206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA3050 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA3044  SIS domain-containing protein  100 
 
 		 177 aa  353  1e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.128664  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3050  SIS domain-containing protein  100 
 
 		 177 aa  353  1e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2738  hexulose-6-phosphate synthase/SIS domain-containing protein  77.27 
 
 		 389 aa  291  3e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1653  hexulose-6-phosphate isomerase  55.06 
 
 		 181 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000157973  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0479  sugar isomerase (SIS)  41.08 
 
 		 202 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2737  sugar isomerase (SIS)  40.45 
 
 		 183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2813  sugar isomerase (SIS)  40.45 
 
 		 183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0993  hexulose-6-phosphate isomerase  43.27 
 
 		 200 aa  127  6e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.830093  normal  0.529844 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1507  sugar isomerase (SIS)  40.91 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3132  hexulose-6-phosphate isomerase  40.37 
 
 		 204 aa  123  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.212429  normal  0.445732 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0910  sugar isomerase (SIS)  41.82 
 
 		 190 aa  123  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.510158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2411  6-phospho 3-hexuloisomerase  40.61 
 
 		 199 aa  122  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1199  sugar isomerase (SIS)  41.98 
 
 		 191 aa  122  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.645191  normal  0.0117075 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3213  6-phospho 3-hexuloisomerase  38.46 
 
 		 187 aa  121  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0308  sugar isomerase (SIS)  39.52 
 
 		 206 aa  120  8e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0608  sugar isomerase (SIS)  37.71 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0594  sugar isomerase (SIS)  37.71 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0217  SIS domain-containing protein  38.64 
 
 		 182 aa  118  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1889  hexulose-6-phosphate isomerase  40.24 
 
 		 202 aa  118  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0706  sugar isomerase (SIS)  36.75 
 
 		 205 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0564626  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0638  sugar isomerase (SIS)  38.46 
 
 		 178 aa  115  3e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1850  6-phospho 3-hexuloisomerase  42.77 
 
 		 186 aa  114  8.999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3031  sugar isomerase (SIS)  37.71 
 
 		 194 aa  111  6e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1650  sugar isomerase (SIS)  39.39 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127624 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2930  6-phospho 3-hexuloisomerase  39.76 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000566835 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0236  hexulose-6-phosphate isomerase  36.65 
 
 		 209 aa  102  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.249011 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1163  sugar isomerase (SIS)  33.96 
 
 		 194 aa  102  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.105663  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3252  3-hexulose-6-phosphate isomerase  35.33 
 
 		 186 aa  101  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  0.405094 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0132  hexulose-6-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5672  6-phospho 3-hexuloisomerase  38.64 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.343688 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0808  hexulose-6-phosphate isomerase  34.57 
 
 		 202 aa  98.2  5e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0610  6-phospho 3-hexuloisomerase  38.12 
 
 		 202 aa  97.8  7e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1579  sugar isomerase (SIS)  39.88 
 
 		 202 aa  97.8  7e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.208067  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1130  6-phospho 3-hexuloisomerase  36.02 
 
 		 209 aa  95.5  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3709  hexulose-6-phosphate isomerase  40.22 
 
 		 200 aa  94.7  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0616  sugar isomerase (SIS)  32.09 
 
 		 201 aa  91.3  7e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271955  normal  0.764233 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3836  sugar isomerase (SIS)  36.31 
 
 		 188 aa  89.7  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.347937  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1367  hexulose-6-phosphate isomerase  32.57 
 
 		 185 aa  87  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0552  sugar isomerase  31.07 
 
 		 188 aa  85.5  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3056  sugar isomerase (SIS)  30.11 
 
 		 186 aa  80.9  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4594  3-hexulose-6-phosphate isomerase  34.09 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0185  sugar phosphate isomerase  28.92 
 
 		 397 aa  57  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3022  transcriptional regulator, RpiR family  37.04 
 
 		 262 aa  55.1  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3662  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.52 
 
 		 282 aa  54.7  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1846  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  28.28 
 
 		 612 aa  51.6  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000269055  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3122  RpiR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 282 aa  51.6  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1357  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  30.72 
 
 		 591 aa  51.6  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1355  transcriptional regulator  29.11 
 
 		 273 aa  51.2  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.906845  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2308  KpsF/GutQ family protein  28.32 
 
 		 333 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2584  hypothetical protein  31.75 
 
 		 282 aa  49.3  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4117  KpsF/GutQ  31.36 
 
 		 327 aa  48.5  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3105  KpsF/GutQ family protein  22.67 
 
 		 324 aa  48.5  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.345406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2808  KpsF/GutQ family protein  30.7 
 
 		 331 aa  48.5  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0360  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  33.65 
 
 		 609 aa  48.5  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2000  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  31.82 
 
 		 611 aa  48.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2734  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.58 
 
 		 282 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02327  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.04 
 
 		 285 aa  47  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4559  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  37.04 
 
 		 613 aa  47.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02288  hypothetical protein  33.04 
 
 		 285 aa  47  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7389  KpsF/GutQ  29.37 
 
 		 310 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1372  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  32.5 
 
 		 613 aa  47.4  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.742215  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2582  RpiR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 285 aa  47  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2815  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.58 
 
 		 282 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.901844 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2950  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.58 
 
 		 282 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0601  KpsF/GutQ family protein  30.51 
 
 		 327 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0442241 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2775  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.58 
 
 		 282 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2838  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.58 
 
 		 282 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1234  transcriptional regulator, RpiR family  31.68 
 
 		 285 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2799  transcriptional regulator, RpiR family  31.68 
 
 		 285 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.576789  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3102  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  30.56 
 
 		 327 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0770  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  30.56 
 
 		 327 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6116  KpsF/GutQ family sugar isomerase  31.36 
 
 		 327 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0335  KpsF/GutQ family protein  30.95 
 
 		 334 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00223142  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0491  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  30.56 
 
 		 327 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566737  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0151  transcriptional regulator, RpiR family  31.01 
 
 		 243 aa  46.2  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2172  KpsF/GutQ family protein  31.36 
 
 		 327 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2713  RpiR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 285 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2786  KpsF/GutQ family protein  31.36 
 
 		 327 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258492  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2797  KpsF/GutQ family protein  31.36 
 
 		 327 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.154837 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0071  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  30.56 
 
 		 327 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2563  RpiR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 285 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1519  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  30.56 
 
 		 327 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0586  KpsF/GutQ family sugar isomerase  30.56 
 
 		 327 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2947  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  30.56 
 
 		 327 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001002  transcriptional regulator RpiR family  29.38 
 
 		 283 aa  46.6  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1252  RpiR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 285 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.102619 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2234  transcriptional regulator, RpiR family  31.48 
 
 		 244 aa  45.8  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0503  KpsF/GutQ family protein  27.27 
 
 		 311 aa  45.8  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0182  RpiR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 279 aa  45.8  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0179  RpiR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 279 aa  45.8  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4108  transcriptional regulator, RpiR family  27.27 
 
 		 243 aa  46.2  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0602  KpsF/GutQ family sugar isomerase  30.56 
 
 		 327 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0800  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  37.14 
 
 		 606 aa  45.4  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00580446  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  22.67 
 
 		 315 aa  45.4  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0307  hypothetical protein  33.33 
 
 		 266 aa  45.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0777  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  37.14 
 
 		 606 aa  45.4  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000026316  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0300  RpiR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 266 aa  45.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2171  KpsF/GutQ family protein  26.63 
 
 		 322 aa  45.1  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1770  transcriptional regulator  27.56 
 
 		 283 aa  45.1  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000030583  hitchhiker  0.000572207 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1680  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  30.7 
 
 		 605 aa  45.1  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.989614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>