa  240  1e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3311  transcriptional regulator, RpiR family  39.67 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0464  transcriptional regulator  35.54 
 
 		 248 aa  155  4e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.142049  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0876  transcriptional regulator  37.35 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0549202  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0225  transcriptional regulator  32.39 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0467  transcriptional regulator  30.25 
 
 		 242 aa  110  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00031412  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0283  transcriptional regulator, RpiR family  27.36 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3564  RpiR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.536409  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1541  RpiR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000907266  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1216  RpiR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 334 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.3152  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1394  transcriptional regulator, RpiR family  30.3 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0784467  normal  0.640102 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2724  RpiR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0176  RpiR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0626  RpiR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0659  RpiR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.78991  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0580  RpiR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 282 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658912  normal  0.89076 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0554  RpiR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 282 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.335525  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2234  transcriptional regulator, RpiR family  25.32 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3745  RpiR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 282 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1556  putative transcription regulation repressor HEXR transcription regulator protein  27.52 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3409  RpiR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.977628  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2447  RpiR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3444  RpiR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1223  RpiR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.809611  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2634  RpiR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2433  transcriptional regulator, RpiR family  27.49 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000784459  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1590  RpiR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000388341  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0365  RpiR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1050  transcriptional regulator, RpiR family  25.21 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3444  RpiR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2247  transcriptional regulator  32.21 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4864  transcriptional regulator, RpiR family  28.7 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403808 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3787  transcriptional regulator, RpiR family  28.7 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.925929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0456  transcriptional regulator, RpiR family  26.61 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000284572  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0179  RpiR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 279 aa  75.1  0.0000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1044  RpiR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 338 aa  74.7  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408154  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0182  RpiR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1686  transcriptional regulator  26.75 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0801516  hitchhiker  0.000000000302216 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1993  transcriptional regulator, RpiR family  25.71 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1080  RpiR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0801962  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1355  transcriptional regulator  25.32 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.906845  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0588  RpiR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.189062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3371  transcriptional regulator, RpiR family  30.7 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.00000000707391 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3960  RpiR family transcriptional regulator  25 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162661  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2747  RpiR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0592883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29100  transcriptional regulator  23.98 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2002  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 620 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3001  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 641 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3090  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 641 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0778  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 620 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2612  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 620 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.85018  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3055  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 641 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.570164  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1550  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 641 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2132  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 641 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1373  hypothetical protein  27.31 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3841  transcriptional regulator, RpiR family  26.64 
 
 		 283 aa  67  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.412935  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2468  RpiR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 296 aa  67  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1025  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 638 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.745776  normal  0.175715 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2832  RpiR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.233384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0151  transcriptional regulator, RpiR family  25.84 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.15102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0625  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 639 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0521  RpiR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 283 aa  67  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.207231  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4364  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.31 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.289688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2581  RpiR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  hitchhiker  0.000000255705 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2136  transcriptional regulator, RpiR family  26.76 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000108566  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1970  RpiR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3454  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 638 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454105  normal  0.179776 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4022  transcriptional regulator, RpiR family  26.61 
 
 		 320 aa  65.5  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0204031  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4108  transcriptional regulator, RpiR family  25.59 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2584  hypothetical protein  25.36 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0926  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 642 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.789642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3022  transcriptional regulator, RpiR family  31.1 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0782  RpiR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0731  RpiR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4068  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 642 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0150237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0821  RpiR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0731  RpiR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3036  RpiR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0875  putative transcriptional regulator, RpiR family  25.21 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0486  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 642 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2433  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 642 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1243  transcriptional regulator  24.28 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.665754  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0986  putative transcriptional regulator, RpiR family  25.21 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0917  putative transcriptional regulator, RpiR family  25.21 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.47337e-41 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0965  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 642 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899614  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0912  RpiR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2295  RpiR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.651664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0717  RpiR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0837  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 642 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0825  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 642 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125163  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1522  transcriptional regulator, RpiR family  25.63 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0181901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0070  RpiR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2753  transcriptional regulator, RpiR family  29.25 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4164  RpiR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.045816  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71780  RpiR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>